معلومة

فسفرة البروتين في السيتوبلازم. المقياس الزمني النموذجي؟

فسفرة البروتين في السيتوبلازم. المقياس الزمني النموذجي؟


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

هل يوجد معدل فسفرة بروتيني نموذجي في سيتوبلازم الخلية في ظل الظروف الفسيولوجية ، أو على الأقل الحد الأعلى؟

لنفترض أن البروتين $ A $ يتم فسفرته إلى $ A ^ * $ مع التفاعل من الدرجة الأولى

$ A إلى ^ k A ^ * $

حيث $ k $ هو معدل التفاعل ($ k $ unit هي $ rm الوقت ^ {- 1} $).

في الواقع ، يتضمن تفاعل الفسفرة عوامل متعددة (بروتين ، إنزيم ، ATP) وتفاعلات متعددة ، وبالتالي لا يمكن تعيينها بدقة على تفاعل من الدرجة الأولى. ومع ذلك ، يكون هذا منطقيًا إذا كنا مهتمين فقط بترتيب المقدار $ k $. وفقًا لرد الفعل من الدرجة الأولى ، يتم إعطاء تطور تركيز $ A $ من خلال $$ frac {d A} {dt} = - k A $$ وبالتالي فإن $ 1 / k $ هو النطاق الزمني الذي يختلف فيه $ A $ .

لذلك يمكن أيضًا صياغة سؤالي على النحو التالي: لنفترض أنه في وقت معين يبدأ البروتين السيتوبلازمي $ A $ في أن يتحول إلى $ A ^ * $. ما هو المقياس الزمني النموذجي الذي تصل فيه تركيزات $ A $ و $ A ^ * $ إلى قيم التوازن؟

من بين القليل من الأشياء التي قرأتها ، يبدو أنها من ترتيب الثواني أو الدقائق أو الساعات ، ويبدو أن 1 ثانية هي الحد الأعلى. أي مراجع؟


نظرة عامة على تعبير البروتين

يتم تصنيع البروتينات وتنظيمها حسب الحاجة الوظيفية في الخلية. يتم تخزين المخططات الخاصة بالبروتينات في الحمض النووي وفك تشفيرها عن طريق عمليات نسخ منظمة للغاية لإنتاج مرسال الحمض النووي الريبي (مرنا). ثم تُترجم الرسالة المشفرة بواسطة mRNA إلى بروتين. النسخ هو نقل المعلومات من DNA إلى mRNA ، والترجمة هي تخليق البروتين بناءً على تسلسل محدد بواسطة mRNA.

رسم تخطيطي بسيط للنسخ والترجمة. يصف هذا التدفق العام للمعلومات من تسلسل زوج قاعدة الحمض النووي (الجين) إلى تسلسل متعدد الببتيد الأحماض الأمينية (البروتين).

في بدائيات النوى ، تحدث عملية النسخ والترجمة في وقت واحد. تبدأ ترجمة الرنا المرسال حتى قبل أن يتم تصنيع نسخة كاملة من الرنا المرسال الناضج. يسمى هذا النسخ والترجمة المتزامنة للجين بالنسخ المقترن والترجمة. في حقيقيات النوى ، يتم فصل العمليات مكانيًا وتحدث بالتتابع مع حدوث النسخ في النواة والترجمة ، أو تخليق البروتين ، الذي يحدث في السيتوبلازم.

مقارنة النسخ والترجمة في بدائيات النوى مقابل حقيقيات النوى.

يوفر هذا الكتيب المكون من 118 صفحة معلومات شاملة حول تعبير البروتين وسيساعدك على اختيار نظام التعبير الصحيح وتقنيات التنقية لتطبيقك واحتياجاتك المحددة. احصل على النصائح والحيل عند بدء التجربة ، واعثر على إجابات للمشكلات اليومية المتعلقة بتعبير البروتين.

يحدث النسخ في ثلاث خطوات في كل من بدائيات النوى وحقيقيات النوى: البدء والاستطالة والإنهاء. يبدأ النسخ عندما يتم فك الحمض النووي مزدوج الشريطة للسماح بربط بوليميراز الحمض النووي الريبي. بمجرد بدء النسخ ، يتم تحرير بوليميراز الحمض النووي الريبي من الحمض النووي. يتم تنظيم النسخ على مستويات مختلفة بواسطة المنشطات والمثبطات وأيضًا عن طريق بنية الكروماتين في حقيقيات النوى. في بدائيات النوى ، لا يلزم إجراء تعديل خاص على mRNA وتبدأ ترجمة الرسالة حتى قبل اكتمال النسخ. ومع ذلك ، في حقيقيات النوى ، تتم معالجة الرنا المرسال بشكل أكبر لإزالة الإنترونات (الربط) ، إضافة غطاء في نهاية 5´ وأدينينات متعددة في نهاية mRNA 3´ لتوليد ذيل بولي أ. ثم يتم تصدير mRNA المعدل إلى السيتوبلازم حيث يتم ترجمته.

الترجمة أو تخليق البروتين هي عملية متعددة الخطوات تتطلب جزيئات كبيرة مثل الريبوسومات ونقل الحمض النووي الريبي (الحمض النووي الريبي) وعوامل الرنا المرسال والبروتين بالإضافة إلى الجزيئات الصغيرة مثل الأحماض الأمينية و ATP و GTP والعوامل المساعدة الأخرى. هناك عوامل بروتينية محددة لكل خطوة من خطوات الترجمة (انظر الجدول أدناه). العملية الكلية متشابهة في كل من بدائيات النوى وحقيقيات النوى ، على الرغم من وجود اختلافات معينة.

أثناء البدء ، تقوم الوحدة الفرعية الصغيرة للريبوسوم المرتبط بالبادئ t-RNA بمسح الحمض النووي الريبي الذي يبدأ في الخامس من أجل تحديد وربط كودون البدء (AUG). تنضم الوحدة الفرعية الكبيرة للريبوسوم إلى الوحدة الفرعية الريبوسومية الصغيرة لتوليد مجمع البدء في كودون البدء. تشارك عوامل البروتين وكذلك التسلسلات في mRNA في التعرف على كودون البدء وتشكيل مجمع البدء. أثناء الاستطالة ، ترتبط الحمض النووي الريبي بالأحماض الأمينية المحددة (المعروفة باسم شحن الحمض النووي الريبي) وتنقلها إلى الريبوسوم حيث يتم بلمرتها لتشكيل ببتيد. يعتمد تسلسل الأحماض الأمينية المضافة إلى الببتيد المتنامي على تسلسل الرنا المرسال للنسخة. أخيرًا ، يتم تحرير البولي ببتيد الناشئ في خطوة الإنهاء عندما يصل الريبوسوم إلى كود الإنهاء. في هذه المرحلة ، يتم تحرير الريبوسوم من الرنا المرسال ويكون جاهزًا لبدء جولة أخرى من الترجمة.


نظرة عامة على تعبير البروتين

يتم تصنيع البروتينات وتنظيمها حسب الحاجة الوظيفية في الخلية. يتم تخزين المخططات الخاصة بالبروتينات في الحمض النووي وفك تشفيرها عن طريق عمليات نسخ منظمة للغاية لإنتاج مرسال الحمض النووي الريبي (مرنا). ثم تُترجم الرسالة المشفرة بواسطة mRNA إلى بروتين. النسخ هو نقل المعلومات من DNA إلى mRNA ، والترجمة هي تخليق البروتين بناءً على تسلسل محدد بواسطة mRNA.

رسم تخطيطي بسيط للنسخ والترجمة. يصف هذا التدفق العام للمعلومات من تسلسل زوج قاعدة الحمض النووي (الجين) إلى تسلسل متعدد الببتيد الأحماض الأمينية (البروتين).

في بدائيات النوى ، تحدث عملية النسخ والترجمة في وقت واحد. تبدأ ترجمة الرنا المرسال حتى قبل أن يتم تصنيع نسخة كاملة من الرنا المرسال الناضج. يسمى هذا النسخ والترجمة المتزامنة للجين بالنسخ المقترن والترجمة. في حقيقيات النوى ، يتم فصل العمليات مكانيًا وتحدث بالتتابع مع حدوث النسخ في النواة والترجمة ، أو تخليق البروتين ، الذي يحدث في السيتوبلازم.

مقارنة النسخ والترجمة في بدائيات النوى مقابل حقيقيات النوى.

يوفر هذا الكتيب المكون من 118 صفحة معلومات شاملة حول تعبير البروتين وسيساعدك على اختيار نظام التعبير الصحيح وتقنيات التنقية لتطبيقك واحتياجاتك المحددة. احصل على النصائح والحيل عند بدء التجربة ، واعثر على إجابات للمشكلات اليومية المتعلقة بتعبير البروتين.

يحدث النسخ في ثلاث خطوات في كل من بدائيات النوى وحقيقيات النوى: البدء والاستطالة والإنهاء. يبدأ النسخ عندما يتم فك الحمض النووي مزدوج الشريطة للسماح بربط بوليميراز الحمض النووي الريبي. بمجرد بدء النسخ ، يتم تحرير بوليميراز الحمض النووي الريبي من الحمض النووي. يتم تنظيم النسخ على مستويات مختلفة بواسطة المنشطات والمثبطات وأيضًا عن طريق بنية الكروماتين في حقيقيات النوى. في بدائيات النوى ، لا يلزم إجراء تعديل خاص على mRNA وتبدأ ترجمة الرسالة حتى قبل اكتمال النسخ. ومع ذلك ، في حقيقيات النوى ، تتم معالجة الرنا المرسال بشكل أكبر لإزالة الإنترونات (الربط) ، إضافة غطاء في نهاية 5´ وأدينينات متعددة في نهاية mRNA 3´ لتوليد ذيل بولي أ. ثم يتم تصدير mRNA المعدل إلى السيتوبلازم حيث يتم ترجمته.

الترجمة أو تخليق البروتين هي عملية متعددة الخطوات تتطلب جزيئات كبيرة مثل الريبوسومات ونقل الحمض النووي الريبي (الحمض النووي الريبي) وعوامل الرنا المرسال والبروتين بالإضافة إلى الجزيئات الصغيرة مثل الأحماض الأمينية و ATP و GTP والعوامل المساعدة الأخرى. هناك عوامل بروتينية محددة لكل خطوة من خطوات الترجمة (انظر الجدول أدناه). العملية الكلية متشابهة في كل من بدائيات النوى وحقيقيات النوى ، على الرغم من وجود اختلافات معينة.

أثناء البدء ، تقوم الوحدة الفرعية الصغيرة للريبوسوم المرتبط بالبادئ t-RNA بمسح الحمض النووي الريبي الذي يبدأ في الخامس من أجل تحديد وربط كودون البدء (AUG). تنضم الوحدة الفرعية الكبيرة للريبوسوم إلى الوحدة الفرعية الريبوسومية الصغيرة لتوليد مجمع البدء في كودون البدء. تشارك عوامل البروتين وكذلك التسلسلات في mRNA في التعرف على كودون البدء وتشكيل مجمع البدء. أثناء الاستطالة ، ترتبط الحمض النووي الريبي بالأحماض الأمينية المحددة (المعروفة باسم شحن الحمض النووي الريبي) وتنقلها إلى الريبوسوم حيث يتم بلمرتها لتشكيل ببتيد. يعتمد تسلسل الأحماض الأمينية المضافة إلى الببتيد المتنامي على تسلسل الرنا المرسال للنسخة. أخيرًا ، يتم تحرير البولي ببتيد الناشئ في خطوة الإنهاء عندما يصل الريبوسوم إلى كود الإنهاء. في هذه المرحلة ، يتم تحرير الريبوسوم من الرنا المرسال ويكون جاهزًا لبدء جولة أخرى من الترجمة.


علم الأحياء الجلي في الخلية والصحة والأمراض التنموية في الطب الجلي

4.17.2.2.2.1 PTPζ / RPTPβ ومتغيره القابل للذوبان ، الفوسفاكان

تعتبر الفسفرة ونزع الفسفرة من البروتينات على بقايا التيروزين تفاعلات نموذجية تتحكم في نقل الإشارات في الخلايا. يشارك عدد من الكينازات والفوسفاتازات في تعديل مستوى فسفرة التيروزين لجزيئات الإشارة. PTPζ (بروتين التيروزين الفوسفاتيز ζ) / RPTPβ (بروتين من نوع المستقبل التيروزين الفوسفاتيز β) هو أحد هذه الفوسفاتازات ، ويتم التعبير عنه بشكل تفضيلي في الجهاز العصبي المركزي. يتكون 116117 PTPζ / RPTPβ من مجال كبير خارج الخلية ، ومجال عبر غشاء واحد ، ومجال حشوي مع مجالين تحفيزيين ترادفيين من الفوسفاتيز (الشكل 3). ينقسم المجال الخارجي إلى أربع مناطق فريدة من الناحية الهيكلية: NH2- المنطقة الطرفية ذات التماثل المذهل للإنزيم ، والأنهيدراز الكربوني ، ووحدة الفبرونيكتين من النوع الثالث ، ومنطقة المباعدة ، والمنطقة المتداخلة المكونة من 859 من الأحماض الأمينية. ينتج عن التضفير البديل لـ PTPζ / RPTPβ mRNA متغيرين من نوع المستقبل ، شكل طويل وشكل قصير يفتقر إلى المنطقة المتداخلة ، ومتغيرين إفرازيين يقابلان الأجزاء خارج الخلية بأكملها من هذين النوعين من المتغيرات من نوع المستقبل. 116-118 يبدو أن التعبير عن الأشكال الإسوية الفردية يتم تنظيمه بشكل مختلف أثناء نمو الدماغ. 119-122

الشكل 3. تمثيل تخطيطي لهياكل المجال لأربعة متغيرات لصق من phosphacan / RPTPβ. 130 كاليفورنيا ، أنهيدراز الكربونيك FN-III ، فبرونيكتين النوع الثالث.

يتحمل PTPζ / RPTPβ الطويل وشكله القابل للذوبان سلاسل جانبية CS على المناطق المتداخلة. 123-125 يسمى المتغير طويل الذوبان عادة الفوسفاكان ، وكذلك 6B4-البروتيوجليكان / DSD-1. 118،123،126،127 كل من الخلايا العصبية 86 والخلايا الدبقية 119،120 يمكن أن تنتج PTPζ / RPTPβ / phosphacan / 6B4- بروتيوجليكان في الثقافة. فى الموقع كشفت تجارب التهجين أن RPTPβ / الفوسفاكان قد تم التعبير عنه في الغالب بواسطة أسلاف الدبقية والخلايا النجمية الأكثر نضجًا في الجهاز العصبي المركزي ، 95119120 لكن تجارب استهداف الجينات باستخدام جين RPTPβ التي تم استبدالها بجين LacZ أظهرت أن الخلايا العصبية وكذلك الخلايا النجمية تعبر عن RPTPβ. 128 على الرغم من أن غالبية جزيئات RPTPβ / phosphacan تحمل حصريًا سلاسل جانبية CS ، إلا أن بعضها يحمل سلاسل جانبية CS و KS. 123129 بالإضافة إلى سلاسل GAG هذه ، يبدو أن الفوسفاكان قد تم تعديله باستخدام كربوهيدرات HNK-1 وكربوهيدرات Lewis-X / FORSE-1. 126،130،131


الاستنتاجات والمناقشات

في هذا البحث ، درسنا شبكة سلم تفاعل شبكة نقل الإشارات العامة التي تصمم الفسفرة متعددة المواقع والنقل النووي النووي. كما يحدث غالبًا للشبكات الحقيقية ، يُفترض أن تكون الإنزيمات وفيرة ، وبالتالي يتجول كل بروتين مؤشر بشكل مستقل من خلال حالاته المختلفة من الفسفرة والموقع في الحجرات. باستثناء خطوة الربط الأخيرة ، تكون الشبكة خطية بشكل فعال وبالتالي يمكن حلها تمامًا. تم تأكيد هذا الحل الدقيق باستخدام محاكاة مونت كارلو. حتى هذه الشبكة البسيطة تعرض العديد من الميزات العشوائية المثيرة للاهتمام. يعرض ذيلًا طويلًا لتوزيع الاحتمالات لوقت الإشارة وهناك معدل رد فعل أمامي مثالي يفضل إرسال الإشارات السريعة. يشير هذا المستوى الأمثل إلى أنه قد يكون هناك كميات مثالية من الإنزيمات لنقل الإشارات بكفاءة.

عندما لا تكون الإنزيمات المتاحة وفيرة ، فإن المشاة العشوائية على الشبكة تصبح مرتبطة ببعضها البعض لأنهم يجب أن يتشاركوا في الموارد المحدودة من الإنزيمات المتاحة. ثم تبدأ اللاخطية في لعب دور مهم خلال العملية ليس فقط في اكتساب الخطوة الأخيرة من الهدف النهائي. في هذه الحالة عندما يكون الإنزيم مرتبطًا ، ستحدث العديد من أحداث الفسفرة أو نزع الفسفرة قبل فك الارتباط ، على غرار الجانب التصنيعي للنسخ (29). سيكون من المثير للاهتمام دراسة مثل هذه السيناريوهات ودراسة آثار جزيئات إشارات المنبع المتذبذبة على الشبكة. ستساعدنا هذه على زيادة فهم الظواهر ومعايير التصميم الكمي لآليات نقل الإشارة الفعالة.


مقدمة

استجابة لتلف الحمض النووي في طور G2 ، يؤدي تنشيط سلسلة تلف الحمض النووي (ترنح توسع الشعيرات المتحور (ATM) / ترنح توسع الشعريات و Rad3 المرتبط بـ Rad3 (ATR) -Chk2 / 1-p53) إلى توقف دورة الخلية (Smits & Medema ، 2001 تايلور وستارك ، 2001). أثناء التعافي اللاحق من الاعتقال ، يجب إسكات سلسلة تلف الحمض النووي. بصفته منظمًا حاسمًا لدورة الخلية ، يلعب الكيناز 1 الشبيه بالبولو (Plk1) دورًا أساسيًا في استعادة نقاط تفتيش G2 (فان فوغت وآخرون، 2004) من خلال استهداف ركائز مختلفة: يعمل على إسكات مسار ATR-Chk1 من خلال التحلل الناجم عن الفسفرة لبروتين المحول Claspin ، كما يساهم بشكل مباشر في إلغاء تثبيط كيناز 1 المعتمد على السيكلين (Cdk1) / cyclin B من خلال تنظيم الفوسفاتيز Cdc25B و kinase Wee1 (van Vugt وآخرون، 2004 ماميلي وآخرون، 2006). كان البروتين الكابت للورم p53 مطلوبًا للحفاظ على توقف G2 بعد تلف الحمض النووي (Bunz وآخرون، 1998). ومع ذلك ، فإن كيفية تعطيل p53 أثناء استعادة نقطة تفتيش G2 غير معروفة.

في هذه الدراسة ، نحدد البروتين 1 (GTSE1) المعبر عنه بمرحلة S و G2 ، وهو منظم سلبي لـ p53 ، كهدف Plk1 أثناء عملية الاسترداد. يتم التعبير عن بروتين GTSE1 على وجه التحديد خلال مرحلتي G2 و S من دورة الخلية ، ويتم توطينه بشكل أساسي في السيتوبلازم ، ويبدو أنه مرتبط بالأنابيب الدقيقة (Utrera وآخرون، 1998 كولافين وآخرون، 2000). هذا البروتين قادر على تنظيم p53 عن طريق الانتقال إلى النواة ، وربطه بـ p53 ونقله إلى خارج النواة والحث على تدهوره (Monte وآخرون، 2003 ، 2004). في المرحلة اللاحقة من التوقف الناجم عن تلف الحمض النووي ، يبدأ GTSE1 في التراكم في النواة (Monte وآخرون، 2004) ، مما يشير إلى أنه قد يكون متورطًا في عملية استعادة نقاط التفتيش من خلال تقليل التنظيم لـ p53.


الفيزيولوجيا المرضية لالتهاب الدماغ والنخاع الحاد المنتشر

رافيندرا كومار جارج ،. نيراج كومار ، التصلب اللويحي ، 2016

بروتين تاو

بروتين تاو هو بروتين مرتبط بالأنابيب الدقيقة ، يتم التعبير عنه في الغالب في الخلايا العصبية ، ويرتبط ارتباطًا وثيقًا بالتشغيل السليم لشبكة الهيكل الخلوي من حيث تجميع الأنابيب الدقيقة (Binder ، Frankfurter ، amp Rebhun ، 1985). يعتبر بروتين تاو في السائل الدماغي النخاعي علامة بيولوجية مهمة للعديد من اضطرابات الجهاز العصبي المركزي حيث يُنظر إلى تلف محور عصبي. في دراسة أجريت على 25 طفلاً مصابًا بمرض التصلب العصبي المتعدد و 13 طفلاً يعانون من أمراض عصبية التهابية أخرى (بما في ذلك مريض واحد مصاب بمرض التصلب العصبي المتعدد) ، روستازي وآخرون. (2005) وجد مستوى مرتفعًا جدًا من بروتين تاو (3165 بيكوغرام / مل) في المريض المصاب بـ ADEM. كان هذا أول تقرير للكشف عن تاو في مريض من ADEM. في دراسة لاحقة ، تم تحليل تركيزات السائل الدماغي الشوكي من بروتين تاو في 27 مريضًا مصابًا بـ ADEM ووجدوا أنها أعلى بكثير من مجموعة التحكم. لوحظ أيضًا اختلاف كبير في تركيزات السائل الدماغي الشوكي لبروتين تاو في المرضى ذوي الدقة الجزئية (أعلى) عند مقارنتهم بالقرار الكامل (أقل) (Oka et al. ، 2014). تلقي هذه النتائج الضوء على جانب الضرر المحوري في ADEM والذي تم التعرف عليه جيدًا في مرضى التصلب المتعدد.

تمت دراسة علامة أخرى لضرر محور عصبي ، β بروتين طليعة أميلويد ، في المادة التي تم تشريح جثتها من أربعة مرضى مصابين بـ ADEM ولوحظ وجود تلف محوري كبير في العينات. تم اعتبار التورط المحوري الكبير في هذه الحالات كعامل تنبؤي ضعيف (Ghosh، DeLuca، & amp Esiri، 2004).


حكاية بروتين ليسين أسيتيل في السيتوبلازم

يظهر الآن تعديل قابل للانعكاس بعد الترجمة لللايسينات الداخلية في العديد من البروتينات الخلوية أو الفيروسية كجزء من عمليات الإشارات الحاسمة التي تتحكم في مجموعة متنوعة من الوظائف الخلوية التي تتجاوز الكروماتين والنسخ. تهدف هذه الورقة إلى توضيح دور أسيتيل اللايسين في قيادة السيتوبلازم وتنسيق الأحداث الرئيسية مثل ديناميات الهيكل الخلوي ، والاتجار داخل الخلايا ، واندماج الحويصلة ، والتمثيل الغذائي ، والاستجابة للضغط.

