معلومة

كيف يكتشف العلماء مستضد جديد وحاتمة؟

كيف يكتشف العلماء مستضد جديد وحاتمة؟


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

لقد وجدت بعض قواعد البيانات على الإنترنت التي تسرد جميع المستضدات المكتشفة وحلقاتها. إذن كيف يكتشف العلماء مستضدًا جديدًا؟ هل يحاولون حقنها في الجسم لمعرفة ما إذا كانت تسبب استجابة مناعية أم لا؟ وأخيرًا ، إذا كان مستضدًا ، فكيف يعرفون حواتمهم؟


حسنًا ، لديك بعض الأسئلة المبنية فوق بعضها البعض (أعدت صياغة الأسئلة من أجل الوضوح):

كيف يكتشف العلماء مستضد جديد؟

هناك عدة طرق لذلك ، والتي يتم تطبيقها لأغراض مختلفة.

من أجل اكتشاف أ مستضد طبيعي، الذي يتعرف عليه الجسم المضاد الذي ينتجه الجهاز المناعي عادة ، يمكن للمرء أن يحصل أولاً على هذا الجسم المضاد المحدد. سيكون هذا نهجًا لإعادة إنتاج أو فهم الاستجابة الفعالة لجهاز المناعة ضد العامل الممرض (مثل الفيروس).

من أجل الحصول على الجسم المضاد (وبشكل مثالي تسلسل الحمض النووي المشفر له) ، يتعين على الباحثين استخدام العامل الممرض ، أو أجزاء منه ، والعثور على الأجسام المضادة (أو الخلايا البائية) التي ترتبط به. للقيام بذلك ، يمكن تثبيت العامل الممرض (الجسيمات) في عمود وبعد مرور الدم عبر العمود ، ستبقى الأجسام المضادة والخلايا البائية في العمود. ثم يمكن أن يكون الحمض النووي لهذه الخلايا متواليات ، أو يمكن تنقية الجسم المضاد بشكل أكبر.

ومع ذلك ، في معظم الحالات ، يرغب العلماء في العثور على جسم مضاد لم يكن موجودًا بعد ضد مستضد ، مما يقودنا إلى:

هل يحاول العلماء حقن مستضدات في الجسم لمعرفة ما إذا كانت تسبب استجابة مناعية أم لا؟

نعم ، يتم ذلك - ولكن فقط مع الحيوانات (معظمها الفئران والأرانب والماعز). يمكن استخلاص الأجسام المضادة متعددة النسيلة مباشرة من دم هذه الحيوانات ، ولكن في أغلب الأحيان تكون الأجسام المضادة وحيدة النسيلة ضرورية للأغراض البحثية أو الطبية. تعتبر العملية المطلوبة لهذه العملية أكثر تعقيدًا ، ولكنها تؤدي إلى خطوط خلوية يمكن استخدامها بعد ذلك لإنتاج الجسم المضاد المطلوب بكميات أكبر.

كيف يعرف العلماء الحاتمة المقابلة لجسم مضاد؟

توجد طرق متعددة للعثور على الحاتمة الدقيقة للجسم المضاد ، وكلها توصف عادة بأنها رسم خرائط حاتمة.

تعتمد الطرق الأكثر شيوعًا إما على الطفرات الموجهة للموقع لمولد الضد لمعرفة المواضع (الأحماض الأمينية) الحاسمة لربط الجسم المضاد ، أو على شظايا الببتيد من مولد الضد ، والتي لا يزال من الممكن ربطها بالجسم المضاد.


أود فقط أن أضيف إلى إجابة نيكولاي.

ما هو المستضد؟

أولاً ، قال نيكولاي هذا ، لكني أريد فقط أن أوضح ، المستضد هو أي شيء تربطه الأجسام المضادة. هذا يختلف عن و مناعة وهو نوع من المستضدات التي تجعل جهاز المناعة لديك ينتج أجسامًا مضادة. لكن ليس بالضرورة أن يكون المستضد من العوامل المناعية.

الببتيدات والسكريات والأحماض النووية والدهون كلها مستضدات شائعة ، ولكن ربما تكون الببتيدات أكثر ما تعرفه. عادة ، تواجه معظم السكريات والدهون صعوبة في إنتاج استجابة مناعية من تلقاء نفسها وعادة ما تقترن بالبروتين (الببتيد). هذا منطقي لأن جسمك ينتج بشكل طبيعي الكثير من السكريات والدهون وإذا صنعت أجسامًا مضادة لها جميعًا ، فسوف ينتهي بها الأمر بمهاجمة نفسها.

كيف يتم اكتشاف مستضد؟

هناك طريقتان للتعامل مع هذا.

  1. نهج الجسم المضاد أولا

لنفترض أن شخصًا ما أصيب بفيروس غير معروف ولكن انتهى به الأمر إلى البقاء على قيد الحياة. ستكون الخطوة التالية هي القيام بأمرين:

  • زرع الفيروس حتى يتمكن العلماء من دراسته في المختبر. تحتاج إلى استنبات معظم الفيروسات حتى تتمكن من زراعة كمية غير محدودة في المختبر. سيكون من الصعب حقًا الخروج والعثور بشكل طبيعي على كل الفيروسات التي تحتاجها لدراستها.

  • النمط الجيني للفيروس. من الضروري معرفة الجينوم الفيروسي حتى نتمكن من معالجة الجينات ومعرفة تأثيرها.

يمكننا البدء في إجراء تغييرات على الفيروس بتغيير مكونات مختلفة من الجينوم. يمكننا أن نرى كيف يغير ذلك الارتباط بمصل المريض ، نظرًا لأن المصل يحتوي على أجسام مضادة من شأنها أن تربط الفيروس ، فإن المصل غالبًا ما يحيد أو يختبر إيجابيًا للأجسام المضادة الملزمة. الآن إذا قمنا بتغيير الجين A من الفيروس وما زال المصل يرتبط / يحيد ، يمكننا أن نفترض أن الجين A ليس هو المستضد الذي صنع استجابة مناعية لدى المريض. إذا تحور الجين B وتوقف المصل عن الارتباط ، فيمكننا افتراض أن الجين B هو مستضد الفيروس المجهول.

  1. نهج المستضد الأول

إذا كان لدينا الفيروس فقط وليس لدينا مريض مصاب ، فسنضطر إلى حقنه في الكائنات الحية النموذجية لمعرفة المستضد. ومع ذلك ، نظرًا لأننا نعرف عددًا لا يُصدق من الأنواع الفيروسية ، يمكننا على الأرجح تخمين أفضل ما هو مكون مستضد الفيروس.

على سبيل المثال ، في عام 2012 ، عندما مرض مريض ، قاموا بوضع تسلسل لفيروس فيه وجد أنه قريب من فيروس كورونا. نظرًا لأنهم يعرفون أن المستضد الأساسي لفيروس كورونا هو بروتين سبايك ، فقد افترضوا بحق أن الجين المرتبط ارتباطًا وثيقًا ببروتين سبايك للفيروس المجهول كان أيضًا المستضد الأساسي. تبين أن هذا الفيروس هو فيروس كورونا المسبب لمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية والذي يعتبر بروتين سبايك المستضد الرئيسي له.


يجد علماء معهد سكريبس للأبحاث نقطة جديدة للهجوم على فيروس نقص المناعة البشرية لتطوير اللقاح

صورة: اكتشف فريق في معهد سكريبس للأبحاث موقعًا جديدًا معرضًا للإصابة بفيروس نقص المناعة البشرية. الموضح هنا عبارة عن إعادة بناء مجهرية إلكترونية لماكينة تقليم البروتين السكري لمغلف HIV-1. عرض المزيد

الائتمان: صورة كريستينا كورباتشي ، بإذن من معهد سكريبس للأبحاث.

