معلومة

ما الذي يساهم في تباين تسلسل البروتين عبر الأنواع المختلفة؟

ما الذي يساهم في تباين تسلسل البروتين عبر الأنواع المختلفة؟


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

ما الذي يساهم في تباين تسلسل البروتين عبر الأنواع المختلفة (مثل النمط الظاهري ، البيئة ، الضغط التطوري) وكيف تساهم هذه العوامل في التباين؟

لقد حاولت البحث باستخدام google + google scholar لكنهم يعرضون عمومًا أوراقًا تناقش لماذا وكيف يتم حفظ البروتين عبر الأنواع بدلاً من سبب / كيف تباعد البروتين عبر الأنواع. الرجاء مساعدتي في هذا الأمر والمراجع / المصادر مهمة جدًا ومحل تقدير كبير. شكرا لك!

مثال لتوضيح سؤالي. الجين CD81 ليس متطابقًا بين الإنسان والشمبانزي والجرذان والدجاج بناءً على مصفوفة الهوية هذه من ClustalW2. لماذا CD81 غير متطابق في جميع الأنواع؟ ما هي العوامل التي تسبب الاختلاف في CD81s؟ كيف تسبب هذه العوامل (مثل الضغط التطوري)؟ # #

مصفوفة الهوية المئوية - تم إنشاؤها بواسطة Clustal2.1

# #

1: sp | P60033 | CD81_HUMAN 100.00 100.00 93.22 82.55 2: sp | P60034 | CD81_PANTR 100.00 100.00 93.22 82.55 3: sp | Q62745 | CD81_RAT 93.22 93.22 100.00 82.55 4: tr | F1NW06 | F1NW06_CH5 82.55 82.55

لقد وجدت إجابة مقبولة لسؤالي. فقط انشر هنا إذا كان هناك أي اهتمام به. عفوا لغتي الإنجليزية.

مصدر:

ني وآخرون آل. 2010. النظرية المحايدة للتطور الجزيئي في العصر الجينومي. Annu. القس جينوم. الجينات البشرية.

يتسبب التطور والطفرة النقطية في اختلاف تسلسل نفس البروتين الوظيفي عبر الأنواع. تُظهر النظرية المحايدة للتطور الجزيئي أن مستوى الانتواع للتطور هو تراكم للمستوى الجزيئي للتطور المحايد. في التطور المحايد ، تحدث الطفرة فقط في نطاق الطفرة النقطية بالتسلسل بالطريقة التي يتم بها الاحتفاظ بوظيفة البروتين. مع مرور الوقت ، يحدث الانتواع ولكن الوظيفة التي يؤديها هذا البروتين المحدد لا تزال ضرورية ويتم الحفاظ عليها عبر الأنواع. الاختلاف في تسلسل البروتين لنفس البروتين الوظيفي هو بقايا طفرة نقطية عشوائية.


أود أن أجادل في استنتاجك بأنه مجرد تطور محايد. يحدث التغيير المحايد بالتأكيد ولكنه ليس إجابة كاملة على سؤالك. لا توجد بروتينات مماثلة في كائنات مختلفة في نفس البيئة ونادرًا ما تفعل الشيء نفسه تمامًا.

على سبيل المثال ، سيكون لدى الثدييات الثلاثة درجات حرارة جسم متشابهة ولكن ليست متطابقة بينما ستكون درجة حرارة جسم الدجاج أعلى قليلاً عند 42 درجة. تعتمد كفاءة الإنزيم بشكل كبير على درجة الحرارة ، لذا من المحتمل أن يُعزى بعض الاختلاف إلى الوظيفة المثلى في درجات حرارة مختلفة. لا أعرف أي شيء عن CD81 تحديدًا ، لكن غالبًا ما تكون مسارات تنظيم الجينات متشابهة ، ولكنها ليست متطابقة ، بين الكائنات الحية بحيث قد تجد أنها بحاجة إلى التفاعل مع بروتينات مختلفة قليلاً بطريقة مختلفة قليلاً.


ما الذي يساهم في تباين تسلسل البروتين عبر الأنواع المختلفة؟ - مادة الاحياء

ما الذي يساهم في تباين تسلسل البروتين عبر الأنواع المختلفة (مثل النمط الظاهري ، البيئة ، الضغط التطوري) وكيف تساهم هذه العوامل في التباين؟

لقد حاولت البحث باستخدام google + google scholar لكنهم يعرضون عمومًا أوراقًا تناقش لماذا وكيف يتم حفظ البروتين عبر الأنواع بدلاً من سبب / كيف تباعد البروتين عبر الأنواع. الرجاء مساعدتي في هذا الأمر والمراجع / المصادر مهمة جدًا ومحل تقدير كبير. شكرا لك!