1 المقدمة

تبدأ قصة أسيتيل ليسين البروتين السيتوبلازمي لفترة طويلة بعد اكتشاف أستيل الهيستونات بعد الترجمة في الستينيات [1]. في الواقع فقط في عام 1985 تم وصف التوبولين على أنه أول بروتين سيتوبلازمي أسيتيل [2 ، 3]. منذ ذلك الحين تم العثور على العديد من البروتينات السيتوبلازمية الأخرى الأسيتيل. تصف الدراسة البروتينية العالمية الأولى على البروتينات المؤستلة 37 بروتينًا مُؤَسَّسًا في الجزء السيتوبلازمي لخلايا هيلا و 133 في ميتوكوندريا كبد الفأر [4]. في دراسة أخرى ، تم تحديد حوالي 250 بروتينًا أسيتيلًا ، يفترض أنها موضعية في السيتوبلازم ، [5].

يتم تحفيز أسيتيل ليسين (K) بواسطة ليسين أسيتيل ترانسفيراز (KAT) الذي كان يُسمى سابقًا هيستون أسيتيل ترانسفيراز (HAT) (للتسمية الجديدة انظر Allis et al. [6]) ، والذي ينقل مجموعة الأسيتيل من acetyl-CoA إلى epsilon-amino مجموعة من بقايا ليسين داخلي. يتم تحقيق رد الفعل العكسي بواسطة ديستيلاس ، والتي يمكن تقسيمها إلى عدة فئات. تعتمد إنزيمات الفئة I و IIa و IIb و IV على الزنك ، بينما يستخدم أفراد عائلة الفئة III (وتسمى أيضًا sirtuins) NAD

كعامل مساعد لتفاعل نزع الأسيتيل.

يشير العدد الكبير من البروتينات الأسيتيل الموجودة في السيتوبلازم إلى دور حاسم في تعديل ما بعد الترجمة في تنظيم الأحداث السيتوبلازمية. في هذه الورقة ، سنركز على أمثلة مختارة توضح دور الأسيتيل العكسي في السيتوبلازم وسنذكر بعض البروتينات ، التي تم تحديدها بواسطة الأساليب البروتينية على أنها أسيتيل ، عندما يمكن أن تكون مهمة في سياق العمليات الخلوية التي تمت مناقشتها. سنقدم أيضًا نظرة عامة على ما هو معروف عن التوطين السيتوبلازمي للإنزيمات المتورطة في أستلة ليسين (دي).

2. توطين السيتوبلازمي لـ KATs و HDACs

2.1. كات

تُعرف معظم ترانسفيرازات الأسيتيل المميزة على نطاق واسع بالأنزيمات النووية (انظر الجدول 1 للحصول على نظرة عامة). حتى Hat1 ، أول أسيتيل ترانسفيراز تم تحديده ، يتم توطينه في الغالب في النواة ، على الرغم من أنه تم وصفه بأنه نوع B acetyltransferase والذي يشير إلى دوره في السيتوبلازم حيث يقوم باستيل الهستونات المصنعة حديثًا [7-9]. في ظل بعض الظروف ، مثل في وقت مبكر أثناء التطور أو في أورام القولون والمستقيم ، يزداد الجزء السيتوبلازمي من Hat1 [10 ، 11]. بالإضافة إلى ذلك ، فقد تبين مؤخرًا أنه يتم التعبير عن شكلين مختلفين من الأشكال الإسوية لـ Hat1 في الخلايا الكيراتينية ، والتي تختلف في توطينها الخلوي [12].

على الرغم من أن الأسيتيل ترانسفيرازات تعتبر في الغالب نوويًا ، إلا أن عددًا متزايدًا من الدراسات تشير إلى نقلها النووي. على سبيل المثال ، يتم فسفرة PCAF و Gcn5 بعد إشارات مستقبلات عامل النمو ، مما يؤدي إلى انتقالهما إلى النواة [13]. لا يتم تنظيم التوطين الخلوي لـ PCAF عن طريق الفسفرة فقط.في الواقع ، يمكن لـ PCAF أن تكون بقايا ليسين الأسيتيل الأوتوماتيكي داخل إشارة التوطين النووي (NLS) ، ويؤدي نزع الأسيتيل عن بقايا الليسين هذه إلى تراكم السيتوبلازم لـ PCAF [14]. يتصرف CBP و p300 تقريبًا مثل Hat1 لأنه أثناء نضوج البويضات ، تم العثور عليهما أولاً في السيتوبلازم قبل استيرادهما إلى النواة [15]. علاوة على ذلك ، على غرار Hat1 ، يوجد p300 في السيتوبلازم في سرطان الثدي ولكن ليس في الغدة الثديية الطبيعية المجاورة [16]. تم العثور على كل من إشارات التوطين النووي والتصدير النووي في Tip60 ، وهو عضو في عائلة MYST من acetyltransferases. يمكن تجنيد Tip60 في غشاء البلازما بواسطة بروتين طليعة الأميلويد ، والذي يحفز عملية الفسفرة والانتقال اللاحق إلى النواة [17]. بالإضافة إلى ذلك ، يظهر Tip60 في متغيرين لصق. في حين أن الشكل الإسوي الأطول موجود أساسًا في النواة ، فإن الشكل الأقصر ، Tip60 بيتا (يسمى أيضًا PLIP) ، المفقود من exon 5 ، يقع في كل من السيتوبلازم والنواة ويتفاعل مع فوسفوليباز العصارة الخلوية A2 [18 ، 19]. يحتوي acetyltransferase ATF2 أيضًا على إشارات توطين وتصدير نووي وهو قادر على التنقل بين النواة والسيتوبلازم. يعد التغاير مع c-Jun في النواة ضروريًا للاحتفاظ بـ ATF2 في الحيز النووي [20].

الحقيقة الأكثر إثارة للدهشة هي أنه على الرغم من أن التوبولين كان أول بروتين أسيتيل موصوف في السيتوبلازم [2 ، 3] وأن نشاط توبيولين أسيتيل ترانسفيراز قد تم تنقيته وتمييزه في عام 1986 [21] ، كان على المجتمع العلمي الانتظار حتى عام 2009 لوضع اسم على إنزيم قادر على الأسيتيل α- التوبولين. في الواقع ، تم العثور على أسيتيل ترانسفيراز Elp3 ، وهي الوحدة الفرعية التحفيزية لمركب الاستطالة النسخية ، قادرة على أستيل التوبولين ، وهو أمر ضروري لنضج الخلايا العصبية القشرية [22]. تم تأكيد دور Elp3 باعتباره ناقل أسيتيل توبولين مهمًا لتطور الخلايا العصبية في شاشة تثبيط الجين RNAi لمنظمي α- أسيتيل التوبولين باستخدام الديدان الخيطية Caenorhabditis elegans [23]. إلى جانب دوره في أستلة التوبولين ، فقد تورط Elp3 في تنظيم العمليات الأخرى خارج النواة مثل إشارات الإجهاد ، وتعديل الحمض الريبي النووي النقال ، والإفراز الخلوي وديناميكيات الأكتين [24-28]. ومع ذلك ، فإن دراسة أجراها Esberg et al. ، تتساءل عن دور Elp3 باعتباره ناقل أسيتيل لأن التأثيرات المختلفة التي لوحظت في الخلايا الناقصة في Elp3 يمكن أن تُعزى إلى دورها في تعديلات الحمض النووي الريبي (tRNA) وبشكل أكثر تحديدًا إلى عدم تذبذب يوريدين المعدلة ليسين والجلوتامين الحمض الريبي النووي الريبي. [29 ، 30]. وصفت ورقة منشورة مؤخرًا Gcn5 على أنه أسيتيل ترانسفيراز آخر ، قادر على الأسيتيل α-التوبولين بعد تجنيده في الأنابيب الدقيقة عن طريق جزء بروتيني سيتوبلازم من myc [31]. الأهم من ذلك ، هناك ورقة بحثية حديثة أخرى تحدد Mec-17 ، وهو بروتين مرتبط بـ Gcn5 ، باعتباره أحد أهم إنزيم ناقلة الأسيتيل ألفا توبولين [32]. أخيرًا ، يشير تقريران إلى أن الإنزيمات التي لها نشاط N-acetyltransferase يمكنها أيضًا أسيتيل بقايا الليسين الداخلية والمساهمة في أستلة التوبولين [33 ، 34].

2.2. HDACs

بالمقارنة مع عائلات هات ، هناك المزيد من الأمثلة على ديستيلاسز الموجودة في السيتوبلازم (انظر الجدول 2 للحصول على قائمة HDACs). حتى أفراد عائلة النوع الأول من ديستيلازات ، والتي كانت تعتبر في الماضي بروتينات نووية بحتة ، يمكن العثور عليها في السيتوبلازم. على سبيل المثال ، HDAC1 هو إنزيم نووي يتم تصديره ، في ظل حالات مرضية ، عبر CRM1 إلى السيتوبلازم حيث يرتبط بمحركات كينيسين ، مما يعيق نقل البضائع [35]. تم العثور على HDAC3 ، وهو نوع آخر من أسيتيل الأسيتيل ، في النواة والسيتوبلازم ولديه كل من التصدير النووي وإشارات التوطين النووي [36]. يتم الاحتفاظ به في السيتوبلازم من خلال تفاعله مع IkappaBalpha [37] حتى تؤدي إشارات TNF-alpha إلى تدهور هذا الشريك الملزم [38]. علاوة على ذلك ، يمكن أن يرتبط HDAC3 بغشاء البلازما حيث يتم فسفرته بواسطة src وبالتالي زيادة نشاطه [39]. من المثير للدهشة ، على عكس أنزيمات الفئة الأولى الأخرى الأكثر ذكاءً ، أن HDAC8 موجود أساسًا في السيتوبلازم حيث يرتبط بالعضلات الملساء ألفا أكتين لتنظيم انقباض الخلية [40 ، 41].

من المعروف أن الصنف IIa نزع الأسيتيل (4 ، 5 ، 7 و 9) [42] يتنقل بين النواة والسيتوبلازم [43 ، 44]. HDAC7 هو العضو الوحيد في هذه العائلة الذي تم الإبلاغ عن وجوده أيضًا في الميتوكوندريا ، فهو يترك الميتوكوندريا والنواة لتتراكم في السيتوبلازم بعد بدء موت الخلايا المبرمج [45]. جميع أعضاء الفئة IIa لديهم إشارات توطين نووية ومواقع ربط للبروتينات من عائلة 14-3-3. تعتمد آلية تنظيمية مهمة على فسفرة مواقع الربط 14-3-3 هذه التي تحفز التفاعل مع بروتينات 14-3-3 والتراكم اللاحق في السيتوبلازم. يُعزى التراكم السيتوبلازمي إلى تصدير نووي يعتمد على CRM1 بوساطة 14-3-3 ، ولكن أظهر منشوران مؤخرًا أن الفسفرة يمكن أن تستهدف NLS وأن ديستيلازات يتم الاحتفاظ بها في السيتوبلازم بعد ربط 14-3-3 بـ NLS الفسفوري وتعطيل الاستيراد النووي [46 ، 47]. بصرف النظر عن حالة الفسفرة ، يتم تنظيم التصدير النووي لـ HDAC4 عن طريق أكسدة اثنين من بقايا السيستين مما يؤدي إلى جسر ثنائي كبريتيد داخل الجزيء ، والذي يمنع تقليله التصدير النووي [48]. HDAC7 هو مثال آخر على إنزيم من الفئة IIa ، والذي يمكن تصديره من النواة بشكل مستقل عن حالة الفسفرة و 14-3-3 الارتباط [49].

يعتبر انتقال النوعين الأول والثاني أ إلى السيتوبلازم في جميع الأمثلة المذكورة أعلاه (باستثناء HDAC8) بشكل عام آلية تنظيمية ، والتي تعمل على تقليل تأثيرها في النواة وحتى الآن لم يتم العثور على ركائز السيتوبلازم إلا لـ HDAC4 ( كما هو موضح أدناه).

أكثر أنواع نزع الأسيتيل السيتوبلازمية التي تمت دراستها على نطاق واسع هو إنزيم النوع IIb HDAC6 ، والذي يحتوي على العديد من الركائز السيتوبلازمية ، بما في ذلك التوبولين [50-52] ، والكورتيكتين [53] ، و Hsp90 [54-57] ، β-كاتينين [58] ، وبيروكسيريدوكسين [59]. على الرغم من أنها تحمل إشارات استيراد وتصدير نووية جوهرية ، إلا أن HDAC6 تتمركز بشكل حصري تقريبًا في السيتوبلازم [60 ، 61] ، حيث تكمن أفعالها في عمليات تنظيمية متعددة. تتمثل إحدى طرق تنظيم عملها في تغيير توطينها داخل السيتوبلازم. كما هو مذكور أدناه ، يتم نقل HDAC6 مع ​​Hsp90 و Rac1 إلى الكشكشة الغشائية بعد تحفيز PDGF حيث يؤثر على ديناميكيات الأكتين [62]. يمكن منع نزع التوبولين بواسطة HDAC6 بواسطة Cbl ، بسبب الارتباط التنافسي بـ β- التوبولين [63]. هناك طريقة أخرى تؤثر على نشاطها وهي الارتباط ببروتينات شريكة مختلفة إما بشكل مباشر أو غير مباشر. مثال على التفاعل غير المباشر الضروري لنشاط HDAC6 هو تكوين مركب ثلاثي يتكون من farnesyltransferase و HDAC6 والأنابيب الدقيقة. يؤدي تعطيل المركب بواسطة KO لوحدة ألفا الفرعية من farnesyltransferase أو عن طريق مثبط لهذا الإنزيم إلى تعزيز أستلة التوبولين [64]. يرتبط BBIP10 ، وهو بروتين أساسي لتكوين الأهداب الأولية ، بـ HDAC6 ويمنعه ، ولكن حتى الآن ليس من الواضح ما إذا كان هذا التفاعل مباشرًا أم لا [65]. مثال على التفاعل المباشر هو ارتباط Dia2 بأحد نطاقي نزع الأسيتيل في HDAC6 ، مما يؤدي إلى تنشيط HDAC6 في ناقضات العظم [66]. مثالان آخران هما بروتين tau المرتبط بالأنابيب الدقيقة وبلمرة التوبولين التي تعزز البروتين TPPP / p25 ، والتي يمكن أن ترتبط بـ HDAC6 وتثبط نشاطها مما يؤدي إلى زيادة لاحقة في أستلة الأنابيب الدقيقة [67-69]. Ilp45 (بروتين تم اكتشافه حديثًا) بالإضافة إلى CYLD ، وهو إنزيم مزيل للتشكيل ، يمكن أن يثبط HDAC6 عن طريق الارتباط المباشر بنطاقات ديستيلاز لـ HDAC6 ، والتي في حالة Ilp45 ستؤدي أيضًا إلى تدهور HDAC6 [70 ، 71]. الطريقة الثالثة لتنظيم نشاط HDAC6 هي تعديلها بعد الترجمة. لقد ثبت على سبيل المثال أن HDAC6 يتفاعل مع EGFR ويتم فسفرته بواسطة EGFR في Tyr570 بعد تنشيط المستقبل الناجم عن ligand [72]. هذا يقلل من نشاط HDAC6 الذي يؤدي إلى أستلة التوبولين وتسريع إيصال EGFR المتحلل إلى الجسيمات الحالة. على النقيض من Aurora A ، وهو سير / كيناز انقسامي ، فسفوريلات HDAC6 مما يؤدي إلى تنشيطه مما يؤدي إلى نزع التوبولين وامتصاص الأهداب الأولية في خلايا الشبكية البشرية [73]. في هذا السياق ، تجدر الإشارة إلى أن HDAC6 (بالإضافة إلى HDACs الأخرى) يمكن العثور عليها في مجمعات مع الفوسفاتازات وكلا الإنزيمات نشطة في ظل هذه الظروف [74]. يمكن أيضًا تقليل نشاط HDAC6 ، إلى جانب تنظيمه عن طريق الفسفرة ، عن طريق الأسيتيل بوساطة p300 [75]. بالإضافة إلى وظيفة نزع الأسيتيل ، فإن HDAC6 لديه مهام خلوية أخرى مهمة ، مثل نقل البضائع عن طريق الارتباط بمجمعات محركات dynein و kinesin ، أو الارتباط بالمونو والبوليوبيكويتين ، وهو أمر ضروري للتكوين الهائل وتحريض الالتهام الذاتي لمراقبة الجودة (QC- الالتهام الذاتي) (للمراجعة انظر [76 ، 77]).

يوجد HDAC10 ، وهو إنزيم آخر من الفئة IIb ، في السيتوبلازم والنواة ، وعلى عكس أفراد عائلة الفئة IIa ، لا يتم تصديره من خلال آلية نقل بوساطة CRM1 [78-81]. أخيرًا HDAC11 ، النوع الرابع الوحيد من ديستيلاز ، هو في الأساس إنزيم نووي ولكن يمكن العثور عليه في السيتوبلازم في الخلايا الكامنة المصابة بفيروس نقص المناعة البشرية [82 ، 83].

عائلة السرتوين أو الفئة الثالثة من ديستيلاز هي عائلة مميزة وظيفيًا لسببين. يعتمدون أولاً على العامل المساعد NAD + في نشاطهم ، وثانيًا لا يطلقون الأسيتات الحرة بعد التحلل المائي لمجموعة الأسيتيل بل ينقلونها إلى ADP-ribose. في الثدييات ، تم وصف سبع سرتوينات (Sirt1-7) [84]. فقط Sirt1 و Sirt2 و Sirt3 لديهم نشاط حقيقي لإزالة الأسيتيل ، وجميع الآخرين لديهم نشاط ADP-ribosyltransferase فقط. على الأقل ، اعتبرت هذه الحقيقة حتى لوحظ أن Sirt6 يمكن أن يزيل الأسيتيل ليسين 9 من هيستون H3 [85]. ومع ذلك ، لم يلاحظ أي توطين السيتوبلازم بالنسبة لـ Sirt6 ، لذلك سنركز فقط على Sirt1-3 [86].

يحتوي Sirt1 على كل من التوطين النووي وإشارة التصدير المعتمدة على CRM1 ، وفي معظم الخلايا ، يكون موجودًا في كل من النواة والسيتوبلازم [87]. عند تحريض التمايز العصبي ، يتم نقله بشكل عابر إلى النواة ولكن بالنسبة لنمو النوريت الناجم عن NGF ، يجب أن يكون موجودًا في السيتوبلازم [88 ، 89]. كما تمت مناقشته أدناه ، فإن Sirt1 له أدوار مهمة في السيتوبلازم المرتبط بالالتهام الذاتي وهجرة الخلايا عن طريق نزع الأسيتيل من الكورتاكتين [90 ، 91].

يكاد يكون Sirt2 مترجمًا فقط في السيتوبلازم بسبب آلية تصدير نشطة تعتمد على CRM1 [92]. وقد تم تضمينه في نزع التوبولين [93] ويبدو أنه يزيل الأسيتيل توبولين خاصة في ظل ظروف معينة ، على سبيل المثال أثناء الانقسام لتنظيم ديناميكيات الأنبوب الصغير [94] أو أثناء تمايز الخلايا الدبقية قليلة التغصن [95]. تم اقتراح أن تثبيط Sirt2 يمكن أن يقلل من سمية ألفا سينوكلين في مرض باركنسون ، ولكن لم يتم تحديد التفاعل الجزيئي [96 ، 97].

أخيرًا ، يُعرف Sirt3 باسم إنزيم الميتوكوندريا (للاطلاع على مراجعة تفصيلية ، انظر [84]) ، ولكن تم مؤخرًا وصف شكل طويل من Sirt3 المترجمة جزئيًا في السيتوبلازم [98].

أخيرًا ، من الجدير بالذكر أن عددًا قليلاً جدًا من البروتينات الأسيتيل السيتوبلازمية والنووية يتم استهدافها بواسطة كل من الصنف الأول / الثاني وكذلك الصنف الثالث ، ديستيلاسيس مثل الهستونات [99] ، توبولين [50-52 ، 93] ، Ku70 [98 ، 100] ، ص 53 [101 ، 102] ، وكورتاكتين [53 ، 91]. بالنسبة لمعظم هذه الأمثلة ، ليس من الواضح ما إذا كانت HDACs من فئات مختلفة تُظهر تفضيلًا لبقايا ليسين أسيتيل معينة في هذه البروتينات. في الواقع ، تبدأ تفضيلات عزر lysine acetylation في الظهور فقط. يبدو أن سياق التسلسل المحلي حول بقايا اللايسين الأسيتيل في البروتينات السيتوبلازمية مختلف عن سياق الهستونات ولكنه مشابه للبروتينات النووية الأخرى. علاوة على ذلك ، تختلف أشكال أسيتيل الميتوكوندريا عن مواقع الأسيتيل الموجودة في كل من الهيستونات والبروتينات النووية / السيتوبلازمية الأخرى [4 ، 5]. على الرغم من هذه التطورات ، لم يتم بعد تحديد تسلسل إجماع دقيق لخصوصية الركيزة لمختلف Kats أو HDACs.

3. الآثار الوظيفية لأسيتيل ليسين السيتوبلازمي

3.1. تنظيم الهيكل الخلوي

نظرًا لأن الهيكل الخلوي متورط في العديد من العمليات السيتوبلازمية ، سنبدأ بوصف ما هو معروف عن التأثير التنظيمي للأستلة على الأنواع الرئيسية الثلاثة لمكونات الهيكل الخلوي ، وهي خيوط الأكتين ، والأنابيب الدقيقة ، والخيوط الوسيطة (الأشكال 1 (أ) و 1 (ب)).