لا جولا ، كاليفورنيا - 24 أبريل 2014 - اكتشف فريق بقيادة علماء في معهد سكريبس للأبحاث (TSRI) يعمل مع مبادرة لقاح الإيدز الدولية (IAVI) موقعًا جديدًا معرضًا للإصابة بفيروس نقص المناعة البشرية. يمكن أن تهاجم الأجسام المضادة البشرية الموقع الذي تم تحديده حديثًا بطريقة تحيد عدوى مجموعة واسعة من سلالات فيروس نقص المناعة البشرية.

قال دينيس آر بيرتون ، الأستاذ في قسم المناعة والعلوم الميكروبية في TSRI: "فيروس نقص المناعة البشرية لديه عدد قليل جدًا من مواقع الضعف المعروفة ، ولكن في هذا العمل وصفنا موقعًا جديدًا ، ونتوقع أنه سيكون مفيدًا في تطوير لقاح". والمدير العلمي لمركز IAVI Neutralising Antibody Center (NAC) ومركز المعاهد الوطنية للصحة لمناعة لقاح فيروس نقص المناعة البشرية / الإيدز واكتشاف المناعة (CHAVI-ID) في حرم جامعة TSRI في لا جولا.

قال إيان أ.ويلسون ، أستاذ البيولوجيا الإنشائية ورئيس قسم البيولوجيا الهيكلية والحاسوبية وعضو معهد Skaggs للبيولوجيا الكيميائية في جامعة TSRI وعضو في NAC و CHAVI-ID.

تم الإبلاغ عن النتائج في ورقتين - الأولى بقيادة بيرتون والثانية بقيادة الأستاذ المساعد في TSRI أندرو ب. وارد ، وهو أيضًا عضو في NAC و CHAVI-ID ، وويلسون - ظهرت في عدد مايو من المجلة. حصانة.

هذا الاكتشاف هو جزء من جهد كبير برعاية IAVI والمعاهد الوطنية للصحة لتطوير لقاح فعال ضد فيروس نقص المناعة البشرية. مثل هذا اللقاح سيعمل عن طريق استنباط استجابة مناعية قوية وطويلة الأمد ضد المواقع المعرضة للخطر المحفوظة على الفيروس - المواقع التي لا تختلف كثيرًا من سلالة إلى سلالة ، والتي ، عندما يمسكها جسم مضاد ، تترك الفيروس غير قادر على القيام بذلك. تصيب الخلايا.

يخفي فيروس نقص المناعة البشرية بشكل عام هذه المواقع المحمية المعرضة للخطر تحت طبقة كثيفة من السكريات التي يصعب استيعابها والأجزاء سريعة التحور من سطح الفيروس. يتم توجيه الكثير من استجابة الجسم المضاد للعدوى ضد الأجزاء سريعة التحور وبالتالي فهي فعالة بشكل عابر فقط.

قبل الاكتشافات الجديدة ، كان العلماء قادرين على تحديد مجموعات قليلة مختلفة فقط من الأجسام المضادة "المحايدة على نطاق واسع" ، القادرة على الوصول إلى أربعة مواقع معرضة للخطر محفوظة على الفيروس. كل هذه المواقع موجودة على مستضد السطح المكشوف الوحيد لفيروس نقص المناعة البشرية ، وهو بروتين مغلف (Env) يشبه الزهرة (gp140) ينبت من الغشاء الفيروسي وهو مصمم لانتزاع الخلايا المضيفة واختراقها.

بدأ تحديد الموقع الجديد المعرض للخطر على الفيروس باختبارات عينات الدم من بروتوكول IAVI G ، حيث اشتركت IAVI و NAC التابع لها مع مراكز البحوث السريرية في إفريقيا والهند وتايلاند وأستراليا والمملكة المتحدة والولايات المتحدة لجمع عينات دم من أكثر من 1800 متطوع سليم مصاب بفيروس نقص المناعة البشرية للبحث عن الأجسام المضادة النادرة والمعادلة على نطاق واسع. تبين بالفعل أن المصل المأخوذ من مجموعة صغيرة من العينات يمنع العدوى ، في خلايا الاختبار ، لمجموعة واسعة من عزلات فيروس نقص المناعة البشرية ، مما يشير إلى وجود أجسام مضادة معادلة على نطاق واسع. في عام 2009 ، نجح علماء من IAVI و TSRI و Theraclone Sciences في عزل وتوصيف أول أضداد جديدة معادلة على نطاق واسع لفيروس نقص المناعة البشرية شوهدت خلال عقد من الزمان.

سرعان ما عثرت إميليا فالكوسكا ، الباحثة المشاركة في مختبر بيرتون والتي كانت مؤلفة رئيسية للورقة الأولى ، وزملاؤها على مجموعة من ثمانية أجسام مضادة مرتبطة ارتباطًا وثيقًا تمثل معظم نشاط تحييد فيروس نقص المناعة البشرية في العينة. توصل العلماء إلى أن أوسع اثنين من المعادلات بين هذه الأجسام المضادة ، PGT151 و PGT152 ، يمكن أن يمنع انتقال العدوى لحوالي ثلثي مجموعة كبيرة من سلالات فيروس نقص المناعة البشرية الموجودة في المرضى في جميع أنحاء العالم.

من الغريب أنه على الرغم من قدرتها الواسعة على التحييد ، فإن هذه الأجسام المضادة لم ترتبط بأي مواقع أو حواتم تم وصفها سابقًا على Env - وفشلت بالفعل في الارتباط بإحكام في أي مكان على نسخ مطهرة من gp120 أو gp41 ، وهما وحدتا البروتين الفرعيتان لـ Env. ترتبط معظم الأجسام المضادة لفيروس نقص المناعة البشرية الموصوفة سابقًا بشكل واسع بإحدى الوحدات الفرعية Env أو الأخرى. ومع ذلك ، قرر الباحثون في النهاية أن PGT151 و PGT152 لا يرتبطان فقط بـ gp120 أو gp41 ولكن بقطعتيهما.

في الواقع ، يتجمع gp120 و gp41 في بنية Env ليس كمزيج واحد gp120-gp41 ولكن كثالثة متشابكة - أداة تقليم ، في لغة علماء الأحياء. اتضح أن PGT151 و 152 (وهما متماثلان تقريبًا) لهما موقع ربط يحدث فقط في هيكل مقصورة Env الناضج والمجمع بشكل صحيح.

قال فالكوسكا: "هذه هي الأجسام المضادة الأولى التي تحيد فيروس نقص المناعة البشرية التي وجدناها والتي تميز بشكل لا لبس فيه Env trimer الناضج عن جميع أشكال Env الأخرى". "هذا مهم لأن هذا هو شكل Env الذي يستخدمه الفيروس لإصابة الخلايا."

كانت الدراسة الثانية من الدراستين الجديدتين عبارة عن تحليل هيكلي أولي للحلقة الضعيفة الجديدة.