مثال لتوضيح سؤالي. الجين CD81 ليس متطابقًا بين الإنسان والشمبانزي والجرذان والدجاج بناءً على مصفوفة الهوية هذه من ClustalW2. لماذا CD81 غير متطابق في جميع الأنواع؟ ما هي العوامل التي تسبب الاختلاف في CD81s؟ كيف تسبب هذه العوامل ذلك (مثل الضغط التطوري)؟
#
#
# مصفوفة الهوية المئوية - تم إنشاؤها بواسطة Clustal2.1
#
#

1: sp | P60033 | CD81_HUMAN 100.00 100.00 93.22 82.55
2: sp | P60034 | CD81_PANTR 100.00 100.00 93.22 82.55
3: sp | Q62745 | CD81_RAT 93.22 93.22 100.00 82.55
4: tr | F1NW06 | F1NW06_CHICK 82.55 82.55 82.55 100.00


احصل على إشعارات عندما يكون لدينا أخبار أو دورات أو أحداث تهمك.

بإدخال بريدك الإلكتروني ، فإنك توافق على تلقي اتصالات من Penn State Extension. عرض سياسة الخصوصية.

شكرا لتقريركم!

الإرهاب الزراعي: تهديد للزراعة الحيوانية في الولايات المتحدة

مقالات

دليل بنسلفانيا لصحة الألبان والأمن الحيوي

أدلة ومنشورات

باستخدام مقياس انكسار بركس

أشرطة فيديو

الإجهاد الحراري في عجول الألبان

مقالات

التنميط الأيضي

مقالات

تحليل البيانات استكشافية

في هذا القسم ، سوف نستكشف الميزات المحددة ونتصورها ونحاول فهمها. البيانات المعطاة مقسمة بالفعل إلى 3 مجلدات ، أي تدريب وتطوير واختبار باستخدام تقسيم عشوائي.

أولاً ، دعنا نحمِّل مجموعات بيانات التدريب والصمام والاختبار.

أحجام المجموعات المعطاة هي كما يلي:

ملاحظة: لقد فكرت في بيانات أقل بسبب القوة الحسابية المحدودة. ومع ذلك ، يمكن أيضًا أن يكون الحل نفسه مقياسًا لمجموعة بيانات Pfam بأكملها.


& ltp> يوفر هذا القسم معلومات عن موقع وطوبولوجيا البروتين الناضج في الخلية. & ltp> & lta href = '/ help / subcellular_location_section' target = '_ top'> المزيد. & lt / a> & lt / p> الموقع الخلوي أنا

السيتوبلازم والعصارة الخلوية

التأكيد اليدوي على أساس التجربة في i

غشاء بلازمي

التأكيد اليدوي المستنتج من تشابه التسلسل مع i

التأكيد اليدوي المستنتج من تشابه التسلسل مع i

العصارة الخلوية
غشاء بلازمي
مواقع أخرى
    المصدر: UniProtKB & # xd & ltp> مستنتج من الفحص المباشر & lt / p> & # xd & # xd & ltp> يستخدم للإشارة إلى فحص مباشر للوظيفة أو العملية أو المكون الذي يشير إليه مصطلح GO. & lt / p> & # xd & #xd & ltp> مزيد من المعلومات في & lta href = "http://geneontology.org/page/guide-go-evidence-codes#ida"> دليل كود دليل GO & lt / a> & lt / p> & # xd مستنتج من Direct فحص أنا

      الكلمات الرئيسية - المكون الخلوي ط


      يحدد هذا المجال سيرين الببتيدات التي تنتمي إلى MEROPS peptidase family S9 (clan SC) ، الفئة الفرعية S9B (dipeptidyl-peptidase IV). تشبه طية البروتين في مجال الببتيداز لأفراد هذه العائلة تلك الموجودة في سيرين كاربوكسي ببتيداز D ، وهو مثال من نوع العشيرة SC. هذا المجال هو محاذاة المنطقة إلى الجانب N-terminal من الموقع النشط ، الموجود في INTERPRO.

      يُطلق على Dipeptidyl-peptidase IV (EC) أيضًا اسم بروتين ارتباط أدينوزين ديميناز (بروتين ربط ADA) أو CD26. ينشق exopeptidase من N-terminal X-Pro أو X-Ala dipeptides من polypeptides (نشاط dipeptidyl peptidase IV). إنه بمثابة جزيء التكلفة في تنشيط الخلايا التائية وهو علامة مرتبطة بأمراض المناعة الذاتية ونقص ديميناز الأدينوزين والتسبب في الإصابة بفيروس نقص المناعة البشرية [PUBMED: 1352530 ، PUBMED: 20959412 ، PUBMED: 21856036].

      هذا هو المواد التي سوف تستخدم

      يتم توفير التعيين بين Pfam و Gene Ontology بواسطة InterPro. إذا كنت تستخدم هذه البيانات ، فيرجى الاستشهاد بـ InterPro.