نظرة عامة تخطيطية لآليات السيتوبلازم التي ينظمها الأسيتيل. (أ) توطين أحداث أستلة داخل الخلية. يشار إلى البروتينات الفردية المستخلصة والهياكل الهيكلية الخلوية (ألياف إجهاد الأكتين والأكتين القشرية ، والأنابيب الدقيقة ، والخيوط الوسيطة) وكذلك العضيات (النواة ، والميتوكوندريا ، و ER ، و ERGIC ، و golgi) التي تحدث فيها أحداث الأستلة ونزع الأستلة. (ب) إشراك الأسيتيل العكسي في تنظيم العمليات السيتوبلازمية المختلفة ، بما في ذلك هجرة الخلايا بعد إعادة تشكيل الهيكل الخلوي ، ونقل البروتين الفردي وكذلك النقل الحويصلي ونقل البروتينات. (ج) تنظيم استجابة الإجهاد وأنظمة التنظيف السيتوبلازمية من خلال أحداث أستلة / نزع أسيتيل مختلفة.
3.1.1. خيوط الأكتين

يتبلمر الشكل الأحادي الكروي للأكتين (G-actin) لتشكيل حلزون مزدوج (خيطي أو F-actin) ، والذي يمكن بعد ذلك تجميعه في ألياف إجهاد. هناك ثلاثة أشكال إسوية رئيسية من الأكتين. يشكل بيتا وجاما أكتين ألياف الإجهاد مهمة لشكل الخلية وحركة الخلية. يشكل ألفا أكتين الألياف الدقيقة في الخلايا العضلية ، والتي تضمن مع الميوسين قوى الجر اللازمة ليس فقط لتقلص العضلات ولكن أيضًا للتدفق السيتوبلازمي في الخلايا غير العضلية. باستخدام الأساليب البروتينية ، فقد ثبت أن جميع الأشكال الإسوية الأكتينية الثلاثة يمكن أسيتيلها [4 ، 5] وقد يؤدي أستلة ليسين 61 في جاما أكتين إلى استقرار ألياف إجهاد الأكتين [4]. يتم تعديل ليس فقط الأكتين نفسه ولكن أيضًا العديد من البروتينات التنظيمية للهيكل الخلوي للأكتين عن طريق الأسيتيل. على سبيل المثال ، ست من أصل سبع وحدات فرعية من مركب Arp2 / 3 ، وهو أمر مهم لنواة الأكتين ، يتم أسيتيلها [5]. يرتبط الكورتاكتين بـ F-actin في قشرة الخلية ويمكنه تجنيد مركب Arp2 / 3 إلى الهيكل الخلوي الأكتين القشري عندما يتم تنشيطه عن طريق الفسفرة. لكن الفسفرة ليست التعديل التنظيمي الوحيد للكورتيكتين. لقد ثبت أن الكورتيكتين يمكن أسيتيله بواسطة p300 أو PCAF على تسعة بقايا ليسين مختلفة موجودة في مجال التكرار المركزي [53 ، 91]. عند الأسيتيل يتم تثبيط انتقاله إلى محيط الخلية وتقليل قدرته على الارتباط بالأكتين. هذا يؤدي إلى تناقص ديناميكيات الأكتين في محيط الخلية وبالتالي تغيير حركية الخلية. يتم التوسط في نزع الكورتاكتين عن طريق HDAC6 و Sirt1 (ربما أيضًا Sirt2) ، والتي قد تعمل بالتعاون للحث على هجرة الخلايا [53 ، 91]. في الواقع ، يعد الهيكل الخلوي للأكتين ضروريًا لهجرة الخلايا لأنه ضروري لتشكيل الكشكشة الغشائية أو lamellipodia و filopodia وألياف إجهاد الأكتين ، والتي تعكس الحالات الديناميكية المختلفة للهيكل الخلوي الأكتين. يتم تنظيم ديناميكيات الأكتين أيضًا بواسطة GTPases الصغيرة لعائلة Rho. مخطط عام مبسط يورط RhoA في تكوين ألياف الإجهاد ، Rac1 في lamellipodia و cdc42 في تكوين أرجل خيطية. يعتمد تنشيط بروتينات G هذه بدورها على عمل GDIs (مثبطات تفكك الناتج المحلي الإجمالي) و GAPs (بروتينات تنشيط GTPase) و GEFs (عوامل تبادل الناتج المحلي الإجمالي / GTP). لقد ثبت أن acetylation لـ RhoGDI alpha يمنع تأثيره المثبط على أفراد عائلة Rho مما يؤدي إلى تعزيز تكوين ألياف الإجهاد وتشكيل فلوبوديا [4]. يمكن أيضًا تثبيط RhoA بواسطة بروتين رابط E-cadherin p120 catenin. يغير أستيل p120 توطينه الخلوي وبالتالي يخفف من تأثيره المثبط على RhoA [4]. تنشيط Rac1 ، الذي يؤدي إلى تكوين الكشكشة الغشائية ، وكثرة الخلايا الكبيرة المرتبطة به ، وهجرة الخلايا ، يعتمد على نزع الأسيتيل للمرافق Hsp90 بواسطة HDAC6 ، لكن التسلسل الدقيق للأحداث لم يتم توضيحه [62].

يمكن أيضًا تنظيم تقلص العضلات عن طريق الأستلة كما لوحظ في نشاط خيوط الأكتوموسين في خلايا عضلة القلب. في الواقع ، فإن بروتين LIM العضلي (MLP) ، الذي يتجمع مع الخيوط العضلية في ض- قرص من الساركوميرات ، هو مستشعر تمدد ميكانيكي. Acetylation من MLP بواسطة PCAF يعزز حساسية الكالسيوم للخيوط العضلية. يبدو أن HDAC4 هو نزع الأسيتيل المسؤول عن نزع الأسيتيل MLP [103].

3.1.2. أنابيب مجهرية

كما ذكر سلفا، α-التوبولين ، والتي مع β- يشكل التوبولين اللبنة البنائية غير المتجانسة للأنابيب الدقيقة ، وكان أول بروتين سيتوبلازمي يوصف بأنه أسيتيل [2 ، 3]. α- يتم أسيتيل التوبولين على اللايسين 40 والذي كان يعتبر ، حتى وقت قريب ، بقايا ليسين الأسيتيل الوحيد في الأشكال الإسوية التيوبولين. ومن المثير للاهتمام ، في نهج التعرف البروتيني النظامي الأخير للبروتينات الأسيتيل ، ليسين 40 من α- لم يتم التعرف على التيوبولين. هذا على الأرجح يرجع إلى حقيقة أن خطوة الترسيب المناعي باستخدام جسم مضاد ليسين أسيتيل قد تم استخدامه في هذا النهج ، والذي من المحتمل أن يكون له ألفة منخفضة لهذه البقايا المعينة. ومع ذلك ، فإن العديد من بقايا ليسين الأسيتيل الأخرى في الأشكال الإسوية مختلفة من التوبولين (α إلى جانب β تم اكتشاف وحدات فرعية) ، ولكن لا يزال يتعين توضيح دورها وأهميتها [5]. حتى فهمنا للدور الوظيفي للأستلة في ليسين 40 من α- التوبولين غير واضح المعالم. قد يأتي سبب ذلك من حقيقة أن التعبير عن nonacetylatable α- لا ينتج عن التيوبولين أي نمط ظاهري واضح [104-106] ، كما لا ينتج عن فرط الأستلة بعد KO لـ HDAC6 [107]. بشكل عام ، تعتبر الأنابيب الدقيقة الأسيتيلية لتمثيل السكان من الأنابيب الدقيقة الأكثر استقرارًا في الخلية. ومع ذلك ، كان هناك نقاش طويل في الأدبيات حول ما إذا كان الأستلة هو سبب أو نتيجة لتثبيت الأنابيب الدقيقة. في حين تم اقتراح أن الأستلة تتراكم بمرور الوقت في الأنابيب الدقيقة ذات عمر نصف طويل [108] ، اقترح آخرون أن الأستلة يمكن أن تثبت الأنابيب الدقيقة مباشرة [50 ، 51]. ومع ذلك ، لا يؤدي فرط الأسيتيل في الخلايا العصبية إلى استقرار الأنابيب الدقيقة [109]. أيضًا ، في خلايا KO لـ tubulin deacetylase HDAC6 ، لا يترافق فرط الأسيتيل في الأنابيب الدقيقة مع إزالة التعرق ، وهي السمة المميزة الأخرى للأنابيب الدقيقة المستقرة [62]. وبالتالي فإننا نقترح فرضية بديلة لدور أستيل التوبولين. في الواقع ، الأنابيب الدقيقة الأسيتيل ليست وفيرة جدًا في معظم الخلايا المستزرعة في المختبر. ومع ذلك ، هناك بعض الاستثناءات. تحتوي ثلاثة أنواع من الخلايا على الأقل على أنابيب دقيقة شديدة الأستلة في السيتوبلازم ، وهي الخلايا العصبية والصفائح الدموية والخلايا الضخمة ، وهي أسلاف الصفائح الدموية. بالإضافة إلى ذلك ، هناك تراكيب خلوية تتكون من الأنابيب الدقيقة ، والتي يتم أسيتيلها أيضًا بشكل كبير مثل الأهداب الأولية ، والأسواط ، والمغازل الانقسامية والأجسام الوسطى. ما تشترك فيه كل هذه الهياكل وأنواع الخلايا هو الحاجة إلى حزم الأنابيب الدقيقة. وبالتالي ، قد يسمح الأستلة بتجميع أكثر كفاءة للأنابيب الدقيقة ، مما قد يؤدي بدوره إلى تعزيز استقرار حزم الأنابيب الدقيقة هذه. لدعم هذه الفرضية ، تم وصف العديد من الملاحظات في الأدبيات. نارانات وآخرون أظهرت أنه ، بعد 30 دقيقة من إصابة الخلايا بواسطة HHV-8 ، لوحظت زيادة عابرة في أسيتيل الأنابيب الدقيقة مصحوبة بتكثيف حزم الأنابيب الدقيقة.كلاهما ، الأسيتيل وكذلك سماكة الأنابيب الدقيقة ، يعودان إلى المستويات القاعدية بعد حوالي 2-3 ساعات من الإصابة [110]. وبالمثل ، يمكن لعامل الفوعة للالتهاب الرئوي بالمكورات العقدية أن يحفز استلة الأنابيب الدقيقة وتجميع الأنابيب الدقيقة المصاحبة [111]. كما أن الإفراط في التعبير عن calpain 6 ، وهو شكل إسوي كالبين غير نشط حفزيًا ، يحفز فرط الأستلة وتجميع الأنابيب الدقيقة [112]. مثال آخر هو بلمرة التوبولين التي تعزز البروتين TPPP / p25 ، والذي لا يحفز فقط بلمرة التوبولين ولكن أيضًا الأسيتيل والتجميع والتثبيت اللاحق للأنابيب الدقيقة [68]. يتم أيضًا تعزيز حزم الأنابيب الدقيقة بواسطة p180 ، وهو بروتين تقريبي مرتبط بـ ER ، بعد تحريض أستلة التوبولين [113]. بالإضافة إلى ذلك ، في وقت مبكر خلال الالتزام العصبوني ، يتم تكوين مجموعة مؤلفة من الأنابيب الدقيقة والتي يتم ترتيبها في حزمة من الأنابيب الدقيقة المتوازية [114].

إلى جانب مساهمته في تثبيت و / أو تجميع الأنابيب الدقيقة ، يلعب أستيل التوبولين دورًا مهمًا في أحداث النقل الخلوي كما هو موضح أدناه. وتجدر الإشارة هنا إلى وجود تفاعل منسق بين الهيكل الخلوي للأكتين والشبكة الأنبوبية الدقيقة التي يكون أحد منسقيها هو المستجيب RhoA Dia [115 ، 116] ، والذي يمكن أن يرتبط بالأنابيب الدقيقة ، وكما ذكرنا سابقًا ، يرتبط أيضًا بخيوط الأكتين . في الواقع ، لقد ثبت أن Dia تؤثر على اتجاه الأنابيب الدقيقة ، والاستقرار ، وحالات الأسيتيل. تصف بعض الدراسات التي أجريت حتى الآن أستلة الأنابيب الدقيقة المعززة بعد تنشيط RhoA و Dia [110 ، 117-119]. ومع ذلك ، من غير المعروف ما إذا كان الأسيتيل المحسن في هذه الحالات ناتجًا عن تثبيط HDAC6 المباشر بوساطة Dia أو إلى تنشيط ناقل توبولين أسيتيل. في دراسة أخرى باستخدام الخلايا الآكلة للعظم ، يؤدي تنشيط Dia إلى التأثير المعاكس ، وهو نزع الأسيتيل من الأنابيب الدقيقة بسبب تفاعل Dia مع HDAC6 والتفعيل المصاحب له. وبالتالي قد تكون نتيجة تنشيط Dia على أستلة / تثبيت الأنابيب الدقيقة تعتمد على نوع الخلية. يمكن إضافة المزيد من التعقيد إلى الضبط الدقيق لهذه الأحداث التنظيمية من خلال حقيقة أن الشكل الإسوي المرتبط بـ Dia يبدو أنه أسيتيل نفسه [5].

3.1.3. المتوسطة الشعيرات

على الأقل تم العثور على بعض مكونات الفئة الثالثة من عناصر الهيكل الخلوي ، الخيوط الوسيطة ، أستلة. أحد الأمثلة على ذلك هو الفيمنتين ، الذي يتم أسيتيله على العديد من بقايا ليسين [5] ، والآخر هو سيتوكراتين 8 ، والذي يتم أسيتيله على ثلاث بقايا ليسين. على عكس التوبولين والأكتين ، في هذه الحالة ، يبدو أن الأستلة تزعزع استقرار البوليمر [120 ، 121].

3.2 المواصلات

النقل الخلوي على طول مسارات الأنابيب الدقيقة مهم بشكل خاص في الخلايا ، التي لها امتدادات طويلة مثل المحاور والتشعبات للخلايا العصبية. قد يكون هذا هو السبب وراء ملاحظة الدور المهم لأستلة الأنابيب الدقيقة في نقل البضائع لأول مرة في الخلايا العصبية. يتورط محرك kinesin في الأنابيب الدقيقة في النقل المتقدم ، بينما تشارك محركات dynein في النقل الرجعي للمواد الخلوية (الشكل 1 (ب)). لقد ثبت أن ارتباط kinesin-1 والتنقل على الأنابيب الدقيقة يتم تعزيزه عن طريق أستلة التوبولين وبالتالي يتم تسريع توصيل Jip-1 (وهو بروتين حمولة من kinesin-1) إلى أطراف النوريت [122]. مثال آخر على النقل الأكثر كفاءة بوساطة كينيسين -1 على طول الأنابيب الدقيقة الأسيتيل هو النقل الحويصلي لعامل التغذية العصبية BDNF. في الخلايا العصبية لمرضى داء هنتنغتون ، لا يتم نقل BDNF وإفرازه بكفاءة بسبب توسع متعدد الجلوتامين في بروتين HT ، وهو غير قادر على تحفيز النقل المعتمد على الأنابيب الدقيقة. يمكن أن يساعد Hyperacetylation للأنابيب الدقيقة في إنقاذ هذا النقص. بالإضافة إلى ذلك ، أظهر المؤلفون أن كلا من كينيسين وكذلك النقل الميكروبيولوجي المعتمد على الداينين ​​يتم تعزيزه بواسطة أستلة التوبولين [109]. يتم أيضًا زيادة تنظيم الاتجار بالمستقبلات من خلال تعزيز سرعة نقل الجسيم الداخلي بواسطة أستيل الأنابيب الدقيقة [72 ، 123]. ومع ذلك ، لا تتأثر إعادة تدوير حويصلات EGFR في ظل هذه الظروف [123]. بشكل جماعي ، تشير هذه الملاحظات إلى أن نقل بروتينات الشحن الفردية ، وكذلك بعض عمليات النقل الحويصلي وليس كلها ، يتم تنظيمها بواسطة أستلة الأنابيب الدقيقة (الشكل 1 (ب)).

طورت الفيروسات استراتيجيات للاستفادة من آلات النقل الخلوي المضيفة للعدوى الفعالة. فيروس الهربس HHV-8 على سبيل المثال قادر على تعزيز أستلة الأنبوب الدقيق عن طريق تنشيط RhoA و Dia2 الخاص به ، والذي يسرع عملية توصيل DNA الفيروسي المعتمد على dynein إلى النواة [110]. يعمل الفيروس الغدي بطريقة مماثلة [119]. بدلاً من ذلك ، يثبط فيروس اللقاح RhoA ، ويؤدي بدوره إلى Dia2 مما يؤدي إلى تناقص أستلة التوبولين ولكنه يزيد من ديناميكيات التوبولين في محيط الخلية ، والذي في هذه الحالة يمكن أن يساعد في إطلاق الفيروس [117]. الغزو الفعال لخلايا المثانة بواسطة بكتيريا الإشريكية القولونية المسببة للأمراض البولية يتطلب أيضًا نزع الأسيتيل بوساطة HDAC6 من الأنابيب الدقيقة [124].

في سياق آليات النقل الخلوي ، من الجدير بالذكر أنه تم تحديد العديد من البروتينات الحركية على أنها أسيتيل وسيتعين على الدراسات المستقبلية تحديد ما إذا كان تنظيم النقل المنسوب إلى أستلة الأنابيب الدقيقة قد تأثر أيضًا باستلة البروتين الحركي [5].

3.3 الترجمة ومراقبة الجودة والتنظيف السيتوبلازمي

تمت دراسة الأسيتيل على نطاق واسع لدوره في تنظيم النسخ في النواة ، ومن المدهش تقريبًا ، على حد علمنا ، أنه لم يتم وصف أي ملاحظة على التنظيم الترجمي بواسطة الأسيتيل حتى الآن. من الجدير بالذكر ، مع ذلك ، أنه في الدراسات البروتينية العالمية ، تم العثور على عدد كبير من عوامل بدء الترجمة أو البروتينات الريبوزومية مؤستلة [4 ، 5]. وبالتالي لا يزال يتعين اكتشاف دور محتمل للأسيتيل في آليات التحكم الترجمي. لا يتم التحكم في كمية البروتينات المعبر عنها فقط على مستويات النسخ والترجمة ولكن أيضًا من خلال تنظيم نصف عمرها. يستخدم الأسيتيل على نطاق واسع للتأثير على استقرار البروتين في كلا الاتجاهين ، ولكن بما أن هذا الموضوع قد تمت مراجعته مؤخرًا [125] ، فلن تتم مناقشته هنا.

إلى جانب التحكم في الكمية ، تم تجهيز الخلية أيضًا بأنظمة مراقبة الجودة والتنظيف للبروتينات الخلوية لتجنب تراكم البروتينات المجمعة الخاطئة في السيتوبلازم ، والتي سيكون لها تأثير ضار على الوظائف الخلوية العادية المنسقة (الشكل 1 (ج)). بعد الترجمة ، يجب مساعدة العديد من البروتينات المركبة حديثًا من أجل طيها أو تجميعها بشكل صحيح في مجمعات متعددة الوحدات. يتم ضمان هذا من قبل المرافقين. تشارك Chaperones أيضًا في إدارة البروتينات غير المطوية التي تنشأ بعد ظروف الإجهاد البيئي المختلفة مثل الصدمة الحرارية ، الإجهاد التأكسدي والشيخوخة ، أو التعبير المرضي للبروتينات بسبب الطفرات أو الإفراط في التعبير. في حالة الإدارة غير الناجحة من قبل المرافقين ، تنتشر البروتينات الخاطئة في كل مكان وتتحلل بواسطة البروتيازوم. بعد فترة إجهاد مطولة أو طويلة أو تحت الإفراط التجريبي في التعبير عن البروتينات ، لا يستطيع مسار chaperone / proteasome التعامل بعد الآن مع العيوب التوافقية الهائلة للبروتينات ، التي تتراكم وتتجمع في السيتوبلازم. يؤدي هذا إلى استجابة أكثر عالمية للضغط ، مما يؤدي إلى تكوين حبيبات الإجهاد والتشكيل الهائل وتحريض الالتهام الذاتي لمراقبة الجودة. تم وصف الدور المهم لـ HDAC6 في جميع آليات الدفاع الخلوي المختلفة هذه بشكل جيد (للمراجعة ، انظر [76 ، 77]) ولن تتم مناقشتها بالتفصيل في هذه الورقة. سوف نؤكد بالأحرى على الأهمية الحاسمة لبعض بقايا ليسين الأسيتيل داخل الجهات الفاعلة الرئيسية الأخرى المشاركة في هذه العمليات.

3.3.1. مرافقة / بروتيسوم

تُعرف المرافقون بالبروتينات التي تساعد في تكوين الجسيمات النووية. ومع ذلك ، هناك أيضًا العديد من المرافقين المهمين لطي أو تجميع مجمعات البروتين السيتوبلازمي ، وقد تم اكتشاف العديد من المرافقين بعد معالجة الصدمة الحرارية ، والتي لا تؤدي فقط إلى تحريض النسخ ولكن أيضًا إلى تنشيطها الفوري. يمكن أسيتيل Hsp90 على العديد من بقايا اللايسين وتعتمد حالة تنشيطه على حالة الأستلة الخاصة به. يتم تفعيله الفوري عن طريق نزع الأسيتيل المعتمد على HDAC6 ، وهو أمر ضروري لربط ATP بـ Hsp90 [54] ولربطه بـ cochaperone p23 وكذلك ببروتينات العميل المختلفة مثل AhR (مستقبلات هيدروكربون أريل) [126] ، Bcr- Abl ، AKT ، c-Raf [54] ، أو مستقبلات الجلوكوكورتيكويد [57 ، 127]. إلى جانب بقايا ليسين الأسيتيل الأخرى ، يعتبر نزع الأسيتيل من اللايسين 294 في Hsp90 مهمًا بشكل خاص للربط المشترك وربط العميل. 62]. يمكن تحديد الأدوار الوظيفية المختلفة لـ Hsp90 من خلال توطينها الخلوي حيث يتم نقل Hsp90 إلى الكشكشة الغشائية للتوسط في دورها في إعادة تشكيل الأكتين [62]. عن طريق نزع الأسيتيل لـ Hsp90 ، قد ينظم HDAC6 بقائه على قيد الحياة منذ أن ثبت أن HDAC6 هو نفسه بروتين عميل Hsp90 [128].

يتحول ألفا أ-كريستالين ، وهو مرافِق في الجزء القابل للذوبان من عدسات العين ، إلى الأسيتيل في ليسين 70 ، وهي منطقة يفترض أن تكون مهمة لنشاطها ، ويبدو أن بلورات ألفا ب أسيتيل على ليسين 92 [129 ، 130]. قد تكون البلورات مثالًا آخر للمرافقين الذين يتم تنظيم نشاطهم بواسطة الأستلة. يمكن أسيتيل Chaperone DNAJB8 على اثنين من بقايا اللايسين المحفوظة الموجودة في الجزء الكربوكسيترمينال الخاص به. على الرغم من أن بقايا اللايسين هذه ليست متورطة في ارتباط الركيزة ، فإن نزع الأسيتيل بوساطة HDAC4 ينشط الموصيف ويثبط تراكم البروتين السام للخلايا [131].