باستخدام نهج تكاملي يجمع بين الفحص المجهري الإلكتروني في مجمع Env trimer مع PGT151 (بقيادة مختبر وارد) مع هيكل PGT151 Fab بواسطة علم البلورات بالأشعة السينية (بقيادة مختبر ويلسون) ، تمكن العلماء من تصور الموقع من موقع ربط سلسلة PGT151 على أداة تقليم Env - والتي تتضمن بقعة على بروتين واحد gp41 مع سكرين مرتبطين (جليكانات) ، وتصحيح على بروتين gp120 وحتى قطعة من gp41 المجاورة داخل هيكل أداة القطع - " قالت كلوديا بلاتنر ، باحثة مساعدة في مختبر ويلسون في TSRI وعضو في مركز IAVI Neutralising Antibody Center الذي كان ، جنبًا إلى جنب مع طالب الدراسات العليا Jeong Hyun Lee ، المؤلف الأول للورقة الثانية.

كان الاكتشاف المفاجئ هو أن الأجسام المضادة من سلسلة PGT151 ترتبط بأداة تقليم Env بطريقة تعمل على استقرار بنيتها الهشة بخلاف ذلك. قال وارد: "عادةً عندما تحاول تنقية أداة تقليم Env الأصلية ، فإنها تنهار ، مما يجعل من الصعب جدًا دراستها". "لقد كان اختراقًا رئيسيًا للعثور على الجسم المضاد الذي يعمل على استقراره."

على الرغم من أن موقع PGT151 ذو قيمة في حد ذاته كنقطة هجوم للقاح فيروس نقص المناعة البشرية ، إلا أن اكتشافه يلمح أيضًا إلى وجود حواتم أخرى معقدة وهشة على فيروس نقص المناعة البشرية.

بالإضافة إلى العلماء المذكورين أعلاه ، فإن المساهمين في الورقة الأولى ، "تحييد الأجسام المضادة لفيروس نقص المناعة البشرية على نطاق واسع تحدد حاتمة جديدة تعتمد على الغليكان على التشكل المسبق للانصهار لـ gp41 على قواطع المغلف المشقوقة ،" هم أليخاندرا راموس ، وجيونج هيون لي ، وتشي - هوي ليانج وباسكال بوينارد ، وجميعهم من TSRI و IAVI Neutralising مركز الأجسام المضادة ، أليخاندرو راميريز ، وريان ماكبرايد ، ومايكل ب.زويك ، وجيمس سي.بولسون من TSRI Katie J. جيلز وروجر دبليو ساندرز من المركز الطبي الأكاديمي ، أمستردام ساشين إس شيفاتاري ، تشونج يي وو وتشي هيوي وونج من أكاديميا سينيكا ، تايبيه ، تايوان بو يينج تشان هوي ، وكريستين سويدريك من شركة Theraclone Sciences ، سياتل يان ليو وتين فيزي من إمبريال كوليدج لندن مايكل إس سيمان من مركز ديكونيس الطبي في بوسطن جون بي مور من كلية طب وايل بجامعة كورنيل ووين سي كوف من IAVI في مدينة نيويورك.

المساهمون في الورقة الثانية ، "التحديد الهيكلي للحلقة الرباعية التي تعتمد على الانقسام في واجهة gp41-gp120 على أدوات تقليم HIV-1 Env السليمة" ، بما في ذلك Kwinten Sliepen و Ronald Derking و Alba Torrents de la Pe & # 241a و Marit van جيلز وروجر دبليو ساندرز من المركز الطبي الأكاديمي ، أمستردام ألبرت كوبو وجون بي مور من كلية طب ويل بجامعة كورنيل ، جان فيليب جوليان وباسكال بوينارد من TSRI و IAVI Neutralising مركز الأجسام المضادة و Wenjie Peng و James C. TSRI.

جاء تمويل الدراسة الأولى من المعهد الوطني للصحة IAVI والمعاهد الوطنية للصحة (منحة AI33232 ، HIVRAD P01 AI82362) المركز الممول من المعاهد الوطنية للصحة لفيروس نقص المناعة البشرية / الإيدز لقاح المناعة واكتشاف المناعة (CHAVI-ID) (منحة UM1AI100663) معهد راجون في ماساتشوستس العام Hospital، MIT and Harvard and the Aids Fonds Netherlands (منح # 2011032 ، # 2012041).

تم توفير التمويل للدراسة الثانية من قبل IAVI و CHAVI-ID (UM1 AI100663) NIH (P30AI036214 و HIVRAD P01 AI082362 و R01 AI084817) وجامعة كاليفورنيا ومركز سان دييغو لأبحاث الإيدز وبرنامج كاليفورنيا لبحوث الإيدز وفيروس نقص المناعة البشرية (الإيدز) في هولندا ( المنحة رقم 2011032) المنظمة الهولندية للبحث العلمي ومجلس البحث الأوروبي وخدمة التبادل الأكاديمي الألمانية.

نشأ تمويل IAVI لهذا العمل جزئيًا من الوكالة الأمريكية للتنمية الدولية (USAID). تدير الوكالة الأمريكية للتنمية الدولية برنامج المساعدة الخارجية الذي يقدم مساعدات اقتصادية وإنسانية في أكثر من 120 دولة حول العالم.

حول معهد سكريبس للأبحاث

معهد سكريبس للأبحاث (TSRI) هو أحد أكبر المنظمات المستقلة غير الهادفة للربح في العالم التي تركز على البحث في العلوم الطبية الحيوية. TSRI معترف به دوليًا لمساهماته في العلوم والصحة ، بما في ذلك دوره في وضع الأساس لعلاجات جديدة للسرطان والتهاب المفاصل الروماتويدي والهيموفيليا وأمراض أخرى. مؤسسة نشأت من عيادة Scripps Metabolic Clinic التي أسستها فاعلة الخير إلين براوننج سكريبس في عام 1924 ، يوظف المعهد الآن حوالي 3000 شخص في حرمها الجامعي في لا جولا ، كاليفورنيا ، وجوبيتر ، فلوريدا ، حيث العلماء المشهورون - بما في ذلك ثلاثة من الحائزين على جائزة نوبل- - العمل على اكتشافاتهم القادمة. يُصنف برنامج الدراسات العليا بالمعهد ، الذي يمنح درجات الدكتوراه في علم الأحياء والكيمياء ، بين العشرة الأوائل من نوعها في البلاد. لمزيد من المعلومات ، راجع http: // www. سكريبس. ايدو.

المبادرة الدولية للقاح الإيدز (IAVI) هي منظمة عالمية غير هادفة للربح تتمثل مهمتها في ضمان تطوير لقاحات فيروس نقص المناعة البشرية الآمنة والفعالة والمتاحة والوقائية لاستخدامها في جميع أنحاء العالم. تأسست في عام 1996 ، تعمل IAVI مع شركات خاصة وأكاديميين وشركاء من المجتمع المدني في 25 دولة للبحث عن لقاحات الإيدز وتصميمها وتطويرها. بالإضافة إلى ذلك ، تجري مبادرة IAVI تحليلات للسياسات وتعمل كمدافع عن مجال لقاح الإيدز. تدعم مبادرة IAVI نهجًا شاملاً للتصدي لفيروس نقص المناعة البشرية والإيدز يوازن بين التوسع في برامج الوقاية والعلاج الحالية من فيروس نقص المناعة البشرية وتعزيزها مع الاستثمارات المستهدفة في تصميم وتطوير أدوات جديدة للوقاية من فيروس نقص المناعة البشرية. إن مبادرة IAVI مكرسة لضمان أن لقاح الإيدز في المستقبل سيكون متاحًا ومتاحًا لكل من يحتاج إليه.