      حلول NCERT للفئة 10 العلوم الفصل 9 الوراثة والتطور

      الفصل 9 - من المتوقع أن يكون للوراثة والتطور ما بين 1 إلى 3 علامات بناءً على الاتجاهات السنوية.

      ومع ذلك ، في عام 2018 ، تم طرح سؤال واحد فقط (فيما يتعلق بقوانين الميراث) في امتحان العلوم للصف العاشر. ولكن سيكون من الحكمة تعلم كل المفاهيم ذات الصلة لتجنب أي مفاجآت غير سارة.

      الموضوعات التي يتم تناولها في هذا الفصل هي:

      • قوانين الميراث
      • تجارب مندل
      • هجين أحادي الخلة
      • صليب ثنائي الهجين
      • التطور ونظرياته
      • دليل التطور

      عرض الخيارات

      نقوم بعمل مجموعة من المحاذاة لكل عائلة Pfam-A. يمكنك أن ترى وصفا لكل أعلاه. يمكنك عرض هذه المحاذاة بطرق مختلفة ولكن يرجى ملاحظة أن بعض أنواع المحاذاة لا يتم إنشاؤها أبدًا بينما البعض الآخر قد لا يكون متاحًا لجميع العائلات ، والأكثر شيوعًا هو أن المحاذاة كبيرة جدًا بحيث لا يمكن معالجتها.

      بذرة
      (225)
      ممتلىء
      (17067)
      البروتينات التمثيلية UniProt
      (27490)
      RP15
      (1496)
      RP35
      (8739)
      RP55
      (14110)
      75 روبية
      (18797)
      جالفيو رأي رأي رأي رأي رأي رأي رأي
      لغة البرمجة رأي
      PP / خريطة الحرارة 1

      1 لا يمكن إنشاء محاذاة PP / Heatmap للبذور التي لا تتوفر بيانات PP

      مفتاح: متوفرة، لم يتم إنشاؤه ، و [مدش] غير متوفر.


      & ltp> يوفر هذا القسم معلومات عن التركيب الرباعي للبروتين وعن التفاعل (التفاعلات) مع البروتينات أو معقدات البروتين الأخرى. & ltp> & lta href = '/ help / التفاعل_section' target = '_ top'> المزيد. & lt / a> & lt / p> التفاعل i

      & ltp> هذا القسم الفرعي من '& lta href = "http://www.uniprot.org/help/interaction٪5Fsection"> Interaction & lt / a>' القسم يوفر معلومات حول تفاعلات البروتين الثنائي. البيانات المقدمة في هذا القسم هي مجموعة فرعية مصفاة الجودة من التفاعلات الثنائية المشتقة تلقائيًا من & lta href = "https://www.ebi.ac.uk/intact/"> قاعدة بيانات IntAct & lt / a>. يتم تحديثه في كل & lta href = "http://www.uniprot.org/help/synchronization"> إصدار UniProt & lt / a>. & ltp> & lta href = '/ help / binary_interactions' target = '_ top'> المزيد. & lt / a> & lt / p> التفاعلات الثنائية i

      P60602

      قواعد بيانات تفاعل البروتين البروتين

      المستودع البيولوجي العام لمجموعات بيانات التفاعل (BioGRID)

      ComplexPortal: مورد منسق يدويًا للمجمعات الجزيئية

      قاعدة بيانات تفاعل البروتين ونظام التحليل

      قاعدة بيانات التفاعل الجزيئي

      STRING: شبكات رابطة البروتين الوظيفية

      قواعد بيانات متنوعة

      RNAct ، تنبؤات تفاعل البروتين والرنا للكائنات الحية النموذجية.


      & ltp> يوفر هذا القسم معلومات عن البنية الثانوية والثانوية للبروتين. & ltp> & lta href = '/ help / structure_section' target = '_ top'> المزيد. & lt / a> & lt / p> هيكل i

      الهيكل الثانوي

      & # xd & ltp> المعلومات المستخلصة من مجموعة من الأدلة التجريبية والحسابية ، بدون التحقق اليدوي. & lt / p> & # xd & # xd & ltp> & lta href = "/ manual / Evidences # ECO: 0000213"> المزيد. & lt / a> & lt / p> & # xd التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      التأكيد التلقائي المستنتج من مجموعة من الأدلة التجريبية والحاسوبية i

      قواعد بيانات الهيكلية ثلاثية الأبعاد

      مستودع SWISS-MODEL - قاعدة بيانات لنماذج هيكل البروتين ثلاثية الأبعاد المشروحة


      شاهد الفيديو: STATINI produžavaju život? Da, za 4 dana u prosekudr Bojana Mandić pregled naučnog istraživanja (قد 2022).