كما هو مذكور أعلاه ، في حالة عدم قدرة المرافقين على المساعدة في طي البروتينات العميلة بشكل صحيح ، يتم التخلص من هذه البروتينات المشوهة عن طريق التدهور البروتيني. مثال واحد هو مرة أخرى Hsp90. في حالته غير النشطة المرتبطة بـ ADP ، فإنه يرتبط بـ cochaperone Hsp70 ، الذي يعد بروتين العميل الخاطئ للتحلل من خلال ارتباطه بـ ubiquitin ligase. Hsp70 أيضًا مفرط الأسيتيل بعد تثبيط الفئة I HDAC أو HDAC6. على عكس Hsp90 ، يعزز فرط الأسيتيل لـ Hsp70 تفاعله مع بروتينات العميل مما يؤدي إلى انتشارها وتدهورها بواسطة البروتيازوم [132].

3.3.2. حبيبات الإجهاد / Aggresome / الالتهام الذاتي

عندما يكون حمل البروتينات غير المطوية مرتفعًا جدًا ، تعلق الخلايا وظيفتها الطبيعية وتستجيب بكتلة فورية من ترجمة mRNA (باستثناء عوامل استجابة الإجهاد مثل بروتينات الصدمة الحرارية / المرافقين). يؤدي تراكم النصوص المتوقفة إلى ظهور حبيبات الإجهاد. في موازاة ذلك ، تصبح البروتينات المتراكمة الخاطئة منتشرة في كل مكان وتنتقل على طول الأنابيب الدقيقة إلى الجسيم المركزي حيث تشكل ما يسمى aggresome. يعتبر HDAC6 ضروريًا لكل من حبيبات الإجهاد والتكوين العُظمى [133 ، 134]. لقد تم اقتراح أن HDAC6 يمكن أن يعمل في عملية النقل كمحول من خلال الارتباط بمركب محرك dynein من ناحية والربط عبر مجال ربط اليوبيكويتين بالبروتينات المنتشرة من ناحية أخرى [133]. يرتبط Parkin ، وهو ubiquitin E3 ligase (غالبًا ما يتحور في مرض باركنسون) ، بإحكام بـ HDAC6 ويتم نقله أيضًا بواسطة HDAC6 بطريقة تعتمد على محرك الأنابيب الدقيقة إلى التكوين aggresome. قد يكون هناك انتشار مستمر بوساطة باركين للبروتينات المشوهة أثناء النقل على طول الأنابيب الدقيقة [135 ، 136]. بالنظر إلى أن النقل المعتمد على محرك الأنبوب الدقيق يتم تعزيزه عندما يتم أسيتيل الأنابيب الدقيقة ، يتوقع المرء أن يتم تثبيط نشاط ديستيلاز لـ HDAC6 أثناء عمليات النقل هذه وأن الأشكال التي تعاني من نقص ديستيلاز من HDAC6 يجب أن تكون قادرة على إنقاذ حبيبات الإجهاد وتشكيل قوي في خلايا HDAC6 KO. نظرًا لأن هذا ليس هو الحال بالإضافة إلى ذلك ، فإن كل من HDAC6 و parkin نشطان أثناء النقل إلى aggresome ، يبدو أن حدث نزع الأسيتيل ضروري لتكوين حبيبات aggresome والتوتر. ما إذا كان التوبولين هو الركيزة ذات الصلة أم لا يبقى غير محدد.

يتم مسح Aggresomes أو مجاميع البروتين الصغيرة المنتشرة بشكل خاطئ عن طريق الالتهام الأساسي أو الالتهام الذاتي QC. يتم تشكيل حجرات حويصلية غشائية مزدوجة تسمى autophagosomes من أجل عزل السيتوبلازم الذي يحتوي على المادة المراد إزالتها. ثم تندمج هذه الحويصلات مع الجسيمات الحالة ، وتضمن الإنزيمات الليزوزومية الهضم التحلل للبروتين لمحتواها. يعتبر HDAC6 ضروريًا لإيصال مكونات البلعمة الذاتية والليزوزومات إلى aggresome الموضعي حول المركز عن طريق النقل على طول مسارات الأنابيب الدقيقة ، كما لوحظ لتطهير هنتنغتون المجمعة [137]. يلعب HDAC6 بعد ذلك دورًا ثانيًا في الاندماج بين جسيمات البلعمة الذاتية والليزوزومات عن طريق تجنيد الكورتيكتين وإزالته ، والذي يقوم بدوره بتجنيد خيوط الأكتين لربط مجموعتي الحويصلات [138 ، 139]. يمكن تمييز الالتهام الذاتي QC عن الالتهام الذاتي الناجم عن الجوع لأن الأخير لا يعتمد على HDAC6. كلاهما ، مع ذلك ، يعتمد على نفس الجينات المرتبطة بالالتهام الذاتي (Atg). أظهرت الدراسات الحديثة أن الالتهام الذاتي الناجم عن الجوع ينظمه حالة الأستلة في Atg5 و Atg7 و Atg8 ، وهي بروتينات مطلوبة لتشكيل جسيم البلعمة الذاتية. يتم أسيتيلها بواسطة p300 ، مما يمنع تكوين البلعمة الذاتية [140]. يتم تحقيق نزع الأسيتيل بواسطة Sirt1 وهو ضروري لتحريض الالتهام الذاتي بعد الحرمان من المغذيات [90]. ترتبط هذه الملاحظة بحقيقة أن Sirt1 متورط في عمليات التمثيل الغذائي ويتم تنظيمه أثناء ظروف الصيام [141]. يتطلب تحفيز الالتهام الذاتي الناتج عن الجوع أيضًا فرط استلة التوبولين ، وهو ما قد يفسر سبب عدم منع HDAC6 من هذا النوع من الالتهام الذاتي [142].

3.4. غشاء البلازما والعضيات

يمكن أن ترتبط العديد من مضخات الأيونات لغشاء البلازما ، مثل Na + / K + -ATPase و Ca 2 ± ATPase بالأنابيب الدقيقة الأسيتيل أو ثنائيات التوبولين الأسيتيل ولكن ليس مع التوبولين غير الأسيتيل. الارتباط مع التوبولين الأسيتيل يثبط المضخات ويمكن أن يعمل في نفس الوقت كموقع إرساء للشبكة الأنبوبية الدقيقة لغشاء البلازما [143]. تم العثور أيضًا على توبولين أسيتيل في غشاء البلازما في سياق آخر. يرتبط البروتين الفيروسي gp120 لفيروس نقص المناعة البشرية بمستقبله CD4 في غشاء البلازما للخلايا التائية ويحفز أستلة التوبولين وتراكمه في مواقع التلامس. يمكن أن تكون نطاقات غشاء البلازما الغنية بتوبيولين الأسيتيل مواقع دخول لفيروس نقص المناعة البشرية ، لأن HDAC6 النشط يقلل من الإصابة بفيروس نقص المناعة البشرية [144].

تحتوي الميتوكوندريا على كمية هائلة من البروتينات المؤستلة ، وهناك العديد من المنشورات حول الدور المهم للأستلة لتنظيم العمليات الأيضية والمتعلقة بالعمر ، والتي لا يمكن تضمينها في هذه الورقة.

ومن المثير للاهتمام ، أن الدراسات الحديثة تصف أحداث الأسيتيل ونزع الأسيتيل التي تحدث في تجويف جهاز ER وجهاز جولجي ، على التوالي. Bace1 ، البروتياز المسؤول عن انقسام بروتين طليعة الأميلويد ، ومستقبل LDL يصبح أسيتيل في ERGIC [145 ، 146]. الأسيتيل ضروري لتحقيق الاستقرار والتقدم على طول المسار الإفرازي. كلا البروتينين يتم نزع أسيتيلهما في جهاز جولجي. هذا لا يعني فقط وجود Hats و HDACs في هذه الأجزاء الخلوية ولكن أيضًا نظام استيراد ER لـ acetyl-CoA. في حين تم التعرف على إنزيمات هات المسؤولة ويبدو أنها بروتينات غشائية من النوع الثاني ، لا يزال يتعين اكتشاف HDACs وما زال نقل الأسيتيل CoA قيد التحقيق حاليًا [147].

3.5 المكوك السيتوبلازمي النووي

إلى جانب تنظيم استقرار البروتين ونشاطه وتفاعلاته ، يستخدم الأسيتيل على نطاق واسع لتنظيم التوطين الخلوي للبروتينات ، خاصة للاستيراد والتصدير النووي (الشكل 1 (ب)). معظم البروتينات ، التي تنتقل بين النواة والسيتوبلازم ، يتم أسيتيلها بواسطة p300 / CBP ، بما في ذلك HNF-4 و CIITA و PCNA و SRY و cAbl و CtBP2 و p53 و PAP و β-كاتينين ، RECQL4 [148-157]. يمكن أسيتيل اثنين من هؤلاء بواسطة PCAF [154 ، 155] ، وهناك تقرير واحد فقط تم نشره حتى الآن حيث يلعب acetylation بوساطة Gcn5 دورًا ، بخصوص CDC6 [158]. حتى الآن لم يتم فك شفرة أي قاعدة عامة لتوطين المجموعات السكانية الفرعية المؤلفة من البروتينات. بالنسبة لبعض البروتينات ، يعزز الأسيتيل التوطين في السيتوبلازم [149 ، 151 ، 153 ، 154 ، 158 ، 159] ، بينما يفضل الأستلة بالنسبة للبروتينات الأخرى التوطين النووي [148 ، 150 ، 152 ، 155 ، 156 ، 160 ، 161]. يمكن أن تكون الآلية التي تؤثر بها الأستلة على التوطين الخلوي إما تعديل تفاعل مع شريك ملزم يؤدي إلى الاحتفاظ به في حجرة معينة ، أو تفاعل متغير مع عوامل الاستيراد / التصدير النووية. بالنسبة لبوليميراز بولي (A) (PAP) وهليكاز DNA RECQL4 ، فقد تبين أن الأستلة تعطل تفاعلها مع عوامل الاستيراد النووية التي تؤدي إلى تراكمها في السيتوبلازم [149 ، 153]. في المقابل ، تثير أسيتيل SRY استيرادها النووي ، والذي يعتمد أيضًا على تفاعلها مع عامل استيراد نووي ، ولكن في هذه الحالة يؤدي الأسيتيل إلى تفاعل متزايد من الشكل الأسيتيل مع استيراد بيتا [148]. ومن المثير للاهتمام ، من أجل البقاء في النواة ، يجب الاحتفاظ بـ HNF-4 في حالة أسيتيل في NLS الخاص به. Deacetylation يؤدي إلى تصدير يعتمد على CRM1 على الأرجح بعد التغيير المطابق لتحرير إشارة التصدير النووي [156]. وبالمثل ، فإن التوطين السيتوبلازمي لـ p53 الأسيتيل يعتمد على ارتباط CRM1 بإشارة التصدير النووية الخاصة به والتي يمكن الوصول إليها فقط عندما يتم منع أوليجوميرات p53 بواسطة أستلة ليسين [151]. مثال آخر على التصدير المعتمد على CRM1 والذي ينظمه acetylation هو NF-kappaB. عندما تكون موجودة في النواة ، يمكن أسيتيل الوحدة الفرعية RelA لـ NF-kappaB على عدة بقايا ليسين ، والتي تؤثر بشكل مختلف على تصديرها النووي بوساطة مثبط NF-kappaB IkappaBalpha [161 ، 162].

ومن المثير للاهتمام ، أن عامل الاستيراد النووي استيراد ألفا مستهدف بحد ذاته من خلال الأسيتيل القابل للانعكاس بواسطة p300 / CBP ، والذي يحفز تكوين مغاير مع مستورد بيتا [163 ، 164]. بالإضافة إلى ذلك ، توجد العديد من عوامل النقل الأخرى من بين البروتينات المؤستلة التي حددها Choudhary et al. وتشمل هذه استيراد بيتا وكذلك CAS ، والمصدر المسؤول عن إعادة تدوير مستورد ألفا إلى السيتوبلازم ، ومستقبل التصدير الأكثر عمومية CRM1 [5].

4. ملاحظات ختامية

إن الكم الهائل من العمل المنشور حول الجوانب المهمة لأسيتيل السيتوبلازم يمنع نظرة عامة شاملة تغطي المعرفة الحالية (للحصول على جوانب إضافية ، انظر [165]). لذلك ركزنا على أمثلة مختارة توضح بعض النقاط المهمة ونود الاعتذار عن الملاحظات الأخرى المثيرة للاهتمام ، والتي لم يتم تضمينها.

بعد مناقشة أهمية الأسيتيل في السيتوبلازم ، قد يكون من المفيد الإصرار على حقيقة أن الخلايا يجب اعتبارها كيانات لا يمكن تقسيمها بشكل صارم إلى جزأين مختلفين. قد يكون تفسير بعض النتائج متحيزًا بسبب التأثيرات غير المباشرة بسبب تنظيم النسخ أو تسرب البروتينات النووية أثناء خطوات التنقية الكيميائية الحيوية. كما أن البروتينات التي تعتبر عمومًا من سكان السيتوبلازم النموذجيين تلعب أدوارًا مهمة في النواة.الأكتين ، على سبيل المثال ، المعروف باسم المكون الرئيسي للهيكل الخلوي وبالتالي المكون السيتوبلازمي ، يلعب أيضًا أدوارًا مهمة في النواة كجزء من مجمعات النسخ أو إعادة تشكيل الحمض النووي. تم العثور مؤخرًا على التيوبولين وهي تنتقل بين النواة والسيتوبلازم [166]. للتحايل على المشكلات المتعلقة بوجود النواة لتوصيف أحداث الأستلة السيتوبلازمية ، نقترح الصفائح الدموية كنظام نموذجي جيد. الصفائح الدموية خالية من النواة ولكنها مجهزة بجميع اللاعبين المهمين لتنفيذ العمليات السيتوبلازمية المعروفة مثل الإفراز الخلوي ، والالتصاق ، والتجميع ، وتغيير الشكل ، وإعادة تشكيل الهيكل الخلوي ، وحتى الأحداث المتعلقة بالاستماتة. علاوة على ذلك ، يجب تنظيم كل هذه العمليات بإحكام ويجب أن يكون الحث سريعًا للغاية لضمان الإرقاء ومنع تجلط الدم.

نود أن نختتم بالتنبؤ بأنه على الرغم من التعرف على العديد من البروتينات المؤستلة بالفعل في السيتوبلازم ، فمن المحتمل أن يتم اكتشاف المزيد. هذه الفكرة مدعومة بحقيقة أن أستلة ليسين 40 ألفا توبولين لم يتم اكتشافه في المسح البروتيني للبروتينات الأسيتيل بواسطة Choudhary et al. [5] ومواقع الأستلة الأخرى ربما تم إغفالها لنفس الأسباب الفنية (انظر أعلاه). قد تقودنا الاستراتيجيات الجديدة بما في ذلك مناهج التنبؤ بالمعلومات الحيوية [167 ، 168] إلى مرشحين جدد للأستلة القابلة للعكس. لذلك نعتقد أن القصة لن تنتهي هنا وسيخبرنا المستقبل المزيد عن البروتينات الأسيتيل وآليات تنظيمية جديدة مثيرة. أخيرًا ، تسلط هذه الورقة الضوء على أهمية أستلة البروتين السيتوبلازمي العكسي في مجموعة واسعة من الوظائف الخلوية والآليات التنظيمية. تم التعرف على الأهمية الوظيفية لهذا التعديل إلى حد كبير في الماضي لآليات التحكم في النسخ في النواة وفي الوقت الحاضر ، كما تم تلخيصها هنا ، أيضًا للأحداث السيتوبلازمية. وهكذا فإن الدور الوظيفي لأسيتيل ليسين البروتين القابل للانعكاس يقترب الآن بالتأكيد من القوة التنظيمية لفسفرة البروتين كما تنبأ كوزاريدس بحق [169].

الاختصارات

ADP:ثنائي فوسفات الأدينوزين
AhR:مستقبلات أريل الهيدروكربونية
آرب:البروتين المرتبط بالأكتين
ATAC:تحتوي Ada Two-A
ATF2:تفعيل عامل النسخ 2
ATP:أدينوسين ثلاثي الفوسفات
BBIP10:BBS بعض البروتين المتفاعل 10
BDNF:عامل التغذية العصبية المشتق من الدماغ
Cbl:سرطان الغدد الليمفاوية Casitas B- النسب
CBP:بروتين ملزمة CREB
قرص مضغوط:مجموعة التمايز
CDC6:دورة تقسيم الخلية 6
CRM1:صيانة منطقة الكروموسوم 1
EGFR:عامل نمو البشرة مستقبلات
Elp3:مستطيل بروتين مركب 3
ER:الشبكة الأندوبلازمية
ارجيك:شبكية إندوبلازمية - مقصورة جولجي المتوسطة
Gcn5:السيطرة العامة على تخليق الأحماض الأمينية 5
قبعة:هيستون أسيتيل ترانسفيراز
HDAC:هيستون ديسيتيلاز
HHV-8:فيروس الهربس البشري 8
فيروس العوز المناعي البشري:فيروس نقص المناعة البشرية
HNF-4:العامل النووي لخلايا الكبد 4
HSP90:90- بروتين
كات:ليسين (ك) أسيتيل ترانسفيراز
LDL:البروتين الدهني منخفض الكثافة
MYST:MOZ، Ybf2 / Sas3، Sas2، Tip60
NAD:نيكوتيناميد Adenine ثنائي النوكليوتيد
NF- كاباب:العامل النووي- kappaB
NGF:عامل نمو الأعصاب
NLS:إشارة التوطين النووي
PAP:بولي أ بوليميريز
PCAF:p300 / عامل مرتبط بـ CBP
PCNA:تكاثر مستضد الخلية النووية
PDGF:عامل النمو المشتق من الصفيحات
QC- الالتهام الذاتي:مراقبة الجودة - الالتهام الذاتي
راك 1:ركيزة توكسين البوتولينوم C3 المرتبطة برأس 1
RECQL4:RecQ يشبه البروتين 4
رو:الجين المتماثل راس
رني:تدخل الحمض النووي الريبي
قصة طويلة:Spt-Ada-Gcn5 Acetyltransferase
سرت:سرتوين
سري:المنطقة المحددة للجنس Y
ستاغا:أسيتيلاز SPT3-TAF9-GCN5 / PCAF
TFTC:مركب يحتوي على TAF خالٍ من TBP
تلميح 60:60- مصل اللبن
TNF:عامل نخر الورم
TPPP:بروتين التوبولين المعزز للبلمرة
الحمض الريبي النووي النقال:نقل الحمض النووي الريبي.

شكر وتقدير

يعترف المؤلفون بامتنان للدكتورة صوفي روسو والدكتور أوليفييه ديستاينج لقراءتهم النقدية للورقة. تم دعم مختبر سعدي خوشبين من قبل INCa-DHOS و ANR blanche "EpiSperm" و "Empreinte" وبرامج أبحاث ARC.