أصبح عمل IAVI ممكنًا بفضل الدعم السخي من العديد من المانحين بما في ذلك: مؤسسة بيل وميليندا غيتس ، وزارة الخارجية الدنماركية ، المعونة الأيرلندية ، وزارة المالية اليابانية ، وزارة الخارجية الهولندية ، الوكالة النرويجية للتعاون الإنمائي (نوراد) ) وزارة التنمية الدولية بالمملكة المتحدة (DFID) ، والوكالة الأمريكية للتنمية الدولية (USAID). القائمة الكاملة للمتبرعين IAVI متاحة على http: // www. iavi. غزاله. أصبحت هذه الدراسات ممكنة جزئيًا بفضل الدعم السخي للشعب الأمريكي من خلال الوكالة الأمريكية للتنمية الدولية. المحتويات هي مسؤولية المؤلفين ولا تعكس بالضرورة آراء الوكالة الأمريكية للتنمية الدولية أو حكومة الولايات المتحدة.

تنصل: AAAS و EurekAlert! ليست مسؤولة عن دقة النشرات الإخبارية المرسلة على EurekAlert! من خلال المؤسسات المساهمة أو لاستخدام أي معلومات من خلال نظام EurekAlert.


في لمحة

مستضدات فصيلة الدم Rh

عدد المستضدات 49: D و C و E و c و e هي من بين أهمها
خصوصية المستضد بروتين
يحدد تسلسل الأحماض الأمينية خصوصية معظم مستضدات Rh.
الجزيئات الحاملة للمستضد بروتينات ذات وظيفة غير معروفة
بروتينات RhD و RhCE كلاهما عبارة عن بروتينات متعددة الكتلة عبر الغشاء جزء لا يتجزأ من غشاء كرات الدم الحمراء. يقوم بروتين RhCE بترميز مستضد C / c (في الحلقة الثانية خارج الخلية) ومستضد E / e (في الحلقة الرابعة خارج الخلية) ، بالإضافة إلى العديد من مستضدات Rh الأخرى مثل C w و C x.
على عكس معظم جزيئات سطح الخلية ، فإن بروتينات Rh ليست غليكوزيلاتي (لا تحتوي على سكريات قليلة) لكنها مرتبطة ارتباطًا وثيقًا ببروتين سكري غشاء RBC يسمى RhAG. قد تتضمن وظيفة مركب Rh-RhAG نقل الأمونيوم أو ثاني أكسيد الكربون. يقوم بروتين RhD بترميز مستضد D.
الأساس الجزيئي يقوم جينان ، RHD و RHCE ، بترميز مستضدات Rh.
إن جينات Rh متطابقة بنسبة 97٪ ، وتقع بجانب بعضها البعض على الكروموسوم 1. ينشأ تعدد الأشكال D / d بشكل شائع من حذف جين RHD بأكمله. ينشأ تعدد الأشكال C / c من أربعة SNPs التي تسبب أربعة تغييرات في الأحماض الأمينية ، أحدها (S103P) يحدد خصوصية مستضد C أو c. ينشأ تعدد الأشكال E / e من SNP واحد (676G & # x02192C) يتسبب في تغيير حمض أميني واحد (A226P).
تواتر مستضدات Rhد: 85٪ قوقازيون ، 92٪ سود ، 99٪ آسيويون
ج: 68٪ قوقازيون ، 27٪ سود ، 93٪ آسيويون
ه: 29٪ قوقازيون ، 22٪ سود ، 39٪ آسيويون
ج: 80٪ قوقازيون ، 96٪ سود ، 47٪ آسيويون
ه: 98٪ قوقازيون ، 98٪ سود ، 96٪ آسيويون (1)
تواتر الأنماط الظاهرية RhRh النمط الفرداني DCe: الأكثر شيوعًا عند القوقازيين (42٪) والأمريكيين الأصليين (44٪) والآسيويين (70٪)
Rh النمط الفرداني Dce: الأكثر شيوعًا عند السود (44٪)
النمط الظاهري Rh D السلبي: الأكثر شيوعًا عند القوقازيين (15٪) ، وأقل شيوعًا عند السود (8٪) ، ونادرًا عند الآسيويين (1٪) (1)

إنتاج الأجسام المضادة ضد مستضدات Rh

نوع الجسم المضاد بشكل رئيسي IgG ، وبعض IgM
غالبية الأجسام المضادة لـ Rh من النوع IgG.
تفاعل الجسم المضاد قادر على انحلال الدم
نادرا ما تنشط الأجسام المضادة لـ Rh المكمل. يرتبطون بكريات الدم الحمراء ويصنفونها للتدمير في الطحال (انحلال الدم خارج الأوعية الدموية).
تفاعل نقل الدم نعم & # x02014 تفاعلات نقل الدم الانحلالي المتأخرة بشكل نموذجي
يمكن لمضادات D ، و Anti-C ، و Anti-e ، و Anti-C أن تسبب تفاعلات انحلالي شديدة في نقل الدم. عادة ما يكون انحلال الدم خارج الأوعية الدموية (1).
مرض انحلالي حديثي الولادة نعم & # x02014 السبب الأكثر شيوعًا لـ HDN.
يمثل مستضد D 50٪ من التلقيح الخيفي للأم (2).
يمكن أن تسبب مضادات دي ومضادات سي مرضًا شديدًا.
يمكن أن تسبب مضادات C و E و anti-e مرضًا خفيفًا إلى متوسط.

مستقبلات الخلايا التائية هي عبارة عن مغاير مغايرة للأجسام المضادة

نظرًا لأن استجابات الخلايا التائية تعتمد على الاتصال المباشر مع خلية تقديم مستضد أو خلية مستهدفة ، فإن مستقبلات المستضد التي تصنعها الخلايا التائية ، على عكس الأجسام المضادة التي تصنعها الخلايا البائية ، توجد فقط في شكل مرتبط بالغشاء ولا يتم إفرازها. لهذا السبب ، كان من الصعب عزل مستقبلات الخلايا التائية ، ولم يتم التعرف عليها لأول مرة باستخدام الكيمياء الحيوية حتى ثمانينيات القرن الماضي. على كل من الخلايا التائية السامة والخلايا المساعدة ، تكون المستقبلات مشابهة للأجسام المضادة. وهي تتألف من سلسلتين بولي ببتيد مرتبطتين بثاني كبريتيد (تسمى & # x003b1 و & # x003b2) ، تحتوي كل منها على مجالين شبيهين بـ Ig ، ومتغير واحد وثابت واحد (الشكل 24-42A). علاوة على ذلك ، تم تحديد البنية ثلاثية الأبعاد للجزء خارج الخلية لمستقبل الخلية التائية عن طريق حيود الأشعة السينية ، وهي تشبه إلى حد كبير ذراع واحد من جزيء الجسم المضاد على شكل Y (الشكل 24-42 ب).

الشكل 24-42

مغاير مستقبلات الخلايا التائية. (أ) رسم تخطيطي يوضح أن المستقبل يتكون من سلسلة بولي ببتيد & # x003b1 و a & # x003b2. يبلغ طول كل سلسلة حوالي 280 من الأحماض الأمينية وتحتوي على جزء كبير خارج الخلية مطوي إلى مجالين شبيهين بالـ Ig & # x02014one (المزيد).