مراجع

  1. V.G. Allfrey ، R. Faulkner ، و A.E Mirsky ، "Acetylation و methylation of histones ودورها المحتمل في تنظيم توليف rna ،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 51 ، ص 786-794 ، 1964. عرض على: الباحث العلمي من Google
  2. S.W L'Hernault and J.L Rosenbaum، “Chlamydomonas & # x3b1- يتم تعديل التوبولين بعد الترجمة عن طريق الأسيتيل على & # x3b5-مجموعة أمينو من ليسين ، " الكيمياء الحيوية، المجلد. 24 ، لا. 2، pp.473–478، 1985. View at: Google Scholar
  3. G.Piperno و M. T. Fuller ، "الأجسام المضادة وحيدة النسيلة المحددة لشكل أسيتيل من & # x3b1- يتعرف التوبولين على المستضد الموجود في الأهداب والأسواط من مجموعة متنوعة من الكائنات الحية ، " مجلة بيولوجيا الخلية، المجلد. 101 ، لا. 6، pp.2085–2094، 1985. View at: Google Scholar
  4. S. C. Kim ، R. Sprung ، Y. Chen et al. ، "الركيزة والتنوع الوظيفي لأسيتيل ليسين الذي تم الكشف عنه من خلال مسح البروتينات ،" الخلية الجزيئية، المجلد. 23 ، لا. 4 ، ص 607-618 ، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  5. سي شودري ، سي كومار ، إف جناد وآخرون ، "يستهدف أسيتيل ليسين مجمعات البروتين ويشترك في تنظيم الوظائف الخلوية الرئيسية ،" علم، المجلد. 325 ، لا. 5942، pp.834–840، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  6. C.D Allis، S.L Berger، J. Cote et al.، "New nomenclature for chromatin-modification enzymes،" زنزانة، المجلد. 131 ، لا. 4، pp.633–636، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  7. بارثون ، "Hat1: الأدوار الخلوية الناشئة لنوع B هيستون أسيتيل ترانسفيراز ،" الأورام، المجلد. 26 ، لا. 37 ، ص 5319-5328 ، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  8. E.L Mersfelder و M. R. Parthun ، "مشاركة النشاط التحفيزي Hat1p (Kat1p) والتوطين دون الخلوي في إسكات التيلومير ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 283 ، لا. 43، pp.29060–29068، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  9. AB Ruiz-Garc & # xeda، R. هيستون H4 " مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 273 ، لا. 20، pp. 12599–12605، 1998. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  10. A. Imhof و A. P. Wolffe ، "تنقية وخصائص Xenopus Hat1 acetyltransferase: الارتباط ببروتينات 14-3-3 في نواة البويضة ،" الكيمياء الحيوية، المجلد. 38 ، لا. 40، pp.13085–13093، 1999. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  11. I.M Seiden-Long ، K.R Brown ، W. Shih et al. ، "الأهداف النسخية لإشارات عامل نمو الخلايا الكبدية وتنشيط الجين الورمي Ki-ras في سرطان القولون والمستقيم ،" الأورام، المجلد. 25 ، لا. 1 ، ص 91-102 ، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  12. ليبل ، ب. بوكامب ، وس ت تافروف ، "يغير التشعيع بجزيئات الأيونات الثقيلة التوزيع الخلوي للهيستون البشري أسيتيل ترانسفيراز HAT1 ،" الكيمياء الحيوية الجزيئية والخلوية، المجلد. 339 ، لا. 1-2 ، ص 271-284 ، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  13. K. Wong ، J. Zhang ، S. Awasthi et al. ، "إشارات مستقبلات عامل نمو الأعصاب تحفز الانتقال النووي المعتمد على مجال هيستون أسيتيل ترانسفيراز للعامل المرتبط بالبروتين المرتبط بـ p300 / CREB و hGCN5 acetyltransferases ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 279 ، لا. 53، pp. 55667–55674، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  14. N. Blanco-Garc & # xeda و E. Asensio-Juan و X. De La Cruz و M. مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 284 ، لا. 3، pp. 1343–1352، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  15. آر بي إس كووك ، إكس .-T. Liu ، و G.D.Smith ، "توزيع المنشطات المشتركة CBP و p300 أثناء تطوير بويضة الفأر وتطور الأجنة ،" التكاثر الجزيئي والتنمية، المجلد. 73 ، لا. 7 ، ص 885-894 ، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  16. M. E. Fermento ، N.A Gandini ، C. A. Lang et al. ، "التوزيع داخل الخلايا لـ p300 وتجنيده التفاضلي في aggresomes في سرطان الثدي ،" علم الأمراض التجريبي والجزيئي، المجلد. 88 ، لا. 2، pp.256–264، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  17. إم آر هاس وبي إيه يانكنر ، "أ & # x3b3- آلية مستقلة عن الكريتاز لتوصيل الإشارة بواسطة بروتين طليعة الأميلويد ، " مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 280 ، لا. 44، pp.36895–36904، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  18. Q. Ran and O. M. Pereira-Smith ، "تحديد شكل مقسم بديل من Tat Interactive Protein (Tip60) ، Tip60 (& # x3b2),” الجين، المجلد. 258 ، لا. 1-2، pp. 141–146، 2000. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  19. A.M. Sheridan ، T. Force ، H.-J. Yoon et al. ، "PLIP ، متغير لصق جديد لـ Tip60 ، يتفاعل مع المجموعة الرابعة من فوسفوليباز العصارة الخلوية A2 ، ويحفز موت الخلايا المبرمج ، ويقوي إنتاج البروستاجلاندين ،" البيولوجيا الجزيئية والخلوية، المجلد. 21 ، لا. 14، pp. 4470–4481، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  20. H. Liu و X. Deng و Y.J Shyu و J.L Jian و E.J Taparowsky و C.-D. Hu ، "التنظيم المتبادل لـ c-Jun و ATF2 عن طريق تنشيط النسخ وتوطين الخلايا الفرعية ،" مجلة EMBO، المجلد. 25 ، لا. 5، pp.1058–1069، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  21. H. Maruta و K. Greer و J.L Rosenbaum ، "إن acetylation of alpha-tubulin وعلاقته بتجميع وتفكيك الأنابيب الدقيقة ،" مجلة بيولوجيا الخلية، المجلد. 103 ، لا. 2 ، ص 571-579 ، 1986. عرض على: الباحث العلمي من Google
  22. C. Creppe، L. Malinouskaya، M.-L. Volvert et al. ، "يتحكم Elongator في ترحيل الخلايا العصبية القشرية وتمايزها من خلال acetylation of & # x3b1-توبولين ، " زنزانة، المجلد. 136 ، لا. 3 ، ص 551-564 ، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  23. J.A Solinger و R. Paolinelli و H. Kl & # xf6 & # xdf et al. ، "ينظم مجمع Caenorhabditis elegans elongator & # x3b1-اسيتيل التوبولين ، " علم الوراثة PLoS، المجلد. 6 ، لا. 1 ، معرف المقالة e1000820 ، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  24. L.D. Johansen ، T. Naumanen ، A. Knudsen et al. ، "يتم ترجمة IKAP إلى الكشكشة الغشائية باستخدام فيلامين A وينظم تنظيم الهيكل الخلوي للأكتين وترحيل الخلايا ،" مجلة علوم الخلية، المجلد. 121 ، لا. 6، pp.854–864، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  25. راهل ، سي زد تشين ، و آر إن كولينز ، "Elp1p ، متماثل الخميرة لبروتين متلازمة مرض FD ، ينظم بشكل سلبي خروج الخلايا بشكل مستقل عن استطالة النسخ ،" الخلية الجزيئية، المجلد. 17 ، لا. 6 ، ص 841-853 ، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  26. J. Q. Svejstrup ، "Elongator complex: كم عدد الأدوار التي تلعبها؟" الرأي الحالي في بيولوجيا الخلية، المجلد. 19 ، لا. 3 ، ص 331-336 ، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  27. C. Holmberg ، S. Katz ، M. Lerdrup وآخرون ، "دور جديد محدد بالنسبة لي& # x3baبروتين مرتبط بمركب بي كيناز في إشارات الإجهاد الخلوي ، " مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 277 ، لا. 35، pp. 31918–31928، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  28. B. Huang ، و M.J.O. Johansson ، و A. S. Bystr & # xf6m ، "تتطلب خطوة مبكرة في تعديل الحمض النووي الريبي المتذبذب اليوريدين وجود مركب Elongator ،" RNA، المجلد. 11 ، لا. 4، pp.424–436، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  29. A. Esberg ، B. Huang ، M.J.O. Johansson ، و A. S. Bystr & # xf6m ، "المستويات المرتفعة لنوعين من الحمض النووي الريبي (tRNA) تتجاوز متطلبات مجمع الاستطالة في النسخ والإخراج الخلوي ،" الخلية الجزيئية، المجلد. 24 ، لا. 1، pp. 139–148، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  30. C. Chen و S. Tuck و A. S. Bystr & # xf6m ، "عيوب في تعديل الحمض النووي الريبي (tRNA) المرتبطة بالاختلالات العصبية والنمائية في طفرات استطالة Caenorhabditis elegans ،" علم الوراثة PLoS، المجلد. 5 ، لا. 7 ، معرف المقالة e1000561 ، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  31. M. Conacci-Sorrell و C. Ngouenet و R.N. & # x3b1-اسيتيل التوبولين وتمايز الخلايا ، " زنزانة، المجلد. 142 ، لا. 3، pp.480–493، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  32. J. S. Akella ، D. Wloga ، J. Kim et al. ، "MEC-17 هو & # x3b1 -tubulin acetyltransferase ،" طبيعة سجية، المجلد. 467 ، لا. 7312 ، ص 218 - 222 ، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  33. N. Ohkawa و S. جينات الخلايا، المجلد. 13 ، لا. 11 ، ص 1171-1183 ، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  34. Q. Shen، X. Zheng، M. A. McNutt et al.، "NAT10 ، وهو بروتين نووي ، يتم توطينه في منتصف الجسم وينظم الحركية الخلوية والأستلة في الأنابيب الدقيقة ،" أبحاث الخلايا التجريبية، المجلد. 315 ، لا. 10، pp.1653–1667، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  35. J. Y. Kim ، S. Shen ، K. Dietz et al. ، "يعد تصدير HDAC1 النووي الناجم عن الظروف المرضية أمرًا ضروريًا لظهور تلف محور عصبي ،" علم الأعصاب الطبيعي، المجلد. 13 ، لا. 2، pp. 180–189، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  36. دبليو- م. يانغ ، S.-C. تساي ، Y.-D. Wen و G. Fej & # xe9 و E. Seto ، "المجالات الوظيفية لـ Histone deacetylase-3 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 277 ، لا. 11 ، ص 9447-9454 ، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  37. P. Viatour ، S. Legrand-Poels ، C. Van Lint et al. ، "السيتوبلازم الأول& # x3baب& # x3b1 يزيد NF-& # x3baالنسخ المستقل عن B من خلال الارتباط بـ هيستون ديستيلاز (HDAC) 1 و HDAC3 ، " مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 278 ، لا. 47، pp.46541–46548، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  38. Z. Gao و Q. He و B. Peng و P. J. Chiao و J. Ye ، "تنظيم النقل النووي لـ HDAC3 بواسطة I& # x3baب& # x3b1 مطلوب لتثبيط عامل نخر الورم من مستقبلات تنشيط البيروكسيسوم المنشط & # x3b3 وظيفة،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 281 ، لا. 7 ، ص 4540-4547 ، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  39. M. S. Longworth و L.A Laimins ، "هيستون ديستيلاز 3 توضع في غشاء البلازما وهي ركيزة من Src ،" الأورام، المجلد. 25 ، لا. 32، pp. 4495–4500، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  40. D. Waltregny ، W. Gl & # xe9nisson ، S.L Tran et al. ، "يرتبط Histone deacetylase HDAC8 بالعضلات الملساء & # x3b1-الاكتين وهو ضروري لانقباض خلايا العضلات الملساء " مجلة FASEB، المجلد. 19 ، لا. 8 ، ص 966-968 ، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  41. D. Waltregny ، L. De Leval ، W. Gl & # xe9nisson et al. ، "التعبير عن هيستون ديسيتيلاز 8 ، وهو فئة 1 هيستون ديستيلاز ، يقتصر على الخلايا التي تظهر تمايزًا عضليًا سلسًا في الأنسجة البشرية الطبيعية ،" المجلة الأمريكية لعلم الأمراض، المجلد. 165 ، لا. 2 ، ص 553-564 ، 2004. عرض على: الباحث العلمي من Google
  42. M. Martin و R. Kettmann و F. Dequiedt ، "Class IIa histone deacetylases: إجراء التطوير والتمايز ،" المجلة الدولية لعلم الأحياء التنموي، المجلد. 53 ، لا. 2-3 ، ص 291-301 ، 2009. عرض على: الباحث العلمي من Google
  43. E. A. Miska ، و C. Karlsson ، و E. Langley ، و S.J. Nielsen ، و J. Pines ، و T. مجلة EMBO، المجلد. 18 ، لا. 18، pp.5099–5107، 1999. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  44. H.-Y. كاو ، أ.فيرديل ، سي- سي. تساي ، سي سيمون ، هـ. جوجيلون ، وس. خوشبين ، "آلية النقل المكوكي النووي الهيولى للهيستون ديستيلاز 7 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 276 ، لا. 50، pp.47496–47507، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  45. R.E Bakin و M. O. Jung ، "عزل السيتوبلازم لـ HDAC7 من مقصورات الميتوكوندريا والنووية عند بدء موت الخلايا المبرمج ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 279 ، لا. 49، pp. 51218-51225، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  46. نيشينو ، إم ميازاكي ، إتش هوشينو ، واي ميوا ، إس هورينوتشي ، إم يوشيدا ، "14-3-3 ينظم الاستيراد النووي للفئة IIa هيستون ديستيلاسز ،" الكيمياء الحيوية والبيوفيزيائية تبحث في الاتصالات، المجلد. 377 ، لا. 3، pp.852–856، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  47. B.C Harrison ، K. Huynh ، G. L. Lundgaard ، S.M Helmke ، M.B Perryman ، and T. رسائل FEBS، المجلد. 584 ، لا. 6، pp.1103–1110، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  48. T. Ago ، T. Liu ، P. Zhai et al. ، "مسار يعتمد على الأكسدة والاختزال لتنظيم الفئة II HDACs والتضخم القلبي ،" زنزانة، المجلد. 133 ، لا. 6 ، ص 978-993 ، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  49. C. Gao و X. Li و M. Lam و Y. Liu و S. Chakraborty و H.-Y. Kao ، "CRM1 يتوسط في التصدير النووي لـ HDAC7 بشكل مستقل عن الفسفرة HDAC7 والارتباط بـ 14-3-3s ،" رسائل FEBS، المجلد. 580 ، لا. 21 ، ص 5096-5104 ، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  50. سي هوبرت ، أ. طبيعة سجية، المجلد. 417 ، لا. 6887 ، ص 455-458 ، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  51. A.Matsuyama ، T. Shimazu ، Y. Sumida et al. ، "في الجسم الحي زعزعة استقرار الأنابيب الدقيقة الديناميكية عن طريق نزع الأسيتيل بوساطة HDAC6 ،" مجلة EMBO، المجلد. 21 ، لا. 24، pp.6820–6831، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  52. Y. Zhang، N. Li، C.Caron et al. ، "يتفاعل HDAC-6 مع التوبولين والأنابيب الدقيقة ويزيلها في الجسم الحي ،" مجلة EMBO، المجلد. 22 ، لا. 5، pp. 1168–1179، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  53. X. Zhang ، Z. Yuan ، Y. Zhang et al. ، "يعدل HDAC6 حركية الخلية عن طريق تغيير مستوى أستلة الكورتاكتين ،" الخلية الجزيئية، المجلد. 27 ، لا. 2، pp. 197-213، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  54. بي بالي ، إم برانبات ، جيه برادنر وآخرون ، "تثبيط هيستون ديسيتيلاز 6 أسيتيلات ويعطل وظيفة المرافقة لبروتين الصدمة الحرارية 90: أساس جديد لنشاط مضاد لوكيميا الدم لمثبطات هيستون ديستيلاز ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 280 ، لا. 29 ، ص 26729-26734 ، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  55. S. Aoyagi و T. K. الاتجاهات في بيولوجيا الخلية، المجلد. 15 ، لا. 11 ، ص 565-567 ، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  56. B. T. Scroggins ، K. Robzyk ، D. Wang et al. ، "ينظم موقع acetylation في النطاق الأوسط لـ Hsp90 وظيفة المرافقة ،" الخلية الجزيئية، المجلد. 25 ، لا. 1، pp. 151–159، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  57. J.J.Kovacs ، P.JM Murphy ، S. Gaillard et al. ، "HDAC6 ينظم الأسيتيل Hsp90 والتفعيل المعتمد على المرافقة لمستقبلات الجلوكوكورتيكويد ،" الخلية الجزيئية، المجلد. 18 ، لا. 5 ، ص 601-607 ، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  58. Y. Li، X. Zhang، R.D Polakiewicz، T.-P. Yao و M.J Comb ، "HDAC6 مطلوب لعامل نمو البشرة الذي يسببه & # x3b2-الكاتينين النووي "، مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 283 ، لا. 19، pp. 12686–12690، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  59. R.B Parmigiani ، W. S. Xu ، G. Venta-Perez et al. ، "HDAC6 هو ديسيتيلز معين من البيروكسيريدوكسين ويشارك في تنظيم الأكسدة والاختزال ،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 105 ، لا. 28 ، ص 9633-9638 ، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  60. A. Verdel ، S. Curtet ، M.-P. Brocard et al. ، "الصيانة النشطة لـ mHDA2 / mHDAC6 هيستون-ديسيتيلاز في السيتوبلازم ،" علم الأحياء الحالي، المجلد. 10 ، لا. 12 ، ص 747-749 ، 2000. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  61. N.R Bertos ، و B. Gilquin ، و G. K. T. Chan ، و T. J. Yen ، و S. Khochbin ، و X.-J. يانغ ، "دور مجال تكرار رباعي ببتيد للهيستون البشري ديستيلاز 6 في الاحتفاظ السيتوبلازمي ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 279 ، لا. 46 ، ص 48246-48254 ، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  62. Y.-S. جاو ، سي سي هوبرت ، جيه لو ، واي.-إس. لي ، ج. لي و ت. ياو ، "هيستون ديستيلاز 6 ينظم إعادة تشكيل الأكتين الناجم عن عامل النمو والالتقام الخلوي ،" البيولوجيا الجزيئية والخلوية، المجلد. 27 ، لا. 24، pp. 8637–8647، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  63. E. Purev ، L. Neff ، W.C Horne ، و R. Baron ، "يعمل c-Cbl و Cbl-b بشكل متكرر لحماية الخلايا الآكلة للعظم من موت الخلايا المبرمج ولإزاحة HDAC6 من & # x3b2-التوبولين ، تثبيت الأنابيب الدقيقة والبودوسومات ، " البيولوجيا الجزيئية للخلية، المجلد. 20 ، لا. 18، pp. 4021–4030، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  64. J. Zhou و C.C Vos و A. Gjyrezi et al. ، "ينظم البروتين farnesyltransferase نشاط HDAC6 بطريقة تعتمد على الأنابيب الدقيقة ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 284 ، لا. 15، pp. 9648–9655، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  65. A. V. Loktev ، Q. Zhang ، J. S. Beck et al. ، "A BBS بعض الوحدات الفرعية الروابط ciliogenesis ، واستقرار الأنابيب الدقيقة ، والأسيتيل ،" الخلية التنموية، المجلد. 15 ، لا. 6، pp.854–865، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  66. O. Destaing ، F. Saltel ، B. Gilquin et al. ، "يتحكم مسار Rho-mDia2-HDAC6 الجديد في نمط البودوسوم من خلال أستلة الأنابيب الدقيقة في ناقضات العظم ،" مجلة علوم الخلية، المجلد. 118 ، لا. 13، pp.2901–2911، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  67. M. Perez، I. Santa-Maria، E.G De Barreda et al. ، "Tau & # x2014an inhibitor لوظيفة deacetylase HDAC6 ،" مجلة الكيمياء العصبية، المجلد. 109 ، لا. 6 ، ص 1756-1766 ، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  68. N. Tok & # xe9si ، A. Lehotzky ، I. Horv & # xe1th et al. ، "يعزز TPPP / p25 أستلة التوبولين عن طريق تثبيط هيستون ديستيلاز 6 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 285 ، لا. 23، pp. 17896–17906، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  69. دينغ ، بي جيه دولان ، وجي في دبليو جونسون ، "يتفاعل هيستون ديسيتيلاز 6 مع بروتين تاو المرتبط بالأنابيب الدقيقة ،" مجلة الكيمياء العصبية، المجلد. 106 ، لا. 5، pp. 2119–2130، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  70. Y. Wu، S.W Song، J. Sun، J.M Bruner، G.N Fuller، and W. Zhang، "IIp45 يمنع ترحيل الخلية من خلال تثبيط HDAC6 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 285 ، لا. 6، pp. 3554–3560، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  71. S. A. Wickstr & # xf6m و K. مجلة EMBO، المجلد. 29 ، لا. 1، pp.131–144، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  72. Y.L Deribe ، P. Wild ، A. Chandrashaker et al. ، "تنظيم الاتجار بمستقبلات عامل نمو البشرة بواسطة ليسين ديسيتيلاز HDAC6 ،" علم الإشارات، المجلد. 2 ، لا. 102 ، ص. ra84، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  73. E. N. Pugacheva و S. A. Jablonski و T. R. زنزانة، المجلد. 129 ، لا. 7، pp. 1351–1363، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  74. إم إتش براش ، أ.جوارديولا ، جيه إتش كونور ، T.-P. Yao و S. Shenolikar ، "تعطل مثبطات Deactylase المجمعات الخلوية التي تحتوي على إنزيمات الفوسفاتيز البروتيني و deacetylases" ، مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 279 ، لا. 9 ، ص 7685-7691 ، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  75. Y. Han، H. M. Jeong، Y.-H. جين وآخرون ، "أسيتيل هيستون ديستيلاز 6 بواسطة p300 يخفف نشاط ديستيلاز ،" الكيمياء الحيوية والبيوفيزيائية تبحث في الاتصالات، المجلد. 383 ، لا. 1 ، ص 88-92 ، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  76. ماتياس ، إم يوشيدا ، وس. خوشبين ، "HDAC6 عامل جديد لمراقبة الإجهاد الخلوي ،" دورة الخلية، المجلد. 7 ، لا. 1، pp.7-10، 2008. View at: Google Scholar
  77. C. Boyault ، K. Sadoul ، M. Pabion ، و S. Khochbin ، "HDAC6 ، عند مفترق طرق بين الهيكل الخلوي وإشارات الخلية عن طريق الأستلة والتواجد في كل مكان ،" الأورام، المجلد. 26 ، لا. 37 ، ص 5468-5476 ، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  78. جيه جيه تونج ، جيه ليو ، إن آر بيرتوس ، و X.-J. يانغ ، "تحديد HDAC10 ، وهو نوع جديد من الصنف الثاني لإنسيلاز هيستون البشري يحتوي على مجال غني بالليوسين ،" بحوث الأحماض النووية، المجلد. 30 ، لا. 5، pp. 1114–1123، 2002. View at: Google Scholar
  79. جوارديولا و T.-P. ياو ، "الاستنساخ الجزيئي وتوصيف رواية هيستون ديستيلاز HDAC10 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 277 ، لا. 5 ، ص 3350-3356 ، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  80. D.D. Fischer ، R. Cai ، U. Bhatia et al. ، "عزل وتوصيف الرواية من الدرجة الثانية هيستون ديستيلاز ، HDAC10 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 277 ، لا. 8، pp.66656–6666، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  81. H.-Y. كاو ، C.-H. لي ، أ. كوماروف ، سي سي هان ، وإر إم إيفانز ، "عزل وتوصيف الثدييات HDAC10 ، رواية هيستون ديستيلاز ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 277 ، لا. 1، pp. 187–193، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  82. K. S. Keedy ، N. M. مجلة علم الفيروسات، المجلد. 83 ، لا. 10، pp.4749–4756، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  83. غاو ، إم أ.كويتو ، إف أسيلبيرجس ، ب.أتاجا ، "الاستنساخ والتوصيف الوظيفي لـ HDAC11 ، وهو عضو جديد في عائلة هيستون ديستيلاز البشرية ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 277 ، لا. 28، pp.25748–25755، 2002. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  84. أ.فاكويرو ، "الدور المحفوظ للسرتوينات في تنظيم الكروماتين ،" المجلة الدولية لعلم الأحياء التنموي، المجلد. 53 ، لا. 2-3 ، ص 303 - 322 ، 2009. عرض على: الباحث العلمي من Google
  85. T.L A. Kawahara ، E.Michishita ، A. S. Adler et al. ، "SIRT6 يربط هيستون H3 ليسين 9 ديسيتيليشن إلى NF-& # x3baالتعبير الجيني المعتمد على B وعمر الكائن الحي ، " زنزانة، المجلد. 136 ، لا. 1، pp.62–74، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  86. ميتشيشيتا ، جيه واي بارك ، جيه إم بيرنسكيس ، جيه سي باريت ، وإي هوريكاوا ، "عمليات التطويع والوظائف الخلوية المحفوظة وغير المحفوظة تطورًا لبروتينات SIRT البشرية ،" البيولوجيا الجزيئية للخلية، المجلد. 16 ، لا. 10 ، ص 4623-4635 ، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  87. M. Tanno ، J. Sakamoto ، T.Miura ، K. Shimamoto ، and Y. Horio ، "Nucleocytoplasmic shuttling of the NAD + -dependent histone deacetylase SIRT1 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 282 ، لا. 9 ، ص 6823-6832 ، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  88. T. Sugino ، M. Maruyama ، M. رسائل FEBS، المجلد. 584 ، لا. 13 ، ص 2821-2826 ، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  89. S. Hisahara ، S. Chiba ، H. Matsumoto et al. ، "Histone deacetylase SIRT1 يعدل تمايز الخلايا العصبية من خلال إزاحتها النووية ،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 105 ، لا. 40، pp. 15599–15604، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  90. H. L. In ، L. Cao ، R. Mostoslavsky et al. ، "دور Décetylase Sirt1 المعتمد على NAD في تنظيم الالتهام الذاتي ،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 105 ، لا. 9، pp. 3374–3379، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  91. Y. Zhang ، M. Zhang ، H. Dong et al. ، "Deacetylation of cortactin by SIRT1 يعزز ترحيل الخلايا ،" الأورام، المجلد. 28 ، لا. 3، pp.445–460، 2009. View at: Google Scholar
  92. B. J. North و E. Verdin ، "النقل المكوكي النووي السيتوبلازمي البيني وتوطين SIRT2 أثناء الانقسام ،" بلوس واحد، المجلد. 2 ، لا. 8 ، المقالة e784 ، 2007. عرض في: موقع الناشر | منحة جوجل
  93. B. J. North ، B. L. Marshall ، M. T. Borra ، J.M Denu ، and E. Verdin ، "The Human Sir2 Orthologolog ، SIRT2 ، هو NAD + -ddependent tubulin deacetylase ،" الخلية الجزيئية، المجلد. 11 ، لا. 2 ، ص 437-444 ، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  94. T. Inoue ، M. Hiratsuka ، M. Osaki et al. ، "يعمل SIRT2 ، وهو tubulin deacetylase ، على منع دخول تكاثف الكروموسوم استجابة للإجهاد الانقسامي ،" الأورام، المجلد. 26 ، لا. 7، pp.945–957، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  95. L. حركة الخلية والهيكل الخلوي، المجلد. 65 ، لا. 3، pp. 179–182، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  96. A.L Garske ، و B.C.Smith ، و J.M Denu ، "ربط SIRT2 بمرض باركنسون ،" البيولوجيا الكيميائية ACS، المجلد. 2 ، لا. 8 ، ص 529-532 ، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  97. T. F. Outeiro ، E. Kontopoulos ، S. M. Altmann et al. ، "إنقاذ مثبطات Sirtuin 2 & # x3b1- السمية بوساطة السينوكلين في نماذج مرض باركنسون ، " علم، المجلد. 317 ، لا. 5837 ، ص 516-519 ، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  98. N.R Sundaresan، S.A Samant، V.B Pillai، S.B Rajamohan، and M.P Gupta، "SIRT3 هو ديستيلاز يستجيب للإجهاد في الخلايا العضلية للقلب الذي يحمي الخلايا من موت الخلايا الناتج عن الإجهاد عن طريق نزع الأسيتيل لـ Ku70 ،" البيولوجيا الجزيئية والخلوية، المجلد. 28 ، لا. 20 ، ص 6384-6401 ، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  99. شهبازيان وم. المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية، المجلد. 76، pp. 75–100، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  100. H. Y. Cohen ، S. Lavu ، K. J. Bitterman et al. ، "Acetylation of the C terminus of Ku70 by CBP and PCAF control the Bax-mediation by apoptosis،" الخلية الجزيئية، المجلد. 13 ، لا. 5، pp.627–638، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  101. L.-J. خوان ، دبليو- جيه. الشيعة م. Chen et al. ، "Histone deacetylases تحديدًا يقلل من تنظيم التنشيط الجيني المعتمد على p53 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 275 ، لا. 27، pp.20436–20443، 2000. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  102. Vaziri ، S. K. Dessain ، E. N. Eaton et al. ، "يعمل hSIR2SIRT1 باعتباره p53 deacetylase المعتمد على NAD ،" زنزانة، المجلد. 107 ، لا. 2 ، ص 149-159 ، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  103. M. P. Gupta و S. A. Samant و S.H Smith و S.G Shroff و "HDAC4 و PCAF يرتبطان بساركوميات القلب ويلعبان دورًا في تنظيم نشاط الانقباض العضلي ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 283 ، لا. 15 ، ص 10135-10146 ، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  104. T. Fukushige، Z.K Siddiqui، M. Chou et al.، "MEC-12، an & # x3b1- التوبولين المطلوب لحساسية اللمس في C. ايليجانس ، " مجلة علوم الخلية، المجلد. 112 ، لا. 3، pp. 395–403، 1999. View at: Google Scholar
  105. J. Gaertig، M. A. Cruz، J. Bowen، L. Gu، D.G Pennock، and M.A Gorovsky، "Acetylation of lysine 40 in & # x3b1-التوبولين ليس ضروريًا في رباعي الغشاء الحراري ، " مجلة بيولوجيا الخلية، المجلد. 129 ، لا. 5، pp.1301–1310، 1995. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  106. K.G Kozminski و D.R Diener و J.L Rosenbaum ، "تعبير عالي المستوى عن nonacetylatable & # x3b1-Tubulin في Chlamydomonas reinhardtii ، " حركة الخلية والهيكل الخلوي، المجلد. 25 ، لا. 2، pp. 158–170، 1993. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  107. Y. Zhang ، S. Kwon ، T. Yamaguchi et al. ، "الفئران التي تفتقر إلى هيستون ديسيتيلاز 6 لديها توبولين مفرط الأسيتيل ولكنها قابلة للحياة وتتطور بشكل طبيعي ،" البيولوجيا الجزيئية والخلوية، المجلد. 28 ، لا. 5، pp.1688–1701، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  108. S.J Haggarty ، و K.M Koeller ، و J.C Wong ، و C.M Grozinger ، و S.L Schreiber ، "مثبط جزيء صغير انتقائي للمجال من هيستون ديستيلاز 6 (HDAC6) بوساطة tubulin deacetylation ،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 100 ، لا. 8 ، ص 4389-4394 ، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  109. J.P. Dompierre ، J.D Godin ، B.C Charrin et al. ، "تثبيط هيستون ديستيلاز 6 يعوض عجز النقل في مرض هنتنغتون عن طريق زيادة أستلة التوبولين ،" مجلة علم الأعصاب، المجلد. 27 ، لا. 13، pp. 3571–3583، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  110. P.P. Naranatt ، H. H. Krishnan ، M. S. Smith ، and B. Chandran ، "يعدل فيروس الهربس المرتبط بساركوما كابوزي ديناميكيات الأنابيب الدقيقة عبر إشارات RhoA-GTP-Diaphanous 2 ويستخدم محركات dynein لإيصال الحمض النووي الخاص به إلى النواة ،" مجلة علم الفيروسات، المجلد. 79 ، لا. 2، pp. 1191–1206، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  111. A.Iliev ، J.R.jannatian ، F. Opazo et al. ، "التجميع السريع للأنابيب الدقيقة وتثبيتها عن طريق المكورات العقدية الرئوية نيوموليسين ذات السموم العصبية في طريقة تعتمد على الكوليسترول ، ولا تحلل ، وتعتمد على Src-kinase ، تمنع الاتجار داخل الخلايا ،" علم الأحياء الدقيقة الجزيئي، المجلد. 71 ، لا. 2، pp.461–477، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  112. K. Tonami و Y. Kurihara و H. Aburatani و Y. Uchijima و T. Asano و H. Kurihara ، "Calpain 6 يشارك في تثبيت الأنابيب الدقيقة وتنظيم الهيكل الخلوي ،" البيولوجيا الجزيئية والخلوية، المجلد. 27 ، لا. 7، pp.2548–2561، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  113. K. Ogawa-Goto ، K. Tanaka ، T.أوينو وآخرون ، "يشارك p180 في التفاعل بين الشبكة الإندوبلازمية والأنابيب الدقيقة من خلال مجال ربط وتجميع جديد للأنابيب الدقيقة ،" البيولوجيا الجزيئية للخلية، المجلد. 18 ، لا. 10، pp. 3741–3751، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  114. M.M. Falconer و U. Vielkind و D.L Brown ، "إنشاء حزمة أنابيب دقيقة مستقرة أثناء التزام الخلايا العصبية ،" حركة الخلية والهيكل الخلوي، المجلد. 12 ، لا. 3، pp. 169–180، 1989. View at: Google Scholar
  115. T. Ishizaki و Y. Morishima و M. Okamoto و T. Furuyashiki و T. Kato و S. Narumiya ، "تنسيق الأنابيب الدقيقة والهيكل الخلوي الأكتيني بواسطة المؤثر Rho mDia1 ،" بيولوجيا خلية الطبيعة، المجلد. 3 ، لا. 1، pp.8–14، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  116. A. F. Palazzo ، T. A. Cook ، A. S. Alberts ، and G.G Gundersen ، "mDia يتوسط تشكيل Rho المنظم وتوجيه الأنابيب الدقيقة المستقرة ،" بيولوجيا خلية الطبيعة، المجلد. 3 ، لا. 8 ، ص 723-729 ، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  117. Y. Arakawa ، J.V Cordeiro ، and M. Way ، "يحفز التثبيط بوساطة F11L لإشارات RhoA-mDia ديناميكيات الأنابيب الدقيقة أثناء عدوى فيروس اللقاح ،" مضيف الخلية والميكروب، المجلد. 1 ، لا. 3، pp.213–226، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  118. A. F. Palazzo ، و C.H. Eng ، و D. D. Schlaepfer ، و E. E. Marcantonio ، و G.G Gundersen ، "التثبيت المحلي للأنابيب الدقيقة عن طريق إشارات Rho المُيسرة من Integin- و FAK ،" علم، المجلد. 303 ، لا. 5659، pp.836–839، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  119. J. C. Warren ، A. Rutkowski ، and L. Cassimeris ، "تؤدي العدوى بالفيروس الغدي الذي يعاني من نقص النسخ المتماثل إلى تغييرات في عدم الاستقرار الديناميكي للأنابيب الدقيقة للخلية المضيفة ،" البيولوجيا الجزيئية للخلية، المجلد. 17 ، لا. 8، pp. 3557–3568، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  120. P. J.M Drake ، و G.J. Griffiths ، و L. Shaw ، و R.P Benson ، و B. M. Corfe ، "تطبيق تحليل المحتوى العالي لدراسة التعديلات اللاحقة للترجمة للهيكل الخلوي ،" مجلة أبحاث البروتين، المجلد. 8 ، لا. 1، pp.28–34، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  121. S.H Leech ، C. A. Evans ، L. Shaw et al. ، "تكشف التحليلات البروتينية للخيوط الوسيطة أن السيتوكيراتين 8 شديد الأسيتيل ومضاعفات على التوازن الظهاري للقولون والمستقيم ،" البروتيوميات، المجلد. 8 ، لا. 2 ، ص 279-288 ، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  122. NA Reed، D. Cai، T.L. Blasius et al.، "Microtubule acetylation is a Kinesin-1 link and transport،" علم الأحياء الحالي، المجلد. 16 ، لا. 21 ، ص 2166-2172 ، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  123. Y.-S. جاو ، سي سي هوبرت ، وت. ياو ، "إن إنزيم هيستون ديستيلاز 6 المرتبط بالأنابيب الدقيقة (HDAC6) ينظم تهريب الخلايا الداخلية لمستقبلات عامل نمو البشرة (EGFR) وتدهورها ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 285 ، لا. 15، pp. 11219–11226، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  124. B. K. Dhakal و M.A Mulvey ، "الإشريكية القولونية المسببة للأمراض تغزو الخلايا المضيفة عبر مسار يعتمد على الأنابيب الدقيقة المعدلة HDAC6 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 284 ، لا. 1 ، ص 446-454 ، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  125. K. Sadoul ، C. Boyault ، M. Pabion ، و S. Khochbin ، "تنظيم دوران البروتين بواسطة acetyltransferases و deacetylases ،" بيوكيمي، المجلد. 90 ، لا. 2، pp.306–312، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  126. V.D.Kekatpure ، و A. J. Dannenberg ، و K. Subbaramaiah ، "يعدل HDAC6 نشاط المرافقة Hsp90 وينظم تنشيط إشارات مستقبلات أريل الهيدروكربون ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 284 ، لا. 12 ، الصفحات من 7436 إلى 7445 ، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  127. بي جي إم مورفي ، واي. موريشيما ، جيه جيه كوفاكس ، ت. ياو ، و دبليو برات ، "تنظيم ديناميكيات عمل hsp90 على مستقبلات الجلوكورتيكويد عن طريق الأسيتيل / نزع الأسيتيل للوصيف ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 280 ، لا. 40، pp. 33792–33799، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  128. R. Rao ، W. Fiskus ، Y. Yang et al. ، "تثبيط HDAC6 يعزز إلغاء 17-AAG بوساطة من hsp90 وظيفة المرافقة في خلايا سرطان الدم البشرية ،" دم، المجلد. 112 ، لا. 5، pp. 1886–1893، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  129. بي لين ، آر سي باري ، دي إل سميث ، وجي بي سميث ، "تم تحديد الأسيتيل في الجسم الحي في ليسين 70 من العدسة البشرية & # x3b1أ- بلوري ، " علم البروتين، المجلد. 7 ، لا. 6، pp.1451–1457، 1998. View at: Google Scholar
  130. في.ن. لابكو ، ودي إل سميث ، وجي بي سميث ، "في الجسم الحي بالكرباميل والأستلة للعدسة البشرية القابلة للذوبان في الماء & # x3b1B-crystallin lysine 92 ، " علم البروتين، المجلد. 10 ، لا. 6 ، الصفحات 1130-1136 ، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  131. هاجمان ، إم إيه روجانو ، إم إيه دبليو إتش. van Waarde et al. ، "عائلة مرافق DNAJB الفرعية ذات الأنشطة المعتمدة على HDAC تمنع تراكم البروتين السام ،" الخلية الجزيئية، المجلد. 37 ، لا. 3، pp. 355–369، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  132. Y. Wang، S.-Y. وانغ ، X.-H. Zhang et al. ، "FK228 يثبط وظيفة المرافقة Hsp90 في خلايا K562 عبر فرط الأستلة لـ Hsp70 ،" الكيمياء الحيوية والبيوفيزيائية تبحث في الاتصالات، المجلد. 356 ، لا. 4، pp. 998–1003، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  133. Y. Kawaguchi و J.J.Kovacs و A. McLaurin و J.M Vance و A. Ito و T.-P. ياو ، "إن ديستيلاز HDAC6 ينظم التكوين الهائل وحيوية الخلية استجابة لإجهاد البروتين الخاطئ ،" زنزانة، المجلد. 115 ، لا. 6 ، ص 727-738 ، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  134. S. Kwon و Y. Zhang و P. Matthias ، "إن deacetylase HDAC6 هو مكون جديد وحاسم لحبيبات الإجهاد التي تشارك في الاستجابة للضغط ،" الجينات والتنمية، المجلد. 21 ، لا. 24، pp. 3381–3394، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  135. Q. Jiang و Y. Ren و J. Feng ، "الارتباط المباشر بـ Histone deacetylase 6 يتوسط في التجنيد القابل للعكس للباركين في الجسيم المركزي ،" مجلة علم الأعصاب، المجلد. 28 ، لا. 48 ، ص 12993-13002 ، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  136. J.A Olzmann ، A. Li ، M.V. Chudaev et al. ، "أهداف تعدد المواسير المرتبطة بـ Parkin بوساطة K63 بشكل خاطئ DJ-1 إلى aggresomes عبر الارتباط بـ HDAC6 ،" مجلة بيولوجيا الخلية، المجلد. 178 ، لا. 6 ، ص 1025-1038 ، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  137. إيواتا ، ب.إي.رايلي ، جيه.أ.جونستون ، و آر آر كوبيتو ، "HDAC6 والأنابيب الدقيقة مطلوبة من أجل التحلل الذاتي في هنتنغتين المتجمع ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 280 ، لا. 48 ، الصفحات 40282-40292 ، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  138. J.-Y. لي و ت. ياو ، "الالتهام الذاتي لمراقبة الجودة: جهد مشترك من يوبيكويتين وبروتين ديستيلاز والهيكل الخلوي أكتين" الالتهام الذاتي، المجلد. 6 ، لا. 4، pp. 555–557، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  139. J.-Y. لي ، إتش كوجا ، واي.كاواجوتشي وآخرون ، "يتحكم HDAC6 في نضج البلعوم الذاتي الضروري للالتهام الذاتي الانتقائي للتحكم في الجودة في يوبيكويتين ،" مجلة EMBO، المجلد. 29 ، لا. 5 ، ص 969-980 ، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  140. I.H Lee و T. Finkel ، "تنظيم الالتهام الذاتي بواسطة p300 acetyltransferase ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 284 ، لا. 10، pp.6322–6328، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  141. G. Boily ، E.L. Seifert ، L. Bevilacqua et al. ، "SirT1 ينظم استقلاب الطاقة والاستجابة لتقييد السعرات الحرارية في الفئران ،" بلوس واحد، المجلد. 3 ، لا. 3 ، معرف المقالة e1759 ، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  142. C. Geeraert ، A. Ratier ، S.G Pfisterer et al. ، "إن فرط استلة التوبولين الناجم عن الجوع مطلوب لتحفيز الالتهام الذاتي عن طريق الحرمان من المغذيات ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 285 ، لا. 31 ، ص 24184-24194 ، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  143. G.G.Zampar ، M. E. Chesta ، A. Carbajal et al. ، "يرتبط توبولين الأسيتيل بالمجال السيتوبلازمي الخامس لـ Na + / K + -ATPase: موقع إرساء محتمل للأنابيب الدقيقة إلى غشاء البلازما ،" مجلة الكيمياء الحيوية، المجلد. 422 ، لا. 1، pp. 129–137، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  144. A. Valenzuela-Fernandez، S. & # xc1lvarez، M. Gordon-Alonso et al.، "Histone deacetylase 6 ينظم عدوى فيروس العوز المناعي البشري من النوع 1 ،" البيولوجيا الجزيئية للخلية، المجلد. 16 ، لا. 11 ، ص 5445-5454 ، 2005. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  145. C. Costantini و M. H. Ko و M.C Jonas و L. مجلة الكيمياء الحيوية، المجلد. 407 ، لا. 3، pp.383–395، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  146. M. C. Jonas ، C. Costantini ، و L. Puglielli ، "PCSK9 مطلوب للتخلص من المواد الوسيطة غير الأسيتيل لبروتين الغشاء الناشئ BACE1 ،" تقارير EMBO، المجلد. 9 ، لا. 9 ، ص 916-922 ، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  147. H. K. Mi و L. Puglielli ، "شبكتان إندوبلازمية (ER) / ER golgi تعتمد على المقصورة الوسيطة القائمة على lysine acetyltransferases بعد التحويلية لتنظيم مستويات BACE1 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 284 ، لا. 4، pp.2482–2492، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  148. L. Thevenet ، C. M & # xe9jean ، B. Moniot et al. ، "تنظيم التوزيع الخلوي SRY البشري من خلال acetylation / deacetylation ،" مجلة EMBO، المجلد. 23 ، لا. 16، pp. 3336–3345، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  149. T. Shimazu ، S. Horinouchi ، و M. Yoshida ، "نظم هيستون متعددة ديسيتيلز وبروتين رابط لـ CREB ينظمان المعالجة النهائية قبل mRNA 3 & # x2032 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 282 ، لا. 7 ، ص 4470-4478 ، 2007. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  150. S.Naryzhny and H. Lee ، "تلعب التعديلات اللاحقة للترجمة لمولد الضد النووي للخلية المتكاثرة: الأستلة ، وليس الفسفرة ، دورًا مهمًا في تنظيم وظيفتها ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 279 ، لا. 19، pp. 20194–20199، 2004. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  151. Y. Kawaguchi و A. Ito و E. Appella و T.-P. ياو ، "تعديل الشحن في بقايا ليسين متعدد الطرفي c ينظم قلة البروتين p53 وتهريب النواة والسيتوبلازم ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 281 ، لا. 3، pp. 1394–1400، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  152. L.-J. Zhao و T. Subramanian و Y. Zhou و G. Chinnadurai ، "ينظم Acetylation بواسطة p300 التوطين النووي ووظيفة ضاغط النسخ CtBP2 ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 281 ، لا. 7 ، ص 4183-4189 ، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  153. T. Dietschy ، I. Shevelev ، J. Pena-Diaz et al. ، "P300-mediation acetylation of the Rothmund-Thomson-syndrome gene product RECQL4 ينظم توطينه دون الخلوي ،" مجلة علوم الخلية، المجلد. 122 ، لا. 8، pp. 1258–1267، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  154. M.G di Bari و L. Ciuffini و M. Mingardi و R. Testi و S. Soddu و D. Baril & # xe0 ، "c-Abl acetylation بواسطة هيستون acetyltransferases ينظم توطينه النووي السيتوبلازمي ،" تقارير EMBO، المجلد. 7 ، لا. 7 ، ص 727-733 ، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  155. C. Spilianakis و J. Papamatheakis و A. Kretsovali ، "Acetylation بواسطة PCAF يعزز التراكم النووي CIITA ومعاملات جينات الفئة الثانية المعقدة من التوافق النسيجي" البيولوجيا الجزيئية والخلوية، المجلد. 20 ، لا. 22 ، ص 8489-8498 ، 2000. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  156. E. Soutoglou ، N. Katrakili ، و I. Talianidis ، "ينظم الأسيتيل نشاط عامل النسخ على مستويات متعددة ،" الخلية الجزيئية، المجلد. 5 ، لا. 4، pp.745–751، 2000. View at: Google Scholar
  157. R. Firestein ، G. Blander ، S. Michan et al. ، "يمنع SIRT1 deacetylase تكوين الأورام المعوية ونمو سرطان القولون ،" بلوس واحد، المجلد. 3 ، لا. 4 ، معرف المقالة e2020 ، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  158. R. Paolinelli و R. Mendoza-Maldonado و A. Cereseto و M. Giacca ، "الأسيتيل بواسطة GCN5 ينظم فسفرة CDC6 في المرحلة S من دورة الخلية ،" علم الأحياء الهيكلية والجزيئية الطبيعة، المجلد. 16 ، لا. 4، pp.412–420، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  159. M. P. Valacco و C. Varone و C. Malicet و E. C & # xe1nepa و J.L Iovanna و S. مجلة الكيمياء الحيوية الخلوية، المجلد. 97 ، لا. 5، pp.1066–1079، 2006. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  160. F. Lan ، J.M Cacicedo ، N. Ruderman ، and Y. Ido ، "تعديل SIRT1 لحالة الأستلة ، وتوطين العصارة الخلوية ، ونشاط LKB1: دور محتمل في تنشيط بروتين كيناز AMP المنشط ،" مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 283 ، لا. 41، pp.27628–27635، 2008. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  161. L.-F. تشين ، و.& # x3baالإجراء "ب" الذي ينظمه أستلة عكسية " علم، المجلد. 293 ، لا. 5535، pp.1653–1657، 2001. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  162. R. Kiernan ، V. Br & # xe8s ، R. W. M. Ng et al. ، "إيقاف تشغيل ما بعد التنشيط لـ NF-& # x3baيتم تنظيم النسخ المعتمد على B بواسطة acetylation لـ p65 ، " مجلة الكيمياء البيولوجية، المجلد. 278 ، لا. 4 ، ص 2758-2766 ، 2003. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  163. A. J. Bannister ، E. A. Miska ، D.G & # xf6rlich ، و T. Kouzarides ، "Acetylation of importin-& # x3b1 عوامل الاستيراد النووية حسب CBP / p300 ، " علم الأحياء الحالي، المجلد. 10 ، لا. 8، pp.467–470، 2000. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  164. سي إم ريان ، جي سي هاريز ، كيه بي كيندل ، إتش إم كولينز ، ودي إم هيري ، "التفاعل الوظيفي لبروتين رابط لـ CREB (CBP) مع بروتينات النقل النووي والتعديل بواسطة مثبطات HDAC ،" دورة الخلية، المجلد. 5 ، لا. 18 ، ص 2146-2152 ، 2006. عرض على: الباحث العلمي من Google
  165. بي كلوز ، سي كريب ، إم جيلارد وآخرون ، "الدور الناشئ لأسيتيل ليسين للبروتينات غير النووية ،" علوم الحياة الخلوية والجزيئية، المجلد. 67 ، لا. 8، pp. 1255–1264، 2010. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  166. T. Akoumianaki ، D. Kardassis ، H. Polioudaki ، S. D. مجلة علوم الخلية، المجلد. 122 ، لا. 8، pp. 1111–1118، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  167. شوارتز ، إم إف تشو ، وجي إم تشيرش ، "توقع تعديلات البروتين بعد الترجمة باستخدام التحليل التلوي لمجموعات بيانات مقياس البروتين" ، البروتينات الجزيئية والخلوية، المجلد. 8 ، لا. 2، pp.365–379، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  168. A. Basu ، K. L. Rose ، J. Zhang et al. ، "التنبؤ على مستوى البروتيوم لركائز الأسيتيل ،" وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية، المجلد. 106 ، لا. 33، pp. 13785–13790، 2009. عرض على: موقع الناشر | منحة جوجل
  169. T. Kouzarides ، "Acetylation: تعديل تنظيمي لمنافسة الفسفرة ،" مجلة EMBO، المجلد. 19 ، لا. 6، pp.176–1179، 2000. View at: Google Scholar