تقع تجمعات المقاطع الجينية التي تشفر السلاسل & # x003b1 و & # x003b2 على كروموسومات مختلفة. مثل تجمعات الأجسام المضادة ثقيلة السلسلة ، تحتوي تجمعات مستقبلات الخلايا التائية منفصلة الخامس ، د ، و ي شرائح الجينات ، والتي يتم تجميعها عن طريق إعادة التركيب الخاص بالموقع أثناء نمو الخلايا التائية في الغدة الصعترية. باستثناء واحد ، تستخدم الخلايا التائية أيضًا جميع الآليات التي تستخدمها الخلايا البائية لتوليد تنوع الأجسام المضادة لتوليد تنوع مستقبلات الخلايا التائية. في الواقع ، نفس الشيء الخامس (د) ي recombinase ، بما في ذلك بروتينات RAG التي تمت مناقشتها سابقًا. الآلية التي لا تعمل في تنويع مستقبلات الخلايا التائية هي فرط طفح جسدي يحركه مستضد. وبالتالي ، فإن تقارب المستقبلات يظل منخفضًا (كأ

10 5-10 7 لتر / مول) ، حتى في وقت متأخر من الاستجابة المناعية. نناقش لاحقًا كيف تعمل العديد من المستقبلات المشتركة وآليات التصاق الخلايا الخلوية على تقوية ارتباط الخلية التائية بالخلية العارضة للمستضد أو الخلية المستهدفة ، مما يساعد على تعويض التقارب المنخفض لمستقبلات الخلايا التائية.

أقلية صغيرة من الخلايا التائية ، بدلاً من صنع سلاسل & # x003b1 و & # x003b2 ، تصنع نوعًا مختلفًا ولكن مرتبطًا به من مغاير مستقبلات ، يتألف من سلاسل & # x003b3 و & # x003b4. تظهر هذه الخلايا في وقت مبكر من التطور وتوجد بشكل رئيسي في الظهارة (في الجلد والأمعاء ، على سبيل المثال). وظائفهم غير مؤكدة ، ولن نناقشها بمزيد من التفصيل.

كما هو الحال مع مستقبلات المستضد على الخلايا البائية ، ترتبط مستقبلات الخلايا التائية ارتباطًا وثيقًا في غشاء البلازما بعدد من البروتينات المرتبطة بالغشاء التي تشارك في تمرير الإشارة من مستقبلات تنشيط المستضد إلى داخل الخلية. نناقش هذه البروتينات بمزيد من التفصيل لاحقًا. أولاً ، ومع ذلك ، نحتاج إلى النظر في كيفية عمل الخلايا التائية السامة والخلايا المساعدة والطرق الخاصة التي تتعرف من خلالها على المستضد الغريب.


تشغيل قوي على Enzolytics، Inc. (ENZC) التكنولوجيا الحيوية تنتج أجسامًا مضادة وحيدة النسيلة مضادة لـ SARS-CoV-2

تصعد شركة Enzolytics، Inc. (ENZC) الرسوم البيانية بارتفاع قوي يصل إلى 10 ملايين من حجم التداول يوميًا منذ انخفاض قصير دون علامة 0.25 يوم الخميس. تعد ENZC عداءًا رئيسيًا في الدوري ومخزونًا قويًا على مدار الأشهر القليلة الماضية ، وقد شهدت ENZC ارتفاعًا أسطوريًا إلى المستويات المرتفعة الأخيرة عند 0.958 لكل سهم حيث أنها تكمل الاندماج التاريخي بين BioClonetics و Enzolytics ، وقد تم ملاحظة التكنولوجيا الحيوية الجديدة نظرًا لتقنيتها لإنتاج الإنسان بالكامل يتم حاليًا استخدام الأجسام المضادة أحادية النسيلة لإنتاج أجسام مضادة أحادية النسيلة مضادة لـ SARS-CoV-2 (فيروس كورونا) لعلاج COVID-19.

أصبح من الواضح بشكل متزايد أن لقاحات فيروس كورونا ليست فعالة ضد المتغير المكتشف حديثًا من الفيروس كما كان العلماء يأملون. مع كل يوم من تطور وباء فيروس كورونا ، تصبح الحاجة الماسة إلى علاجات نشطة متعددة أكثر وضوحًا. ENZC هي شركة رائدة في استخدام الأجسام المضادة وحيدة النسيلة لعلاج COVID-19. حددت ENZC مؤخرًا أحد عشر موقعًا محفوظًا وغير قابل للتغيير (حواتم) على فيروس كورونا الذي ينتج ضده أجسامًا مضادة وحيدة النسيلة مضادة لـ SARS-CoV-2. باستخدام تحليل الكمبيوتر (الذكاء الاصطناعي [AI]) ، قام فريق الشركة & # 8217 لعلم الوراثة والبيولوجيا الجزيئية بفحص أكثر من 50،512 عزلة معروفة حاليًا لفيروس كورونا وحدد المواقع المحفوظة التي من المتوقع أن تكون غير قابلة للتغيير. تم تحديد التسلسلات 11 المحفوظة التي تم تحديدها على عزلات الفيروس المنسقة على أساس أنها 98.71٪ إلى 99.29٪ محفوظة على إجمالي 50512 عزلة من فيروس كورونا التي تم تحليلها. قدمت الشركة طلب براءة اختراع شامل يغطي هذه الاكتشافات.

Enzolytics، Inc. هي شركة لتطوير الأدوية ملتزمة بتسويق البروتينات الخاصة بها لعلاج الأمراض المعدية المنهكة. قامت ENZC ببناء محفظة للملكية الفكرية بشكل سريع حيث قدمت العديد من براءات الاختراع في العام الماضي. في الآونة الأخيرة ، في الشهر الماضي ، أفادت الشركة بأنها تلقت إيصال التسجيل الرسمي من مكتب براءات الاختراع الأمريكي يؤكد تقديم طلب براءة الاختراع الخاص بها لـ "البروتينات النووية المعزولة من العامل المناعي للحبل الشوكي في الثدييات - التركيب الصيدلاني للعلاج". منذ أن قدمت ENZC عددًا من الطلبات الجديدة. اندمجت الشركة مؤخرًا مع شركة BioClonetics Immunotherapeutics ، Inc. ، وهي الآن شركة فرعية مملوكة بالكامل لشركة Enzolytics a Dallas and College Station ، تكساس للتكنولوجيا الحيوية مع تكنولوجيا خاصة لإنتاج أجسام مضادة وحيدة النسيلة بشرية بالكامل (mAbs) ضد الأمراض المعدية.

تقوم شركة Microcapdaily بالإبلاغ عن ENZC اندماج BioColnetics منذ البداية توضح Recenlty: & # 8220 Enzolytics Inc. ENZC: تقوم بخطوة شديدة الانفجار لأعلى المخططات مؤخرًا تتجاوز 0.50 للسهم وتتجاوز بانتظام 25 مليون دولار أمريكي في اليوم من حيث الحجم بالدولار وقد تحولت ENZC إلى عداء دوري رئيسي في قبعات صغيرة. تمتلك Enzolytics وشركتها الفرعية الجديدة BioClonetics حقوق الترخيص لجزيء الببتيد البيبسين لا رجعة فيه لعلاج فيروس نقص المناعة البشرية / الإيدز ، ومن المتوقع أن تبلغ قيمة السوق 30 مليار دولار أمريكي بحلول عام 2025. تنتج الشركة أجسامًا مضادة وحيدة النسيلة مستهدفة (غير سامة) وتعمل الآن على تطوير نوعين منفصلين لكن منصات العلاج التكميلي لعلاج الأمراض المعدية واستهداف فيروس نقص المناعة البشرية وفيروس كورونا. اجتذبت Enzolytics فريقًا إداريًا رئيسيًا على مستوى الدوري وراءها ووسعت قدراتها المعملية في حرم جامعة Texas A & ampM في معهد الدراسات قبل السريرية ، حيث تنتج كلاً من الأجسام المضادة أحادية النسيلة الإضافية ضد فيروس نقص المناعة البشرية وضد فيروس كورونا. يسمح هذا التوسع لشركة Enzolytics بإكمال إنتاج الأجسام المضادة وحيدة النسيلة ضد كل من فيروس نقص المناعة البشرية وفيروس كورونا والتعاون مع خبراء الأدوية الحيوية في الحرم الجامعي. أبلغت Microcapdaily لأول مرة على ENZC في اليوم التالي للإعلان عن الاندماج في مقالتنا: "BioClonetics LOI Sparks Enzolytics Inc (OTCMKTS: ENZC)" في 16 سبتمبر عندما تم تداول ENZC بأقل من .01

اجتذبت Enzolytics سريعًا فريقًا قويًا وراءها يتحدث عن أشياء كبيرة قادمة إلى هنا. لقد قاموا مؤخرًا بتعيين رونالد موس ، دكتوراه في الطب ، في المجلس الاستشاري الطبي. كان السيد موس مديرًا تنفيذيًا في العديد من شركات التكنولوجيا الحيوية على مدار الـ 25 عامًا الماضية. لديه خبرة واسعة في الإدارة السريرية والتنظيمية في توجيه البرامج من خلال التجارب السريرية للمرحلة الأولى والثانية والثالثة ، بما في ذلك تجربة IND و NDA. أدار السيد هنري زابيلوف ، كبير مسؤولي العلوم في الشركة ورقم 8217s ، العديد من التجارب السريرية باستخدام البروتينات العلاجية. وهو مخترع العديد من براءات الاختراع الأمريكية المتعلقة بالعلاج المناعي لفيروس نقص المناعة البشرية والسرطان ومُحسِّن للمناعة استنادًا إلى منصة الشركة & # 8217s IPF.

لمعرفة التفاصيل الداخلية على ENZC اشترك في Microcapdaily.com الآن عن طريق إدخال بريدك الإلكتروني في المربع أدناه

يقود الشركات المندمجة حديثًا الرئيس التنفيذي والمساهم الأكبر تشارلز س. كوتروبيا ، وهو محامي مشهور للملكية الفكرية تقاضى أكثر من 200 براءة اختراع في حياته المهنية وعمل كمستشار رئيسي في العديد من نزاعات براءات الاختراع البارزة التي تم رفعها في المحاكم الفيدرالية وبراءات الاختراع الأمريكية ومكتب العلامات التجارية. أسس السيد كوتروبيا BioCLonetics مع شقيقه الدكتور جوزيف كوتروبيا ، الذي ابتكر طريقة ملكية BioCLonetics لإنشاء خطوط الخلايا البشرية التي تنتج أجسامًا مضادة بشرية موجهة ضد العديد من الأمراض المعدية. تم إثبات خلية واحدة (تم تحديدها باسم CLONE 3) في اختبارات متعددة و 5 دراسات مستقلة لتحييد فيروس نقص المناعة البشرية في 98 ٪ من جميع الأصناف المعروفة في جميع أنحاء العالم.

قبل عدة أسابيع ، نفذت الشركة النظام الأساسي لتشكيل شركاء طبيين دوليين (& # 8220IMPL & # 8221) شركة بلغارية محدودة المسؤولية تمتلك الشركة 50٪ منها. الشركة وشركاء # 8217s في IMBL هم مجموعة من رجال الأعمال البلغاريين الناجحين الذين سيمولون تكلفة التجارب السريرية بموجب معايير وكالة الطب الأوروبية (& # 8220EMA & # 8221) وتكلفة طلب تصريح EMA للشركة & # 8217s علاجات ITV-1 الحاصلة على براءة اختراع لعلاج فيروس نقص المناعة البشرية. بموجب اتفاقية الاعتراف المتبادل (& # 8220MRA & # 8221) بين EMA وإدارة الأدوية الفيدرالية الأمريكية (& # 8220FDA & # 8221) ، تعتقد الشركة أن إصدار تصريح EMA لمجمع ITV-1 يجب أن يؤهل ENZC & # 8217s للاعتراف من قبل إدارة الغذاء والدواء. دخلت IMBL في مفاوضات لإشراك تصميم العيادة لبدء التجارب السريرية التي قد تكون مطلوبة بموجب معايير EMA. مع تقدم الشركة في جهودها لتسويق جميع الفرص الحالية والتي لم يتم اكتشافها بعد من علاجاتها المرخصة والحاصلة على براءة اختراع ، فإن إضافة IMBL وفوائد الحصول على تصريح EMA قد فتحت طرقًا جديدة ومثيرة لنمو ENZC و الزيادة المحتملة المصاحبة في القيمة لمساهميها.

تجري عمليات تدقيق البيانات المالية للسنة الحالية والسابقة للشركة ، ويتم إعداد طلب OTCQB لتقديمه عند إصدار البيانات المدققة. تخطط الشركة لإكمال التدقيق لمدة عامين في أسرع وقت ممكن ، ولكنها ستقدم البيانات المالية للتقرير السنوي في 31 ديسمبر 2021 وفقًا لإرشادات الإفصاح الأساسي الوردي للأسواق خارج البورصة. تتوقع الشركة تقديم البيانات المالية بموجب إرشادات الإفصاح الأساسية ليوم 31 ديسمبر 2020 في الأسابيع المقبلة قبل الموعد النهائي للإيداع في 31 مارس 2021.

حدد ENZC مؤخرًا أحد عشر موقعًا محفوظًا ومن المتوقع أن يكون غير قابل للتغيير (حواتم) على فيروس كورونا الذي ينتج ضده أجسامًا مضادة وحيدة النسيلة مضادة لـ SARS-CoV-2. باستخدام تحليل الكمبيوتر (الذكاء الاصطناعي [AI]) ، قام فريق الشركة وعلم الوراثة والبيولوجيا الجزيئية بفحص أكثر من 50،512 عزلًا معروفًا حاليًا لفيروس كورونا وحدد المواقع المحفوظة التي من المتوقع أن تكون غير قابلة للتغيير. تم تحديد التسلسلات 11 المحفوظة التي تم تحديدها على عزلات الفيروس المنسقة على أساس أنها 98.71٪ إلى 99.29٪ محفوظة على إجمالي 50512 عزلة لفيروس كورونا التي تم تحليلها.

قدمت ENZC طلب براءة اختراع شامل يغطي هذه الاكتشافات. تم إيداع هذا الطلب الأولي في الولايات المتحدة وسيتم تمديده للمطالبة بتغطية براءات الاختراع الدولية من خلال المعاهدة الدولية للتعاون بشأن البراءات (PCT) التي انضمت إليها 153 دولة. تشمل تغطية براءات الاختراع المطلوبة مطالبات براءات الاختراع بشأن الحاتمة / المستضدات المكتشفة ، ومطالبات اللقاح ، ومطالبات الأجسام المضادة ، والمطالبات ذات الصلة بالطرق الوقائية / العلاجية المتعلقة بالحلمة / المستضدات.

Before completing the Artificial Intelligence analysis of the 50,512 SARS-CoV-2 isolates to identify conserved epitopes, the Company’s scientists predicted a specific target epitope that is correlative in structure to the site on the HIV virus to which the Company has produced a monoclonal antibody that has been shown to neutralize the HIV virus. The prediction was that this site would be conserved as is the correlative site on the HIV virus. The AI analysis of the 50,512 SARS-CoV-2 isolates identified this predicted site on the virus as 99% conserved across all 50,512 isolates. This primary site on the SARS-CoV-2 virus has also been confirmed as existing (100%) in the U.S. SARS-CoV-2 virus and the virus variants which have surfaced in United Kingdom, Brazil and South Africa, which are now in the U.S. This epitope on the SARS-Cov-2 virus is included in the first being targeted by the Company in its production of epitope specific monoclonal antibodies. The Company’s focus is on producing monoclonal antibodies that target immutable sites to avoid “virus escape”.