حقوق النشر

حقوق النشر & # x00A9 2011 Karin Sadoul et al. هذا مقال مفتوح الوصول يتم توزيعه بموجب ترخيص Creative Commons Attribution License ، والذي يسمح بالاستخدام غير المقيد والتوزيع والاستنساخ في أي وسيط ، بشرط الاستشهاد بالعمل الأصلي بشكل صحيح.


3.3 الخلايا حقيقية النواة

في هذه المرحلة ، يجب أن يكون واضحًا أن الخلايا حقيقية النواة لها بنية أكثر تعقيدًا من الخلايا بدائية النواة. تسمح العضيات بوظائف مختلفة في الخلية في نفس الوقت. قبل مناقشة وظائف العضيات داخل خلية حقيقية النواة ، دعونا أولاً نفحص مكونين مهمين للخلية: غشاء البلازما والسيتوبلازم.

اتصال مرئي

ما هي الهياكل التي تمتلكها الخلية النباتية والتي لا تمتلكها الخلية الحيوانية؟ ما هي الهياكل الموجودة في الخلية الحيوانية والتي لا تحتوي عليها الخلية النباتية؟

غشاء البلازما

مثل بدائيات النوى ، تحتوي الخلايا حقيقية النواة على غشاء بلازما (الشكل 3.8) يتكون من طبقة ثنائية فسفوليبيد مع بروتينات مدمجة تفصل المحتويات الداخلية للخلية عن البيئة المحيطة بها. الفسفوليبيد هو جزيء دهني يتكون من سلسلتين من الأحماض الدهنية ، العمود الفقري للجليسرول ، ومجموعة الفوسفات. ينظم غشاء البلازما مرور بعض المواد ، مثل الجزيئات العضوية ، والأيونات ، والماء ، مما يمنع مرور بعضها للحفاظ على الظروف الداخلية ، مع إدخال أو إزالة مواد أخرى بشكل فعال.المركبات الأخرى تتحرك بشكل سلبي عبر الغشاء.

تُطوى الأغشية البلازمية للخلايا المتخصصة في الامتصاص في نتوءات تشبه الأصابع تسمى ميكروفيلي (المفرد = ميكروفيليوس). يزيد هذا الطي من مساحة سطح غشاء البلازما. توجد هذه الخلايا عادة في بطانة الأمعاء الدقيقة ، العضو الذي يمتص العناصر الغذائية من الطعام المهضوم. هذا مثال ممتاز على مطابقة الشكل لوظيفة الهيكل.

الأشخاص المصابون بمرض الاضطرابات الهضمية لديهم استجابة مناعية للجلوتين ، وهو بروتين موجود في القمح والشعير والجاودار. تدمر الاستجابة المناعية الميكروفيلي ، وبالتالي ، لا يستطيع الأفراد المصابون امتصاص العناصر الغذائية. وهذا يؤدي إلى سوء التغذية والتشنج والإسهال. يجب على المرضى الذين يعانون من مرض الاضطرابات الهضمية اتباع نظام غذائي خال من الغلوتين.

السيتوبلازم

يشتمل السيتوبلازم على محتويات خلية بين غشاء البلازما والغلاف النووي (بنية ستتم مناقشتها قريبًا). وهي مكونة من عضيات معلقة في العصارة الخلوية الشبيهة بالهلام والهيكل الخلوي ومواد كيميائية مختلفة (الشكل 3.7). على الرغم من أن السيتوبلازم يتكون من 70 إلى 80 في المائة من الماء ، إلا أنه يحتوي على تناسق شبه صلب ، والذي يأتي من البروتينات الموجودة فيه. ومع ذلك ، فإن البروتينات ليست الجزيئات العضوية الوحيدة الموجودة في السيتوبلازم. تم العثور على الجلوكوز والسكريات البسيطة الأخرى والسكريات والأحماض الأمينية والأحماض النووية والأحماض الدهنية ومشتقات الجلسرين هناك أيضًا. يتم أيضًا إذابة أيونات الصوديوم والبوتاسيوم والكالسيوم والعديد من العناصر الأخرى في السيتوبلازم. تحدث العديد من التفاعلات الأيضية في السيتوبلازم ، بما في ذلك تخليق البروتين.

الهيكل الخلوي

إذا كنت ستقوم بإزالة جميع العضيات من الخلية ، فهل سيكون غشاء البلازما والسيتوبلازم هما المكونان الوحيدان المتبقيان؟ لا. داخل السيتوبلازم ، لا يزال هناك أيونات وجزيئات عضوية ، بالإضافة إلى شبكة من ألياف البروتين التي تساعد في الحفاظ على شكل الخلية ، وتؤمن عضيات معينة في مواقع محددة ، وتسمح للسيتوبلازم والحويصلات بالتحرك داخل الخلية ، وتمكين الكائنات وحيدة الخلية تتحرك بشكل مستقل. تُعرف شبكة ألياف البروتين هذه بالهيكل الخلوي. هناك ثلاثة أنواع من الألياف داخل الهيكل الخلوي: الخيوط الدقيقة ، والمعروفة أيضًا باسم خيوط الأكتين ، والخيوط الوسيطة ، والأنابيب الدقيقة (الشكل 3.9).

الألياف الدقيقة هي أنحف ألياف الهيكل الخلوي وتعمل في تحريك المكونات الخلوية ، على سبيل المثال ، أثناء انقسام الخلية. كما أنها تحافظ على بنية الميكروفيلي ، الطي الواسع لغشاء البلازما الموجود في الخلايا المخصصة للامتصاص. هذه المكونات شائعة أيضًا في خلايا العضلات وهي مسؤولة عن تقلص خلايا العضلات. الخيوط الوسيطة ذات قطر متوسط ​​ولها وظائف هيكلية ، مثل الحفاظ على شكل الخلية وترسيخ العضيات. يشكل الكيراتين ، وهو المركب الذي يقوي الشعر والأظافر ، نوعًا واحدًا من الخيوط الوسيطة. الأنابيب الدقيقة هي أثخن ألياف الهيكل الخلوي. هذه أنابيب مجوفة يمكن أن تذوب وتصلح بسرعة. توجه الأنابيب الدقيقة حركة العضيات وهي الهياكل التي تسحب الكروموسومات إلى أقطابها أثناء انقسام الخلية. وهي أيضًا المكونات الهيكلية للأسواط والأهداب. في الأهداب والسوط ، يتم تنظيم الأنابيب الدقيقة على شكل دائرة من تسعة أنابيب دقيقة مزدوجة في الخارج واثنين من الأنابيب الدقيقة في المركز.

الجسيم المركزي هو منطقة بالقرب من نواة الخلايا الحيوانية التي تعمل كمركز لتنظيم الأنابيب الدقيقة. يحتوي على زوج من المريكزات ، وهما بنيان متعامدان مع بعضهما البعض. كل مريكز هو أسطوانة من تسعة ثلاثة توائم من الأنابيب الدقيقة.

يقوم الجسيم المركزي بتكرار نفسه قبل انقسام الخلية ، وتلعب المريكزات دورًا في سحب الكروموسومات المضاعفة إلى الأطراف المتقابلة للخلية المنقسمة. ومع ذلك ، فإن الوظيفة الدقيقة للمريكزات في الانقسام الخلوي ليست واضحة ، لأن الخلايا التي تمت إزالتها من المريكزات لا يزال بإمكانها الانقسام ، والخلايا النباتية ، التي تفتقر إلى المريكزات ، قادرة على الانقسام الخلوي.

فلاجيلا وأهداب

فلاجيلا (المفرد = السوط) هي هياكل طويلة تشبه الشعر تمتد من غشاء البلازما وتستخدم لتحريك خلية بأكملها (على سبيل المثال ، الحيوانات المنوية ، يوجلينا). عند وجودها ، تحتوي الخلية على سوط واحد فقط أو عدد قليل من الأسواط. عندما تكون الأهداب (المفرد = الهدب) موجودة ، فإنها كثيرة العدد وتمتد على طول سطح غشاء البلازما بأكمله. إنها هياكل قصيرة تشبه الشعر تُستخدم لتحريك الخلايا بأكملها (مثل البراميسيوم) أو تحريك المواد على طول السطح الخارجي للخلية (على سبيل المثال ، أهداب الخلايا التي تبطن قناتي فالوب التي تحرك البويضة نحو الرحم ، أو أهداب تبطن خلايا الجهاز التنفسي التي تحرك الجسيمات باتجاه الحلق الذي يحبسه المخاط).

نظام الغشاء الداخلي

نظام الغشاء الداخلي (إندو = داخل) عبارة عن مجموعة من الأغشية والعضيات (الشكل 3.13) في الخلايا حقيقية النواة التي تعمل معًا لتعديل وتعبئة ونقل الدهون والبروتينات. ويشمل الغلاف النووي ، والجسيمات الحالة ، والحويصلات ، والشبكة الإندوبلازمية وجهاز جولجي ، والتي سنغطيها قريبًا. وإن لم يكن من الناحية الفنية داخل الخلية ، يتم تضمين غشاء البلازما في نظام الغشاء الداخلي لأنه ، كما سترى ، يتفاعل مع العضيات الغشائية الأخرى.

النواة

عادةً ما تكون النواة هي العضية الأبرز في الخلية (الشكل 3.7). تحتوي النواة (جمع = نوى) على الحمض النووي للخلية على شكل كروماتين وتوجه تركيب الريبوسومات والبروتينات. دعونا نلقي نظرة عليها بمزيد من التفصيل (الشكل 3.10).

الغلاف النووي عبارة عن هيكل مزدوج الغشاء يشكل الجزء الخارجي من النواة (الشكل 3.10). كل من الأغشية الداخلية والخارجية للمغلف النووي عبارة عن طبقات ثنائية الفسفوليبيد.

يتخلل الغلاف النووي مسام تتحكم في مرور الأيونات والجزيئات والحمض النووي الريبي بين البلازما النووية والسيتوبلازم.

لفهم الكروماتين ، من المفيد التفكير أولاً في الكروموسومات. الكروموسومات هي هياكل داخل النواة تتكون من الحمض النووي والمواد الوراثية والبروتينات. يسمى هذا المزيج من الحمض النووي والبروتينات بالكروماتين. في حقيقيات النوى ، الكروموسومات هي هياكل خطية. كل نوع لديه عدد محدد من الكروموسومات في نواة خلايا جسمه. على سبيل المثال ، في البشر ، يكون عدد الكروموسوم 46 ، بينما في ذباب الفاكهة ، يكون عدد الكروموسوم ثمانية.

تكون الكروموسومات مرئية فقط ويمكن تمييزها عن بعضها البعض عندما تكون الخلية جاهزة للانقسام. عندما تكون الخلية في مراحل النمو والصيانة من دورة حياتها ، فإن الكروموسومات تشبه مجموعة من الخيوط المختلطة غير الملتفة.

نحن نعلم بالفعل أن النواة توجه تكوين الريبوسومات ، لكن كيف تفعل ذلك؟ تحتوي بعض الكروموسومات على أجزاء من الحمض النووي تقوم بتشفير الحمض النووي الريبي. منطقة تلطيخ داكن داخل النواة ، تسمى النواة (جمع = نواة) ، تجمع الحمض النووي الريبوزي مع البروتينات المرتبطة به لتجميع الوحدات الفرعية الريبوسومية التي يتم نقلها بعد ذلك عبر المسام النووية إلى السيتوبلازم.

الشبكة الإندوبلازمية

الشبكة الإندوبلازمية (ER) (الشكل 3.13) عبارة عن سلسلة من الأنابيب الغشائية المترابطة التي تعمل بشكل جماعي على تعديل البروتينات وتصنيع الدهون. ومع ذلك ، يتم تنفيذ هاتين الوظيفتين في مناطق منفصلة من الشبكة الإندوبلازمية: الشبكة الإندوبلازمية الخشنة والشبكة الإندوبلازمية الملساء ، على التوالي.

يسمى الجزء المجوف من أنابيب ER بالفضاء التجويف أو الصهريج. غشاء ER ، وهو طبقة ثنائية فسفوليبيدية مدمجة مع البروتينات ، مستمر مع الغلاف النووي.

سميت الشبكة الإندوبلازمية الخشنة (RER) بهذا الاسم لأن الريبوسومات المتصلة بسطحها السيتوبلازمي تمنحها مظهرًا مرصعًا عند عرضها من خلال مجهر إلكتروني.

تقوم الريبوسومات بتجميع البروتينات أثناء ارتباطها بـ ER ، مما يؤدي إلى نقل البروتينات المركبة حديثًا إلى تجويف RER حيث تخضع لتعديلات مثل طي السكريات أو إضافتها. يصنع RER أيضًا الدهون الفوسفورية لأغشية الخلايا.

إذا لم يكن من المقرر أن تبقى الفسفوليبيدات أو البروتينات المعدلة في RER ، فسيتم تعبئتها داخل حويصلات ونقلها من RER عن طريق التبرعم من الغشاء (الشكل 3.13). نظرًا لأن RER يعمل في تعديل البروتينات التي سيتم إفرازها من الخلية ، فهو وفير في الخلايا التي تفرز البروتينات ، مثل الكبد.

الشبكة الإندوبلازمية الملساء (SER) مستمرة مع RER ولكن بها القليل من الريبوسومات أو لا تحتوي على ريبوسومات على سطحها السيتوبلازمي (انظر الشكل 3.7). تشمل وظائف SER تخليق الكربوهيدرات والدهون (بما في ذلك الدهون الفوسفورية) ، وإزالة السموم من هرمونات الستيرويد من الأدوية والسموم التمثيل الغذائي للكحول وتخزين أيونات الكالسيوم.

جهاز جولجي

لقد ذكرنا بالفعل أن الحويصلات يمكن أن تتبرعم من غرفة الطوارئ ، ولكن أين تذهب الحويصلات؟ قبل الوصول إلى وجهتها النهائية ، يجب فرز الدهون أو البروتينات الموجودة داخل حويصلات النقل وتعبئتها ووسمها بحيث تنتهي في المكان الصحيح. يتم فرز الدهون والبروتينات ووضع العلامات عليها وتعبئتها وتوزيعها في جهاز جولجي (يسمى أيضًا جسم جولجي) ، وهو عبارة عن سلسلة من الأكياس الغشائية المسطحة (الشكل 3.11).

يحتوي جهاز جولجي على وجه استقبال بالقرب من الشبكة الإندوبلازمية ووجه محرر على الجانب بعيدًا عن ER ، باتجاه غشاء الخلية. تنتقل حويصلات النقل التي تتشكل من ER إلى الوجه المستلم ، وتندمج معه ، وتفريغ محتوياتها في تجويف جهاز Golgi. أثناء انتقال البروتينات والدهون عبر جهاز جولجي ، فإنها تخضع لمزيد من التعديلات. التعديل الأكثر شيوعًا هو إضافة سلاسل قصيرة من جزيئات السكر. يتم بعد ذلك تمييز البروتينات والدهون المعدلة حديثًا بمجموعات جزيئية صغيرة لتمكينها من توجيهها إلى وجهاتها الصحيحة.

أخيرًا ، يتم حزم البروتينات المعدلة والموسومة في حويصلات تتبرعم من الوجه المقابل لـ Golgi. في حين أن بعض هذه الحويصلات ، تنقل الحويصلات ، تودع محتوياتها في أجزاء أخرى من الخلية حيث سيتم استخدامها ، والبعض الآخر ، الحويصلات الإفرازية ، تندمج مع غشاء البلازما وتطلق محتوياتها خارج الخلية.

يوضح مقدار Golgi في أنواع الخلايا المختلفة مرة أخرى أن الشكل يتبع الوظيفة داخل الخلايا. الخلايا التي تشارك في قدر كبير من النشاط الإفرازي (مثل خلايا الغدد اللعابية التي تفرز الإنزيمات الهاضمة أو خلايا الجهاز المناعي التي تفرز الأجسام المضادة) لديها عدد كبير من جولجي.

في الخلايا النباتية ، يلعب Golgi دورًا إضافيًا في تصنيع السكريات ، والتي يتم دمج بعضها في جدار الخلية وبعضها يستخدم في أجزاء أخرى من الخلية.

الجسيمات المحللة

في الخلايا الحيوانية ، الجسيمات الحالة هي "التخلص من القمامة" في الخلية. تساعد الإنزيمات الهاضمة داخل الليزوزومات على تكسير البروتينات والسكريات والدهون والأحماض النووية وحتى العضيات البالية. في حقيقيات النوى أحادية الخلية ، تعتبر الجسيمات الحالة مهمة لهضم الطعام الذي تتناوله وإعادة تدوير العضيات. تنشط هذه الإنزيمات عند درجة حموضة أقل بكثير (أكثر حمضية) من تلك الموجودة في السيتوبلازم. العديد من التفاعلات التي تحدث في السيتوبلازم لا يمكن أن تحدث عند درجة حموضة منخفضة ، وبالتالي فإن ميزة تقسيم الخلية حقيقية النواة إلى عضيات واضحة.

تستخدم الليزوزومات أيضًا إنزيماتها المائيّة لتدمير الكائنات الحية المسببة للأمراض التي قد تدخل الخلية. مثال جيد على ذلك يحدث في مجموعة من خلايا الدم البيضاء تسمى الضامة ، وهي جزء من جهاز المناعة في الجسم. في عملية تعرف باسم البلعمة ، يغزو جزء من غشاء البلاعم (يطوي للداخل) ويبتلع العامل الممرض. الجزء المنفتح ، مع وجود العامل الممرض بداخله ، ثم يقرص نفسه بعيدًا عن غشاء البلازما ويصبح حويصلة. الحويصلة تندمج مع الليزوزوم. ثم تدمر إنزيمات التحلل المائي للجسيم الليزوزوم العامل الممرض (الشكل 3.12).

الحويصلات والفجوات

الحويصلات والفجوات عبارة عن أكياس مرتبطة بالغشاء تعمل في التخزين والنقل. الفجوات أكبر إلى حد ما من الحويصلات ، ولا يندمج غشاء الفجوة مع أغشية المكونات الخلوية الأخرى. يمكن أن تندمج الحويصلات مع الأغشية الأخرى داخل نظام الخلية. بالإضافة إلى ذلك ، يمكن للأنزيمات الموجودة داخل فجوات النبات أن تكسر الجزيئات الكبيرة.

اتصال مرئي

لماذا يفعل ال رابطة الدول المستقلة وجه جولجي لا يواجه غشاء البلازما؟

الريبوسومات

الريبوسومات هي الهياكل الخلوية المسؤولة عن تخليق البروتين. عند النظر إليها من خلال المجهر الإلكتروني ، تظهر الريبوسومات الحرة إما على شكل مجموعات أو نقاط صغيرة مفردة تطفو بحرية في السيتوبلازم. يمكن ربط الريبوسومات إما بالجانب السيتوبلازمي لغشاء البلازما أو بالجانب السيتوبلازمي للشبكة الإندوبلازمية (الشكل 3.7). أظهر الفحص المجهري الإلكتروني أن الريبوسومات تتكون من وحدات فرعية كبيرة وصغيرة. الريبوسومات هي مجمعات إنزيمية مسؤولة عن تخليق البروتين.

نظرًا لأن تخليق البروتين ضروري لجميع الخلايا ، توجد الريبوسومات عمليًا في كل خلية ، على الرغم من أنها أصغر في الخلايا بدائية النواة. وهي وفيرة بشكل خاص في خلايا الدم الحمراء غير الناضجة لتخليق الهيموجلوبين ، الذي يعمل في نقل الأكسجين في جميع أنحاء الجسم.

الميتوكوندريا

غالبًا ما يطلق على الميتوكوندريا (المفرد = ميتوكوندريا) "مصانع الطاقة" أو "مصانع الطاقة" للخلية لأنها مسؤولة عن صنع أدينوسين ثلاثي الفوسفات (ATP) ، الجزيء الرئيسي الذي يحمل الطاقة في الخلية. يُعرف تكوين الـ ATP من انهيار الجلوكوز بالتنفس الخلوي. الميتوكوندريا هي عضيات بيضاوية الشكل وذات غشاء مزدوج (الشكل 3.14) لها ريبوسوماتها ودناها. كل غشاء عبارة عن طبقة ثنائية فسفوليبيد مدمجة مع البروتينات. تحتوي الطبقة الداخلية على طيات تسمى cristae ، والتي تزيد من مساحة سطح الغشاء الداخلي. تسمى المنطقة التي تحيط بها الطيات مصفوفة الميتوكوندريا. للكريستا والمصفوفة أدوار مختلفة في التنفس الخلوي.