In addition to patenting Company’s findings of conserved sites on the SARS-CoV-2 (Coronavirus), the Company is also filing patent applications covering the conserved sites on the HIV virus. Filings will be made in the U.S. Patent Office and then extended for international coverage through the PCT covering 153 countries.

As the Company has previously reported, it is also curating (analyzing) the amino acid sequences of other major viruses and will file patent applications claiming the identified antigens/epitopes and associated therapeutics. Using AI analysis, the Company is now identifying and will claim the conserved epitopes/antigens on the infectious diseases caused by HIV-2, Influenza A and B, H1N1 influenza, Respiratory syncytial virus (RSV), Small-Pox, Ebola Virus, Tetanus, Diphtheria, HTLV-1/2, Rabies, Herpes zoster, Varicella zoster, Anthrax, Mason-Pfizer monkey virus (MPMV), Visna virus (VISNA) and mouse mammary tumor virus (MMTV). Patent applications will be filed claiming the inventive findings. Patent claims will cover the discovered epitope/antigens, with proposed vaccine claims, antibody claims, and related prophylactic/therapeutic method claims relating to these identified epitope/antigens.

For more on ENZC Subscribe Right Now!

Enzolytics , Inc. (ENZC) is rocketing up the charts on a powerful surge of 10s of millions of dollar volume daily since a brief dip below the .25 mark on Thursday. ENZC is a major league runner and powerhouse stock over the past few months ENZC has seen a legendary run to recent highs of 0.958 per share as it completes the historic merger between BioClonetics and Enzolytics the new biotech is getting noticed as its technology for producing fully human monoclonal antibodies is currently being employed to produce anti-SARS-CoV-2 ( CoronaVirus ) monoclonal antibodies for treating COVID-19. It is becoming increasingly evident that Coronavirus vaccines are not as effective against newly discovered variant of the virus as scientists had hoped. With each day of progression of the Coronavirus pandemic, the dire need for multiple active therapeutics becomes more evident. ENZC is a pioneer in using monoclonal antibodies for treating COVID-19. Recently ENZC has identified eleven conserved, expectedly immutable sites (epitopes) on the Coronavirus against which it is producing targeted anti-SARS-CoV-2 monoclonal antibodies. Using computer analysis (Artificial Intelligence [AI]), the Company’s genetics and molecular biology data science team has now screened more than 50,512 Coronavirus isolates currently known and has identified conserved sites which expectedly are immutable. The 11 conserved sequences identified on the virus isolates curated have been identified on the basis that they are 98.71% to 99.29% conserved over the entirety of the 50,512 Coronavirus isolates analyzed. The Company has filed a comprehensive patent application covering these discoveries. Since a brief dip Investors are looking for a powerhouse move back to recent highs a break over .91 and its an all-out blue-sky breakout We will be updating on ENZC when more details emerge so make sure you are subscribed to Microcapdaily so you know what’s going on with ENZC.


كشف

كشف is typically achieved using one of two methods: (a) colorimetric or enzyme-mediated detection and (b) fluorescence-based detection.

في ال colorimetric method, the bound primary or secondary antibody is conjugated to a substrate which yields a precipitating product when converted by an enzyme. This precipitate is visible as colored staining when viewed by light microscopy.

في ال fluorescence-based detection method, antibody bound to the antigen of interest in the tissue is directly or indirectly conjugated to a fluorophore (also sometimes called a fluorochrome), a molecule that fluoresces in the presence of light of a specific wavelength.


Vaccine Ingredients

Injecting something into your body can be concerning for some, especially when you're unsure of what's inside the needle. We're here to take the mystery out of a vaccine's ingredients.

A vaccine contains a part of a germ (bacteria or virus) that is called an antigen. The antigen has already been killed or disabled before it's used to make the vaccine, so it can't make you sick. Antigens are substances, often a protein, that stimulate the body to produce an immune response to protect itself against attacks from future actual disease exposure. In addition, vaccines contain other ingredients that make them safer and more effective, including preservatives, adjuvants, additives and residuals of the vaccine production process. Because specific ingredients are necessary to make a vaccine, even though they are eventually removed, trace amounts can still remain. These residuals can include small amounts of antibiotics and egg or yeast protein. The American Academy of Pediatrics also provides a good explanation about what's inside the vaccine needle.

If you're a parent concerned that your child may be exposed to too many antigens, there's no need to worry: Today's vaccines contain far less antigens than in the past, thanks to advances in biomedical science. Additionally, children's bodies are well equipped to handle many antigens at the same time. A healthy baby can accommodate multiple vaccinations because vaccines, and the antigens they contain are designed for babies' immune systems. In fact, babies can handle significantly more antigens than those that are found in vaccines.

A few years ago, much attention was placed on thimerosal, an organic form of mercury (also called ethylmercury) that prevents vaccines from being contaminated. This form of mercury is different from methylmercury, which can damage the nervous system. Although thimerosal has been shown to be safe, now all routine childhood vaccines are produced in thimerosal-free form. This includes the flu vaccine.


How are Antibodies Produced?

How are Antibodies Produced?
Although detailed mechanics of the immune response are beyond the scope of this site, it is useful, in the context of developing a custom antibody, to have an overview of how antibodies are produced by the immune system.

When an organism’s immune system encounters a foreign molecule (typically a protein) for the first time, specialized cells such as macrophages and dendritic cells capture the molecule and begin breaking it down so that it can present these antigens to B cell lymphocytes.

Once Antigen Presentation to the B cell lymphocytes has occurred, a process known as Somatic Hypermutation allows the B cell to begin coding for a new antibody that will contain a unique Antigen Binding Site in the variable region that is capable of binding specifically to an epitope from the antigen.

Each B cell lymphocyte produces one unique antibody against one unique epitope.

Once antibodies with sufficient specificity to the epitope can be encoded, the B cell begins to release antibodies into the bloodstream. These antibodies then bind specifically with the foreign molecule and allow the immune system to eliminate the molecule from the system.

In some cases, these antibodies can disable pathogens such as viruses directly due to the binding action. In other cases, such as with bacterial pathogens, these antibodies bind to surface proteins on the bacterium’s surface, thereby signaling to the rest of the immune system that the pathogen should be destroyed.

After the foreign molecule has been eliminated, B cells remain in the bloodstream ready to produce antibodies if the antigen is encountered again.

From the perspective of developing a custom antibody against a protein antigen, the immune system captures the protein, breaks it down into individual epitopes and presents these epitopes to the B cells so that development of antibodies specific to those epitopes can begin. These antibodies can then be collected directly in the serum or by isolating the individual B cells that produce antibody against the epitope of interest. With a full-length protein antigen, there will typically be multiple B cells generating antibodies against multiple epitopes from different regions of the protein.