تماشياً مع موضوعنا الخاص بوظيفة متابعة الشكل ، من المهم الإشارة إلى أن خلايا العضلات لديها تركيز عالٍ جدًا من الميتوكوندريا لأن الخلايا العضلية تحتاج إلى الكثير من الطاقة للتقلص.

بيروكسيسومات

البيروكسيسومات هي عضيات صغيرة مستديرة محاطة بأغشية مفردة. ينفذون تفاعلات الأكسدة التي تكسر الأحماض الدهنية والأحماض الأمينية. كما أنها تزيل السموم من العديد من السموم التي قد تدخل الجسم. يتم إزالة السموم من الكحول عن طريق البيروكسيسومات في خلايا الكبد. المنتج الثانوي لتفاعلات الأكسدة هو بيروكسيد الهيدروجين ، H2ا2، والتي يتم احتواؤها داخل البيروكسيسومات لمنع المادة الكيميائية من التسبب في تلف المكونات الخلوية خارج العضية. يتم تكسير بيروكسيد الهيدروجين بأمان بواسطة إنزيمات البيروكسيسوم في الماء والأكسجين.

الخلايا الحيوانية مقابل الخلايا النباتية

على الرغم من أوجه التشابه الأساسية بينهما ، هناك بعض الاختلافات الصارخة بين الخلايا الحيوانية والنباتية (انظر الجدول 3.1). تحتوي الخلايا الحيوانية على مريكزات ، وجسيمات مركزية (تمت مناقشتها تحت الهيكل الخلوي) ، وليزوزومات ، بينما لا تحتوي الخلايا النباتية. تحتوي الخلايا النباتية على جدار خلوي ، وبلاستيدات خضراء ، وبلاسموديمات ، وبلاستيدات تستخدم للتخزين ، وفجوة مركزية كبيرة ، في حين أن الخلايا الحيوانية لا تفعل ذلك.

جدار الخلية

في الشكل 3.7ب، الرسم التخطيطي لخلية نباتية ، ترى هيكلًا خارجيًا لغشاء البلازما يسمى جدار الخلية. جدار الخلية عبارة عن غطاء صلب يحمي الخلية ويوفر دعمًا هيكليًا ويعطي شكلًا للخلية. تحتوي الخلايا الفطرية والخلايا الأولية أيضًا على جدران خلوية.

في حين أن المكون الرئيسي لجدران الخلايا بدائية النواة هو الببتيدوغليكان ، فإن الجزيء العضوي الرئيسي في جدار الخلية النباتية هو السليلوز ، وهو عديد السكاريد المكون من سلاسل طويلة ومستقيمة من وحدات الجلوكوز. عندما تشير المعلومات الغذائية إلى الألياف الغذائية ، فإنها تشير إلى محتوى السليلوز في الطعام.

البلاستيدات الخضراء

مثل الميتوكوندريا ، تمتلك البلاستيدات الخضراء أيضًا الحمض النووي والريبوزومات الخاصة بها. تعمل البلاستيدات الخضراء في عملية التمثيل الضوئي ويمكن العثور عليها في الخلايا حقيقية النواة مثل النباتات والطحالب. في عملية التمثيل الضوئي ، يتم استخدام ثاني أكسيد الكربون والماء والطاقة الضوئية لإنتاج الجلوكوز والأكسجين. هذا هو الفرق الرئيسي بين النباتات والحيوانات: فالنباتات (ذاتية التغذية) قادرة على صنع طعامها ، مثل الجلوكوز ، في حين أن الحيوانات (الكائنات غيرية التغذية) يجب أن تعتمد على الكائنات الحية الأخرى لمركباتها العضوية أو مصدر الغذاء.

مثل الميتوكوندريا ، تحتوي البلاستيدات الخضراء على أغشية خارجية وداخلية ، ولكن داخل الفضاء المحاط بالغشاء الداخلي للبلاستيدات الخضراء مجموعة من الأكياس الغشائية المترابطة والمكدسة والمملوءة بالسوائل تسمى ثايلاكويدات (الشكل 3.15). كل كومة من الثايلاكويدات تسمى جرانوم (جمع = جرانا). يُطلق على السائل المُحاط بالغشاء الداخلي والمُحيط بالجرانا اسم السدى.

تحتوي البلاستيدات الخضراء على صبغة خضراء تسمى الكلوروفيل ، والتي تلتقط طاقة ضوء الشمس من أجل التمثيل الضوئي. مثل الخلايا النباتية ، تحتوي الطلائعيات الضوئية أيضًا على البلاستيدات الخضراء. تقوم بعض البكتيريا أيضًا بعملية التمثيل الضوئي ، ولكنها لا تحتوي على البلاستيدات الخضراء. توجد أصباغ التمثيل الضوئي الخاصة بهم في غشاء الثايلاكويد داخل الخلية نفسها.

اتصال التطور

التعايش الداخلي

لقد ذكرنا أن كل من الميتوكوندريا والبلاستيدات الخضراء تحتوي على الحمض النووي والريبوزومات. هل تساءلت لماذا؟ تشير أدلة قوية إلى أن التعايش الداخلي هو التفسير.

التكافل هو علاقة تعيش فيها الكائنات الحية من نوعين منفصلين في ارتباط وثيق وتظهر عادةً تكيفات محددة مع بعضها البعض. التعايش الداخلي (إندو-= ضمن) هي علاقة يعيش فيها كائن حي داخل الآخر. تكثر العلاقات التكافلية في الطبيعة. تعيش الميكروبات التي تنتج فيتامين ك داخل أمعاء الإنسان. هذه العلاقة مفيدة لنا لأننا غير قادرين على تصنيع فيتامين ك. وهي مفيدة أيضًا للميكروبات لأنها محمية من الكائنات الحية الأخرى ويتم توفيرها موطنًا ثابتًا وغذاءًا وفيرًا من خلال العيش داخل الأمعاء الغليظة.

لاحظ العلماء منذ فترة طويلة أن البكتيريا والميتوكوندريا والبلاستيدات الخضراء متشابهة في الحجم. نعلم أيضًا أن الميتوكوندريا والبلاستيدات الخضراء لها دنا وريبوزومات ، تمامًا كما تفعل البكتيريا. يعتقد العلماء أن الخلايا المضيفة والبكتيريا شكلت علاقة تكافلية متبادلة مفيدة للطرفين عندما ابتلعت الخلايا المضيفة البكتيريا الهوائية والبكتيريا الزرقاء ولكنها لم تدمرها. من خلال التطور ، أصبحت هذه البكتيريا المبتلعة أكثر تخصصًا في وظائفها ، حيث تحولت البكتيريا الهوائية إلى ميتوكوندريا وتحولت بكتيريا التمثيل الضوئي إلى صانعات خضراء.

الفراغ المركزي

سابقًا ، ذكرنا الفجوات كمكونات أساسية للخلايا النباتية. إذا نظرت إلى الشكل 3.7 ، سترى أن كل خلية نباتية بها فجوة مركزية كبيرة تشغل معظم الخلية. تلعب الفجوة المركزية دورًا رئيسيًا في تنظيم تركيز الخلية للماء في الظروف البيئية المتغيرة. في الخلايا النباتية ، يوفر السائل الموجود داخل الفجوة المركزية ضغط التورم ، وهو الضغط الخارجي الناتج عن السائل داخل الخلية.هل سبق لك أن لاحظت أنه إذا نسيت سقي نبات لبضعة أيام ، فإنه يذبل؟ وذلك لأنه عندما يصبح تركيز الماء في التربة أقل من تركيز الماء في النبات ، ينتقل الماء من الفجوات المركزية والسيتوبلازم إلى التربة. عندما تتقلص الفجوة المركزية ، فإنها تترك جدار الخلية غير مدعوم. ينتج عن فقدان الدعم لجدران الخلايا في النبات مظهر ذابل. بالإضافة إلى ذلك ، فإن هذا السائل له طعم مرير للغاية ، مما لا يشجع على تناوله من قبل الحشرات والحيوانات. تعمل الفجوة المركزية أيضًا على تخزين البروتينات في خلايا البذور النامية.

مصفوفة خارج الخلية للخلايا الحيوانية

تطلق معظم الخلايا الحيوانية مواد في الفضاء خارج الخلية. المكونات الأساسية لهذه المواد هي البروتينات السكرية وبروتين الكولاجين. بشكل جماعي ، تسمى هذه المواد المصفوفة خارج الخلية (الشكل 3.16). لا تقوم المصفوفة خارج الخلية فقط بتثبيت الخلايا معًا لتشكيل نسيج ، ولكنها تسمح أيضًا للخلايا الموجودة داخل الأنسجة بالتواصل مع بعضها البعض.

يقدم تخثر الدم مثالاً على دور المصفوفة خارج الخلية في الاتصال الخلوي. عندما تتلف الخلايا المبطنة للأوعية الدموية ، فإنها تعرض مستقبلات بروتينية تسمى عامل الأنسجة. عندما يرتبط عامل النسيج بعامل آخر في المصفوفة خارج الخلية ، فإنه يتسبب في التصاق الصفائح الدموية بجدار الوعاء الدموي التالف ، ويحفز خلايا العضلات الملساء المجاورة في الوعاء الدموي على الانقباض (وبالتالي تضيق الأوعية الدموية) ، ويبدأ سلسلة من خطوات تحفز الصفائح الدموية على إنتاج عوامل التخثر.

مفرق بين الخلايا

يمكن للخلايا أيضًا أن تتواصل مع بعضها البعض عن طريق الاتصال المباشر ، يشار إليها باسم التقاطعات بين الخلايا. هناك بعض الاختلافات في الطرق التي تقوم بها الخلايا النباتية والحيوانية بهذا. تعد Plasmodesmata (المفرد = plasmodesma) تقاطعات بين الخلايا النباتية ، في حين تشتمل ملامسات الخلايا الحيوانية على الوصلات الضيقة والفجوة ، و desmosomes.

بشكل عام ، لا تستطيع الامتدادات الطويلة لأغشية البلازما للخلايا النباتية المجاورة أن تلمس بعضها البعض لأنها مفصولة بجدران الخلايا المحيطة بكل خلية. تعد Plasmodesmata قنوات عديدة تمر بين جدران الخلايا للخلايا النباتية المجاورة ، وتربط السيتوبلازم بها وتمكين جزيئات الإشارة والمغذيات من الانتقال من خلية إلى أخرى (الشكل 3.17)أ).

التقاطع المحكم هو ختم مانع لتسرب المياه بين خليتين حيوانيتين متجاورتين (الشكل 3.17ب). تمسك البروتينات الخلايا بإحكام ضد بعضها البعض. هذا الالتصاق المحكم يمنع المواد من التسرب بين الخلايا. توجد التقاطعات الضيقة عادةً في النسيج الظهاري الذي يبطن الأعضاء الداخلية والتجاويف ، ويشكل معظم الجلد. على سبيل المثال ، تمنع التقاطعات الضيقة للخلايا الظهارية المبطنة للمثانة البول من التسرب إلى الفضاء خارج الخلية.

توجد أيضًا في الخلايا الحيوانية فقط ديسموسومات ، والتي تعمل مثل اللحامات الموضعية بين الخلايا الظهارية المجاورة (الشكل 3.17)ج). إنها تحافظ على الخلايا معًا في تكوين يشبه الصفيحة في الأعضاء والأنسجة التي تتمدد ، مثل الجلد والقلب والعضلات.

تقاطعات الفجوات في الخلايا الحيوانية هي مثل plasmodesmata في الخلايا النباتية من حيث أنها قنوات بين الخلايا المجاورة التي تسمح بنقل الأيونات والمواد المغذية والمواد الأخرى التي تمكن الخلايا من التواصل (الشكل 3.17)د). ومع ذلك ، من الناحية الهيكلية ، تختلف الوصلات الفاصلة بين الفجوات والنصوص الوصفية.

مكون الخلية وظيفة موجود في بدائيات النوى؟ موجود في الخلايا الحيوانية؟ موجود في الخلايا النباتية؟
غشاء بلازمي يفصل الخلية عن البيئة الخارجية يتحكم في مرور الجزيئات العضوية والأيونات والماء والأكسجين والنفايات داخل وخارج الخلية نعم نعم نعم
السيتوبلازم يوفر بنية لموقع الخلية للعديد من التفاعلات الأيضية التي توجد فيها العضيات نعم نعم نعم
نوكليويد موقع الحمض النووي نعم لا لا
نواة عضية الخلية التي تحتوي على الحمض النووي وتوجه تخليق الريبوسومات والبروتينات لا نعم نعم
الريبوسومات تخليق البروتين نعم نعم نعم
الميتوكوندريا إنتاج ATP / التنفس الخلوي لا نعم نعم
بيروكسيسومات يؤكسد ويفتت الأحماض الدهنية والأحماض الأمينية ويزيل السموم لا نعم نعم
الحويصلات والفراغات تخزين ونقل وظيفة الجهاز الهضمي في الخلايا النباتية لا نعم نعم
جسيم مركزي دور غير محدد في انقسام الخلايا في الخلايا الحيوانية لتنظيم مركز الأنابيب الدقيقة في الخلايا الحيوانية لا نعم لا
الجسيمات المحللة هضم الجزيئات الكبيرة وإعادة تدوير العضيات البالية لا نعم لا
جدار الخلية حماية ودعم هيكلي وصيانة لشكل الخلية نعم ، الببتيدوغليكان بشكل أساسي في البكتيريا ولكن ليس في العتائق لا نعم ، السليلوز في المقام الأول
البلاستيدات الخضراء البناء الضوئي لا لا نعم
الشبكة الأندوبلازمية يعدل البروتينات ويصنع الدهون لا نعم نعم
جهاز جولجي يقوم بتعديل وفرز ووسم وحزم وتوزيع الدهون والبروتينات لا نعم نعم
الهيكل الخلوي يحافظ على شكل الخلية ، ويؤمن العضيات في مواضع محددة ، ويسمح للسيتوبلازم والحويصلات بالتحرك داخل الخلية ، ويمكّن الكائنات أحادية الخلية من التحرك بشكل مستقل نعم نعم نعم
الأسواط الحركة الخلوية بعض بعض لا ، باستثناء بعض الحيوانات المنوية النباتية.
أهداب الحركة الخلوية ، حركة الجزيئات على طول السطح خارج الخلية لغشاء البلازما ، والترشيح لا بعض لا

يوفر هذا الجدول مكونات الخلايا بدائية النواة وحقيقية النواة ووظائف كل منها.


مناقشة

توفر دراستنا رؤى مهمة حول التنظيم الزماني المكاني للكروموكينيسين ، Kif4A ، في الانقسام المبكر. نظهر أن فسفرة Cdk لـ Kif4A ترخص توطين الكروموسوم الخاص بها. يعمل Kif4A ، بدوره ، باعتباره كروموكينيسين ، وينظم تكاثف الكروموسوم ، وديناميكيات MT ، ومورفولوجيا المغزل ، وتضامن / محاذاة الكروموسوم التي تعتبر مهمة للتقدم الانقسامي المبكر. يرتبط Kif4A المرتبط بالكروموسوم المرخص به Cdk بـ CAP-G و SMC2 لتعزيز تكاثف الكروموسوم من خلال المشاركة في تنظيم الاعتماد المتبادل لـ Kif4A و SMC2 على الكروموسومات للضغط الجانبي لأذرع الكروموسوم (الشكل 5) (Samejima et al. ، 2012 ). علاوة على ذلك ، يشارك Kif4A المرتبط بالكروموسوم المرخص لـ Cdk في تنظيم ديناميكيات MT ، ومورفولوجيا المغزل ، وتضامن الكروموسوم / المحاذاة المطلوبة للتقدم الانقسامي المبكر. ينسق Kif4A المرتبط بالكروموسوم مع Kid لتوليد PEF و / أو الحد من استطالة MTs المرتبطة بالكروموسوم بالقرب من الكروموسومات (الشكل 4) (Hu et al. ، 2011 Wandke et al. ، 2012). ومع ذلك ، فإن استهداف Kif4A TA غير القابل للفوسفوري للكروموسومات عن طريق اندماج Kif4A TA مع هيستون H1 ، يمكن أن يعيد الوظائف الانقسامية المبكرة لـ Kif4A في الخلايا المستنفدة من Kif4A الذاتية (الشكل 6). وبالتالي ، كان توطين كروموسوم Kif4A المرخص به Cdk أمرًا حاسمًا للوظائف الانقسامية المبكرة لـ Kif4A والتقدم الانقسامي المبكر.

أظهرت الدراسات السابقة أنه ، كعوامل تعزيز الانقسام ، قامت Cdks بالانقسام الفسفوري المتعدد G2 / M والمنظمين الانقسامي المبكر ، والتحكم في توزيعها الخلوي وأنشطتها ووظيفتها التي كانت حاسمة بالنسبة لـ G2 / M السليم والتقدم الانقسامي المبكر (Malik et al. ، 2009 فيشر وآخرون ، 2012). بصفته كروموكينيسين ، يشارك Kif4A في التحكم في تكاثف الكروموسوم وتضارب / محاذاة الكروموسوم في الانقسام المبكر. تكشف نتائجنا أن Kif4A يتم فسفرته بواسطة Cdk في مجاله الذيل (T1161) وأن فسفرة Cdk لـ Kif4A ينظم توطين كروموسوم Kif4A في الانقسام المبكر.

Kif4A (ومثيلاتها عبر الأنواع XKpl1 في Xenopus و Klp3A في ذبابة الفاكهة) يحتوي على اثنين من الأشكال المحفوظة لربط الحمض النووي ، وعزر سحاب الليوسين في منطقة ساقها وعزف غني بالسيستين في مجال ذيله ، والذي ثبت أنه ضروري لنشاط ربط الكروماتين لـ Kif4A والتوطين اللاحق للكروموسوم لـ Kif4A في الانقسام ( Hu et al.، 2011 Wandke et al.، 2012). تظهر دراساتنا أن فسفرة Cdk لـ Kif4A في مجالها الخلفي (T1161) ترخص فقط توطين الكروموسوم لـ Kif4A ولكنها ليست مطلوبة لوظائفها المرتبطة بالكروموسوم. نظرًا لأن Kif4A TA -Histone H1 يعمل بكامل طاقته ، فإننا نقترح أن فسفرة Cdk لـ Kif4A في T1161 قد تؤثر على التشكل الكلي لجزيء Kif4A ، وتصور أشكال ربط الحمض النووي لـ Kif4A بالحمض النووي / الكروموسومات و / أو المرتبطة بـ condensin I (CAP- G / SMC2) (Takahashi et al. ، 2016) ، يروج لارتباط Kif4A بالكروموسومات في الانقسام المبكر. بمجرد توطين Kif4A على الكروموسومات ، فإن Kif4A المرتبط بالكروموسوم ، بغض النظر عما إذا كان T1161 مُفسفرًا ، سيتعاون مع condensin I لضغط أذرع الكروموسوم جانبياً لتكثيف الكروموسوم. وفي الوقت نفسه ، فإن تكاثف الكروموسوم / ضغط ذراع الكروموسوم سيعزز ارتباط Kif4A بأذرع الكروموسوم بشكل جانبي. سيعمل Kif4A المرتبط بأذرع الكروموسومات الجانبية كمحرك يعتمد على MT مع نشاط MT plus-end "السد" لتنظيم ديناميكيات MTs المرتبطة بالكروموسوم. يمكن لـ Kif4A المرتبط بالكروموسوم التحكم في ديناميكيات MTs المرتبطة بالكروموسوم من أجل التكوين السليم وديناميكيات المغزل الانقسامي في الانقسام المبكر و / أو التنسيق مع البروتينات الحركية الانقسامية الأخرى ، مثل Kid و Kif18A و CENP-E و dynein ، من أجل تكتل الكروموسوم / المحاذاة (Stumpff et al.، 2012 Wandke et al.، 2012 Barisic et al.، 2014 Iemura and Tanaka، 2015).

مجتمعة ، توضح نتائجنا المقدمة في هذه الدراسة أن الفسفرة Cdk ترخص توطين الكروموسومات لـ Kif4A والتوطين الكروموسومي لـ Kif4A ، بدورها ، تتحكم في الوظائف الانقسامية المبكرة لـ Kif4A المهمة للتقدم الانقسامي المبكر المناسب.


الانتماءات

كلية علوم الحياة ، جامعة تشجيانغ ، هانغتشو ، 310058 ، جمهورية الصين الشعبية

ديان فو تشين ، تشنغ لين ، هونغ ليانغ وانغ ، لي زانغ ، لي داي ، شنغ نان جيا ، جين شو يانغ ، فان يانغ ، هيروميتشي ناجاساوا وأمبير وي-جون يانغ

المختبر الرئيسي لبيولوجيا الحفظ للحياة البرية المهددة بالانقراض التابع لوزارة التعليم ، جامعة تشجيانغ ، هانغتشو ، 310058 ، جمهورية الصين الشعبية

المختبر الرئيسي لكيمياء البروتين وعلم الأحياء التنموي بوزارة التعليم الحكومية الصينية ، كلية علوم الحياة ، جامعة هونان نورمال ، تشانغشا ، 410018 ، جمهورية الصين الشعبية

مختبر تيانجين الرئيسي لمقاومة الحيوانات والنباتات ، كلية علوم الحياة ، جامعة تيانجين نورمال ، تيانجين ، 300387 ، جمهورية الصين الشعبية

قسم البيولوجيا الجزيئية والخلوية ومختبر بوديجا البحري ، جامعة كاليفورنيا ، ديفيس ، خليج بوديجا ، كاليفورنيا ، 94923 ، الولايات المتحدة الأمريكية

قسم الكيمياء البيولوجية ، جامعة طوكيو ، يايوي ، بونكيو ، طوكيو ، 113-8657 ، اليابان


شاهد الفيديو: الجزيئات البيولوجية الكبيرة - البروتينات - مع بعض نفهمها (قد 2022).


تعليقات:

  1. Ponce

    برافو ، إنها مجرد فكرة رائعة

  2. Flannagain

    هذا بعيد عن الأخبار ، قرأت عنها قبل شهرين.

  3. Wardley

    انها ليست منخفضة حقا

  4. Dennie

    بشكل ملحوظ ، هذا الرأي المضحك



اكتب رسالة