2. MATERIALS AND METHODS

2.1. Sequence alignment of 66 epitopes in IEDB database to SARS𠄌oV𠄂 spike protein

We downloaded the spike protein amino acid sequence of SARS𠄌oV𠄂 isolate Wuhan‐Hu𠄁 from GenBank (GenBank ID: <"type":"entrez-protein","attrs":<"text":"QHD43416.1","term_id":"1791269090","term_text":"QHD43416.1">> QHD43416.1). The sequences of the 66 epitopes containing pentapeptides of SARS𠄌oV𠄂 spike protein were from Lucchese G's report and checked in the IEDB database. 4 Then, the sequences of these epitopes were aligned with the amino acid sequence of SARS𠄌oV𠄂 spike protein to obtain 66 peptides at the corresponding sequence position of SARS𠄌oV𠄂 spike protein, which might be candidate epitopes of a vaccine.

2.2. Detection of nonsynonymous mutation sites of SARS𠄌oV𠄂 spike protein

As nonsynonymous mutation sites in the viral amino acid sequence may affect the recognition of vaccine antigens, vaccine candidate antigens are generally more inclined to choose conservative sequences. 7 , 8 Therefore, the inclusion of mutation sites in candidate epitopes of SARS𠄌oV𠄂 should be avoided as much as possible. We searched the 2019 Novel Coronavirus Resource (2019nCoVR, https://bigd.big.ac.cn/ncov) from the China National Center for Bioinformation (CNCB) to obtain high‐quality genomic data of SARS𠄌oV𠄂 clinical isolates. A total of 1218 isolates from 34 countries around the world sampled from June 1, 2020 to June 30, 2020 were selected for analysis. The detailed countries are shown in Table S1. We focused on counting nonsynonymous mutations that cause amino acid changes in spike protein single‐nucleotide polymorphism (SNPs). The amino acid sites with nonsynonymous mutations that appeared twice or more in 1218 isolates were considered to be easily mutated. The obtained 66 peptides of SARS𠄌oV𠄂 spike protein were checked for the presence of the easily mutated amino acid sites, and peptides containing the easily mutated sites should be noted in subsequent screening.

2.3 Screening candidate vaccine epitopes in spike protein

The immune protective antigens in the peptides of SARS𠄌oV𠄂 spike protein were predicted using immunoinformatics tool Vaxijen v2.0, 9 the toxic peptides were predicted using ToxinPred 10 and the allergenic peptides were predicted using AllergenFP v.1.0. 11 The ability of the epitopes to induce interferon‐γ (IFN‐γ), interleukin𠄄 (IL𠄄), and IL� secretion was predicted using IFNepitope, 12 IL4Pred, 13 and IL�Pred, 14 respectively. The peptides with nonantigenic protection, toxicity, or allergenicity were removed, and the remaining peptides were used as antigen epitopes for subsequent screening. The solvent accessibility of each amino acid of spike protein (template 6xr8.1 15 ) was predicted by SWISS‐MODEL 16 to screen the epitopes that were more likely to be exposed on the surface of the spike protein. ABCpred 17 and IEDB Bepipred Linear Epitope Prediction 2.0 18 were used to predict B�ll epitopes. NetMHC 4.0 Sever, 19 Rankpep, 20 ਊnd SYFPEITHI 21 were used to predict T�ll epitopes and HLA molecules. As different HLA types are expressed at dramatically different frequencies in different ethnicities, 22 after obtaining the results of HLA class I and class II molecules recognized by these epitopes, we predicted the coverage rate of each epitope in different populations using Population Coverage in IEDB Analysis Resource. 22 Although some epitopes contained easily mutated sites, some of them might be strong neutralizing epitopes which might induce strong protections and should also be considered in vaccine design. Therefore, according to the above analysis, the selected vaccine candidate epitopes for SARS𠄌oV𠄂 were predicted to be relatively conservative, immunoprotective, nontoxic, and nonallergenic,ਊnd਌ould promote the secretion of cytokines and more likely to be exposed on the surface of the spike protein. They were both B‐ and T�ll epitopes, which could identify a certain number of HLA molecules and had high coverage rates in different populations.

2.4 Acquisition, analysis, and screening of vaccine candidate sequences

The selected vaccine candidate epitopes were connected by different linkers (no linker, GGGGS, GGGSGGG, EAAAK, GPGPG, AAY, and KK, respectively) to obtain vaccine candidate sequences. Bioinformatics tools were used to analyze and screen the vaccine candidate sequences. PredictProtein was used to predict the amino acid composition, secondary structure composition, solvent accessibility, and gene ontology terms of the candidate sequences. 23 The flexibility and antigenic index of the candidate sequences were predicted using DNAStar software. 24 Expasy ProtParam tool was used to predict the half‐life and stability of the candidate proteins. 25 Finally, through a comprehensive analysis, the best candidate vaccine sequences were selected and will be prepared into vaccines and their immune effects verfied through animal experiments.


NIH Scientists Identify Atomic Structure of Novel Coronavirus Protein

The atomic-level structure of the SARS-CoV-2 spike protein in its prefusion conformation. The receptor binding domain, the part of the spike that binds to the host cell, is colored green.

The atomic-level structure of the SARS-CoV-2 spike protein in its prefusion conformation. The receptor binding domain, the part of the spike that binds to the host cell, is colored green.

NIAID scientists working with investigators from the University of Texas at Austin (UT) identified the atomic structure of an important protein on the surface of the novel coronavirus (SARS-CoV-2, formerly called 2019-nCoV). The findings appear in the peer-reviewed journal علم. The authors note that the findings will aid in the design of candidate vaccines and the development of treatments for COVID-19, the disease caused by the new virus, which was first identified in China in December 2019.

Like other coronaviruses, SARS-CoV-2 particles are spherical and have mushroom-shaped proteins called spikes protruding from their surface, giving the particles a crown-like appearance. The spike binds and fuses to human cells, allowing the virus to gain entry. However, coronavirus infection can be prevented or slowed if this process is disrupted.

Scientists in China shared the genome of a SARS-CoV-2 virus isolate to a global database, which NIAID and UT experts used to start their work determining the spike structure. The spike undergoes a massive rearrangement as it fuses the virus and cell membranes. The researchers confirmed that the original spike stabilized in its prefusion conformation is more likely to preserve targets for infection-blocking antibodies induced by a vaccine.

Importantly, the new data supports NIAID’s approach to a gene-based vaccine for COVID-19 and will also be useful in other vaccine approaches including protein-based vaccines and other nucleic acid or vector-based delivery approaches. NIAID scientists designed the stabilized spike antigen based on previous knowledge obtained from studying other coronavirus spike structures. NIAID and the biotechnology company Moderna, based in Cambridge, Massachusetts, are developing a messenger RNA (mRNA) vaccine, which directs the body’s cells to express the spike in its prefusion conformation to elicit an immune response.

The new research also confirms that the structure of the SARS-CoV-2 spike is very similar to that of the coronavirus responsible for the global outbreak of severe acute respiratory syndrome in 2003 that was eventually contained (known as SARS-CoV). However, despite the similarities, the paper shows that some monoclonal antibodies developed to target SARS-CoV do not bind to the new coronavirus, indicating that antibodies that recognize the SARS-CoV from 2003 will not necessarily be effective in preventing or treating COVID-19, the disease caused by the new virus.

Recent reports show that the novel virus and SARS-CoV also bind to the same receptor on the host cell. However, NIAID and UT scientists determined that SARS-CoV-2 binds more easily to this receptor as compared to SARS-CoV, which could potentially explain why SARS-CoV-2 appears to spread more efficiently from human-to-human. However, more data is needed to investigate this possibility, the authors note.

This research was supported by the NIAID Intramural Research Program and a NIAID grant to the University of Texas at Austin (R01-AI127521).


شاهد الفيديو: كيف يعمل الجهاز المناعى. طرق تقويته وتدعيمه (قد 2022).